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Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor

ZART: A Novel Multiresolution Reconstruction Algorithm with Motion-blur Correction for Single Particle Analysis

  • Herreros D.
  • Kiska J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Filipovic J.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.

Journal of Molecular Biology - 1/1/2023

10.1016/j.jmb.2023.168088

Número de citas: 2 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 10,8 (2022)
  • SJR: 2,421 (2022)
  • SNIP: 1,281 (2022)

SPI-EM: Towards a tool for predicting CATH superfamilies in 3D-EM maps

  • Velazquez-Muriel, JA
  • Sorzano, COS
  • Scheres, SHW
  • Carazo, JM

Journal of Molecular Biology - 28/01/2005

10.1016/j.jmb.2004.11.005 Ver en origen

Número de citas: 23 (Web of Science) 22 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 8,5 (2020)
  • SJR: 4,147 (2005)
  • SNIP: 1,414 (2005)
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)

Comparison of single-particle analysis and electron tomography approaches: An overview

  • Jonic, S.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Boisset, N.

JOURNAL OF MICROSCOPY - 1/12/2008

10.1111/j.1365-2818.2008.02119.x Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 17 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2008)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,309 (2008)
  • CiteScore: 3,7 (2020)
  • SJR: 0,737 (2008)
  • SNIP: 1,028 (2008)
  • Categorías SJR: Histology (Q2); Pathology and Forensic Medicine (Q2)

Adjuvant-like effect of vaccinia virus 14K protein: A case study with malaria vaccine based on the circumsporozoite protein

  • Vijayan, Aneesh
  • Gomez, Carmen E.
  • Espinosa, Diego A.
  • Goodman, Alan G.
  • Sanchez-Sampedro, Lucas
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Zavala, Fidel
  • Esteban, Mariano
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JOURNAL OF IMMUNOLOGY - 15/06/2012

10.4049/jimmunol.1102492 Ver en origen

Número de citas: 9 (Web of Science) 9 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,52 (2012)
  • CiteScore: 9 (2020)
  • SJR: 4,011 (2012)
  • SNIP: 1,361 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,673
  • Categorías JCR: IMMUNOLOGY
  • Categorías SJR: Immunology (Q1)

Conservation Genetics of the Scalloped Hammerhead Shark in the Pacific Coast of Colombia

  • Quintanilla, Sonia
  • Gomez, Alberto
  • Marino-Ramirez, Camila
  • Sorzano, Carolina
  • Bessudo, Sandra
  • Soler, German
  • Bernal, Jaime E.
  • Caballero, Susana
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JOURNAL OF HEREDITY - 09/2015

10.1093/jhered/esv050 Ver en origen

Número de citas: 31 (Web of Science)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,075 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,931
  • Categorías JCR: GENETICS & HEREDITY
  • Categorías SJR: Biotechnology (Q1); Genetics (Q3); Genetics (clinical) (Q3); Molecular Biology (Q3)

New vaccinia virus promoter as a potential candidate for future vaccines

  • Di Pilato, Mauro
  • Mejias-Perez, Ernesto
  • Elena Gomez, Carmen
  • Perdiguero, Beatriz
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Esteban, Mariano

JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY - 1/12/2013

10.1099/vir.0.057299-0 Ver en origen

Número de citas: 22 (Web of Science) 18 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,529 (2013)
  • CiteScore: 7,3 (2020)
  • SJR: 1,764 (2013)
  • SNIP: 1,149 (2013)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,501
  • Categorías JCR: VIROLOGY
  • Categorías SJR: Virology (Q1)

Modification of promoter spacer length in vaccinia virus as a strategy to control the antigen expression

  • Di Pilato, Mauro
  • Sanchez-Sampedro, Lucas
  • Mejias-Perez, Ernesto
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Esteban, Mariano

JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY - 1/08/2015

10.1099/vir.0.000183 Ver en origen

Número de citas: 13 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 3,192 (2015)
  • CiteScore: 7,3 (2020)
  • SJR: 1,738 (2015)
  • SNIP: 1,01 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,131
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Virology (Q2)

Scipion-Chem: An Open Platform for Virtual Drug Screening

  • Del Hoyo D.
  • Salinas M.
  • Lomas A.
  • Ulzurrun E.
  • Campillo N.E.
  • Sorzano C.O.

