RDF/XML JSON-LD N3/Turtle RDF/JSON

Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor

Translocation dynamics of sorting nexin 27 in activated T cells

  • Rincon, Esther
  • Saez de Guinoa, Julia
  • Gharbi, Severine I.
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Carrasco, Yolanda R.
  • Merida, Isabel

JOURNAL OF CELL SCIENCE - 1/03/2011

10.1242/jcs.072447 Ver en origen

Número de citas: 45 (Web of Science) 44 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 6,111 (2011)
  • CiteScore: 6,9 (2020)
  • SJR: 4,778 (2011)
  • SNIP: 1,402 (2011)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,401
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Cell Biology (Q1)
Open Access

Cryo-EM structure of Shiga toxin 2 in complex with the native ribosomal P-stalk reveals residues involved in the binding interaction

  • Arkadiusz W. Kulczyk
  • Carlos Oscar S. Sorzano
  • Przemysław Grela
  • Marek Tchórzewski
  • Nilgun E. Tumer
  • Xiao-Ping Li

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY - 1/12/2022

10.1016/j.jbc.2022.102795

Número de citas: 5 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,8 (2022)
  • CiteScore: 9,2 (2022)
  • SJR: 1,805 (2022)
  • SNIP: 1,122 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,8
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY

Safety and immunogenicity of a modified vaccinia Ankara-based HIV-1 vaccine (MVA-B) in HIV-1-infected patients alone or in combination with a drug to reactivate latent HIV-1

  • Mothe, Beatriz
  • Climent, Nuria
  • Plana, Montserrat
  • Rosas, Miriam
  • Luis Jimenez, Jose
  • Angeles Munoz-Fernandez, Maria
  • Puertas, Maria C.
  • Carrillo, Jorge
  • Gonzalez, Nuria
  • Leon, Agathe
  • Pich, Judit
  • Albert Arnaiz, Joan
  • Gatell, Jose M.
  • Clotet, Bonaventura
  • Blanco, Julia
  • Alcami, Jose
  • Martinez-Picado, Javier
  • Alvarez-Fernandez, Carmen
  • Sanchez-Palomino, Sonsoles
  • Guardo, Alberto C.
  • Pena, Jose
  • Benito, Jose M.
  • Rallon, Norma
  • Gomez, Carmen E.
  • Perdiguero, Beatriz
  • Garcia-Arriaza, Juan
  • Esteban, Mariano
  • Lopez Bernaldo de Quiros, Juan Carlos
  • Brander, Christian
  • Garcia, Felipe
  • RISVAC-03 Study Grp
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Journal of Antimicrobial Chemotherapy - 12/06/2014

10.1093/jac/dkv046 Ver en origen

Número de citas: 50 (Web of Science) 42 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,919 (2015)
  • CiteScore: 9,1 (2020)
  • SJR: 2,298 (2014)
  • SNIP: 1,765 (2014)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,093
  • Categorías JCR: INFECTIOUS DISEASES
  • Categorías SJR: Infectious Diseases (Q1); Pharmacology (Q1); Pharmacology (medical) (Q1)
Open Access

DeepRes: A new deep-learning- and aspect-based local resolution method for electron-microscopy maps

  • Ramírez-Aportela E.
  • Mota J.
  • Conesa P.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.

IUCrJ - 1/11/2019

10.1107/s2052252519011692

Número de citas: 34 (Web of Science) 15 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,401 (2019)
  • CiteScore: 6,9 (2019)
  • SJR: 1,735 (2019)
  • SNIP: 1,386 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,732
  • Categorías JCR: CRYSTALLOGRAPHY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Chemistry (miscellaneous) (Q1); Condensed Matter Physics (Q1); Materials Science (miscellaneous) (Q1)
Open Access

Deep Consensus, a deep learning-based approach for particle pruning in cryo-electron microscopy

  • Sanchez-Garcia, Ruben
  • Segura, Joan
  • Maluenda, David
  • Maria Carazo, Jose
  • Sorzano, Carlos Oscar S.