Journal of Chemical Information and Modeling - 1/1/2023

10.1021/acs.jcim.3c01085

Número de citas:
  • CiteScore: 9,8 (2022)
  • SJR: 1,357 (2022)
  • SNIP: 1,379 (2022)

Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion

  • Martínez M.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Melero R.
  • Cuervo A.
  • Conesa P.
  • Del Caño L.
  • Fonseca Y.C.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Conesa J.J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro F.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Marabini R.
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Journal of Chemical Information and Modeling - 26/5/2020

10.1021/acs.jcim.9b01032

Número de citas: 16 (Web of Science) 8 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,956 (2020)
  • CiteScore: 6,4 (2020)
  • SJR: 1,24 (2020)
  • SNIP: 1,295 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,39
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Endosomal clathrin drives actin accumulation at the immunological synapse

  • Calabia-Linares, Carmen
  • Robles-Valero, Javier
  • de la Fuente, Hortensia
  • Perez-Martinez, Manuel
  • Martin-Cofreces, Noa
  • Alfonso-Perez, Manuel
  • Gutierrez-Vazquez, Cristina
  • Mittelbrunn, Maria
  • Ibiza, Sales
  • Urbano-Olmos, Francisco R.
  • Aguado-Ballano, Covadonga
  • Oscar Sanchez-Sorzano, Carlos
  • Sanchez-Madrid, Francisco
  • Veiga, Esteban
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JOURNAL OF CELL SCIENCE - 1/03/2011

10.1242/jcs.078832 Ver en origen

Número de citas: 58 (Web of Science) 54 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 6,111 (2011)
  • CiteScore: 6,9 (2020)
  • SJR: 4,778 (2011)
  • SNIP: 1,402 (2011)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,401
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Cell Biology (Q1)

Splines in Biomedical Image Processing

  • Jonic S.
  • Sorzano C.

Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011

10.1002/9783527635245.ch6

Número de citas: 3 (Scopus)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes

  • Devaux, Zaelle
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Jonic, Slavica
  • Conn, PM

Methods in Cell Biology - 1/1/2012

10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2012)
  • Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,908 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,932
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Clustering of biomedical scientific papers

  • Bravo-Alcobendas D.
  • Sorzano C.

WISP 2009: 6TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, PROCEEDINGS - 10/12/2009

10.1109/wisp.2009.5286530 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp

  • Scheres, SHW
  • Merino, AJ
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • IEEE Comp Soc

Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005

10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,194 (2005)
  • SNIP: 0,374 (2005)

Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows

  • Li M.
  • Xu G.
  • Sorzano C.
  • Melero R.
  • Bajaj C.

Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010

10.1109/bmei.2010.5639445

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management

Elastic image registration with applications to proteomics

  • Sorzano, C. O. S.
  • Thevenaz, P.
  • Valdes, I.
  • Beloso, A.
  • Unser, M.
  • Cristobal, G
  • Javidi, B
  • Vallmitjana, S
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INFORMATION OPTICS - 1/12/2006

10.1063/1.2361232 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 0,7 (2020)
  • SJR: 0,184 (2006)
  • SNIP: 0,204 (2006)

LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution

  • Ramirez-Aportela, E.
  • Vilas, J. L.
  • Carazo, J. M.
  • Sanchez Sorzano, C. O.

European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019

  • Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,888
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098380

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations

  • Kazemi, M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Georges, A. Des
  • Carazo, J. M.
  • Vargas, J.

Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098446

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

A fuzzy constraint satisfaction approach to identify and characterize apnea episodes

  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Félix P.
  • Álvarez M.
  • Zamarrón C.

2nd International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, iCBBE 2008 - 1/1/2008

10.1109/icbbe.2008.835

Número de citas: 2 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Biotechnology

Este autor no tiene patentes.

Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps.

  • Ramirez-Aportela E
  • Vilas JL
  • Melero R
  • Conesa P
  • Martinez M
  • Maluenda D
  • Mota J
  • Jimenez A
  • Vargas J
  • Marabini R
  • Carazo JM
  • Sorzano COS
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10/2018

10.1101/433284

  • ORCID

ENRICH: a fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M
  • Sorzano COS
  • Des Georges A
  • Carazo JM
  • Vargas J

08/2018

10.1101/400317

  • ORCID

Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

  • Vargas J
  • Melero R
  • Gomez-Blanco J
  • Carazo J
  • Sorzano COS

11/2016

10.1101/088062

  • ORCID

DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing

  • Ruben Sanchez Garcia
  • Josue Gomez-Blanco
  • Ana Cuervo
  • Jose Maria Carazo
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Javier Vargas

13/06/2020

10.1101/2020.06.12.148296

  • ORCID

NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice

  • Carlos Wert-Carvajal
  • Rubén Sánchez-García
  • José R Macías
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Almudena Méndez Pérez
  • Ramon Alemany
  • Esteban Veiga Chacón
  • Carlos Óscar S. Sorzano
  • Arrate Muñoz-Barrutia
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5/10/2020

10.1101/2020.10.05.327015

  • ORCID

Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19

  • Sorzano co
  • Crisman E
  • Carazo JM
  • leon r

15/07/2020

10.26434/chemrxiv.12652997.v1

  • ORCID

Statistical experiment design for animal research

  • Carlos Oscar S. Sorzano

2/06/2023

10.31219/osf.io/e9s25

  • ORCID

Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction

  • Almudena Mendez-Perez
  • Andres M Acosta-Moreno
  • Carlos Wert-Carvajal
  • Pilar Ballesteros-Cuartero
  • Ruben Sanchez-Garcia
  • Jose R Macias
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Ramon Alemany
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Arrate Munoz-Barrutia
  • Esteban Veiga
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22/11/2023

10.1101/2023.11.22.568042

  • ORCID
Open Access

ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Georges A.d.
  • Abrishami V.
  • Vargas J.

Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021

10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001

Número de citas: 2 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 0,859 (2020)
  • SNIP: 0,995 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,907
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Open Access

The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation

  • Tiziana Ginex
  • Clara Marco-Marín
  • Miłosz Wieczór
  • Carlos P. Mata
  • James Krieger
  • Maria Luisa López-Redondo
  • Clara Francés-Gómez
  • Paula Ruiz-Rodriguez
  • Roberto Melero
  • Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
  • Marta Martínez
  • Nadine Gougeard
  • Alicia Forcada-Nadal
  • Sara Zamora-Caballero
  • Roberto Gozalbo-Rovira
  • Carla Sanz-Frasquet
  • Jeronimo Bravo
  • Vicente Rubio
  • Alberto Marina
  • Ron Geller
  • Iñaki Comas
  • Carmen Gil
  • Mireia Coscolla
  • Modesto Orozco
  • José Luis Llácer
  • José-Maria Carazo
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PLoS Pathogens - 7/12/2021

10.1371/journal.ppat.1010631

Número de citas: 8 (Web of Science)
  • Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
  • CiteScore: 10,5 (2021)
  • SJR: 2,596 (2021)
  • SNIP: 1,618 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 7,913
  • Categorías JCR: VIROLOGY

Scopus: 36

Web of Science: 42

Scopus: 129

Web of Science: 163

Última actualización de los datos: 8/06/24 8:48
Próxima recolección programada: 15/06/24 3:00