IUCrJ - 1/11/2018

10.1107/s2052252518014392 Ver en origen

Número de citas: 33 (Web of Science) 18 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2018)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,756 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,771 (2018)
  • CiteScore: 4,23 (2018)
  • SJR: 2,628 (2018)
  • SNIP: 1,593 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,434
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Chemistry (miscellaneous) (Q1); Condensed Matter Physics (Q1); Materials Science (miscellaneous) (Q1)

Approximating deformation fields for the analysis of continuous heterogeneity of biological macromolecules by 3D Zernike polynomials

  • Herreros D.
  • Lederman R.R.
  • Krieger J.
  • Jimenez-Moreno A.
  • Martinez M.
  • Myska D.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Bahar I.
  • Carazo J.M.
  • Sanchez C.O.S.
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IUCrJ - 1/11/2021

10.1107/s2052252521008903

Número de citas: 9 (Web of Science)
  • Factor Impacto JCR: 5,588 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,439
  • Categorías JCR: MATERIALS SCIENCE, MULTIDISCIPLINARY

Continuous flexibility analysis of SARS-CoV-2 spike prefusion structures

  • Melero R.
  • Sorzano C.O.S.
  • Foster B.
  • Vilas J.L.
  • Martínez M.
  • Marabini R.
  • Ramiacute;rez-Aportela E.
  • Sanchez-Garcia R.
  • Herreros D.
  • Del Caño L.
  • Losana P.
  • Fonseca-Reyna Y.C.
  • Conesa P.
  • Wrapp D.
  • Chacon P.
  • McLellan J.S.
  • Tagare H.D.
  • Carazo J.M.
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IUCrJ - 1/11/2020

10.1107/s2052252520012725

Número de citas: 33 (Web of Science) 15 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,769 (2020)
  • CiteScore: 8,1 (2020)
  • SJR: 2,832 (2020)
  • SNIP: 1,565 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,75
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
Open Access

Community recommendations on cryoEM data archiving and validation

  • Kleywegt G.J.
  • Adams P.D.
  • Butcher S.J.
  • Lawson C.L.
  • Rohou A.
  • Rosenthal P.B.
  • Subramaniam S.
  • Topf M.
  • Abbott S.
  • Baldwin P.R.
  • Berrisford J.M.
  • Bricogne G.
  • Choudhary P.
  • Croll T.I.
  • Danev R.
  • Ganesan S.J.
  • Grant T.
  • Gutmanas A.
  • Henderson R.
  • Bernard Heymann J.
  • Huiskonen J.T.
  • Istrate A.
  • Kato T.
  • Lander G.C.
  • Lok S.M.
  • Ludtke S.J.
  • Murshudov G.N.
  • Pye R.
  • Pintilie G.D.
  • Richardson J.S.
  • Sachse C.
  • Salih O.
  • Scheres S.H.W.
  • Schroeder G.F.
  • Sorzano C.O.S.
  • Stagg S.M.
  • Wang Z.
  • Warshamanage R.
  • Westbrook J.D.
  • Winn M.D.
  • Young J.Y.
  • Burley S.K.
  • Hoch J.C.
  • Kurisu G.
  • Morris K.
  • Patwardhan A.
  • Velankar S.
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IUCrJ - 1/3/2024

10.1107/s2052252524001246

Número de citas:

Higher resolution in cryo-EM by the combination of macromolecular prior knowledge and image-processing tools

  • Ramírez-Aportela E.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
  • Sun F.

Iucrj - 1/09/2022

10.1107/s2052252522006959

Número de citas:
  • Cuartil JCR: Q2 (2022)
  • Factor Impacto JCR: 3,9 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,4
  • Categorías JCR: MATERIALS SCIENCE, MULTIDISCIPLINARY

Three-dimensional reconstruction by Chahine's method from electron microscopic projections corrupted by instrumental aberrations

  • Zubelli, J.P.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C.O.S.
  • Herman, G.T.

INVERSE PROBLEMS - 1/08/2003

10.1088/0266-5611/19/4/310 Ver en origen

Número de citas: 13 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 3,7 (2020)
  • SJR: 0,796 (2003)
  • SNIP: 1,378 (2003)
  • Categorías SJR: Theoretical Computer Science (Q1); Applied Mathematics (Q2); Computer Science Applications (Q2); Signal Processing (Q2); Mathematical Physics (Q3)

Splines in Biomedical Image Processing

  • Jonic S.
  • Sorzano C.

Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011

10.1002/9783527635245.ch6

Número de citas: 3 (Scopus)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes

  • Devaux, Zaelle
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Jonic, Slavica
  • Conn, PM

Methods in Cell Biology - 1/1/2012

10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2012)
  • Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,908 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,932
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Clustering of biomedical scientific papers

  • Bravo-Alcobendas D.
  • Sorzano C.

WISP 2009: 6TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, PROCEEDINGS - 10/12/2009

10.1109/wisp.2009.5286530 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp

  • Scheres, SHW
  • Merino, AJ
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • IEEE Comp Soc

Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005

10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,194 (2005)
  • SNIP: 0,374 (2005)

Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows

  • Li M.
  • Xu G.
  • Sorzano C.
  • Melero R.
  • Bajaj C.

Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010

10.1109/bmei.2010.5639445

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management

Elastic image registration with applications to proteomics

  • Sorzano, C. O. S.
  • Thevenaz, P.
  • Valdes, I.
  • Beloso, A.
  • Unser, M.
  • Cristobal, G
  • Javidi, B
  • Vallmitjana, S
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INFORMATION OPTICS - 1/12/2006

10.1063/1.2361232 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 0,7 (2020)
  • SJR: 0,184 (2006)
  • SNIP: 0,204 (2006)

LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution

  • Ramirez-Aportela, E.
  • Vilas, J. L.
  • Carazo, J. M.
  • Sanchez Sorzano, C. O.

European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019

  • Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,888
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098380

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations

  • Kazemi, M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Georges, A. Des
  • Carazo, J. M.
  • Vargas, J.

Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098446

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

A fuzzy constraint satisfaction approach to identify and characterize apnea episodes

  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Félix P.
  • Álvarez M.
  • Zamarrón C.

2nd International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, iCBBE 2008 - 1/1/2008

10.1109/icbbe.2008.835

Número de citas: 2 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Biotechnology

Este autor no tiene patentes.

Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps.

  • Ramirez-Aportela E
  • Vilas JL
  • Melero R
  • Conesa P
  • Martinez M
  • Maluenda D
  • Mota J
  • Jimenez A
  • Vargas J
  • Marabini R
  • Carazo JM
  • Sorzano COS
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10/2018

10.1101/433284

  • ORCID

ENRICH: a fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M
  • Sorzano COS
  • Des Georges A
  • Carazo JM
  • Vargas J

08/2018

10.1101/400317

  • ORCID

Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

  • Vargas J
  • Melero R
  • Gomez-Blanco J
  • Carazo J
  • Sorzano COS

11/2016

10.1101/088062

  • ORCID

DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing

  • Ruben Sanchez Garcia
  • Josue Gomez-Blanco
  • Ana Cuervo
  • Jose Maria Carazo
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Javier Vargas

13/06/2020

10.1101/2020.06.12.148296

  • ORCID

NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice

  • Carlos Wert-Carvajal
  • Rubén Sánchez-García
  • José R Macías
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Almudena Méndez Pérez
  • Ramon Alemany
  • Esteban Veiga Chacón
  • Carlos Óscar S. Sorzano
  • Arrate Muñoz-Barrutia
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5/10/2020

10.1101/2020.10.05.327015

  • ORCID

Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19

  • Sorzano co
  • Crisman E
  • Carazo JM
  • leon r

15/07/2020

10.26434/chemrxiv.12652997.v1

  • ORCID

Statistical experiment design for animal research

  • Carlos Oscar S. Sorzano

2/06/2023

10.31219/osf.io/e9s25

  • ORCID

Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction

  • Almudena Mendez-Perez
  • Andres M Acosta-Moreno
  • Carlos Wert-Carvajal
  • Pilar Ballesteros-Cuartero
  • Ruben Sanchez-Garcia
  • Jose R Macias
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Ramon Alemany
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Arrate Munoz-Barrutia
  • Esteban Veiga
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22/11/2023

10.1101/2023.11.22.568042

  • ORCID
Open Access

ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Georges A.d.
  • Abrishami V.
  • Vargas J.

Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021

10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001

Número de citas: 2 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 0,859 (2020)
  • SNIP: 0,995 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,907
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Open Access

The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation

  • Tiziana Ginex
  • Clara Marco-Marín
  • Miłosz Wieczór
  • Carlos P. Mata
  • James Krieger
  • Maria Luisa López-Redondo
  • Clara Francés-Gómez
  • Paula Ruiz-Rodriguez
  • Roberto Melero
  • Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
  • Marta Martínez
  • Nadine Gougeard
  • Alicia Forcada-Nadal
  • Sara Zamora-Caballero
  • Roberto Gozalbo-Rovira
  • Carla Sanz-Frasquet
  • Jeronimo Bravo
  • Vicente Rubio
  • Alberto Marina
  • Ron Geller
  • Iñaki Comas
  • Carmen Gil
  • Mireia Coscolla
  • Modesto Orozco
  • José Luis Llácer
  • José-Maria Carazo
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PLoS Pathogens - 7/12/2021

10.1371/journal.ppat.1010631

Número de citas: 8 (Web of Science)
  • Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
  • CiteScore: 10,5 (2021)
  • SJR: 2,596 (2021)
  • SNIP: 1,618 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 7,913
  • Categorías JCR: VIROLOGY

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