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Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor

Open Access

Versatility of Approximating Single-Particle Electron Microscopy Density Maps Using Pseudoatoms and Approximation-Accuracy Control

  • Jonic, Slavica
  • Sorzano, Carlos Oscar S.

Biomed Research International - 1/1/2016

10.1155/2016/7060348 Ver en origen

Número de citas: 8 (Web of Science) 5 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,476 (2016)
  • CiteScore: 4,1 (2020)
  • SJR: 0,885 (2016)
  • SNIP: 0,964 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,587
  • Categorías JCR: MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL
  • Categorías SJR: Medicine (miscellaneous) (Q1); Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (Q2); Immunology and Microbiology (miscellaneous) (Q2)
Open Access

Variable internal flexibility characterizes the helical capsid formed by agrobacterium VirE2 protein on single-stranded DNA

  • Bharat, Tanmay A. M.
  • Zbaida, David
  • Eisenstein, Miriam
  • Frankenstein, Ziv
  • Mehlman, Tevie
  • Weiner, Lev
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Barak, Yoav
  • Albeck, Shira
  • Briggs, John A. G.
  • Wolf, Sharon G.
  • Elbaum, Michael
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STRUCTURE - 2/07/2013

10.1016/j.str.2013.04.027 Ver en origen

Número de citas: 8 (Web of Science) 8 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2013)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 6,794 (2013)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,215 (2013)
  • CiteScore: 9 (2020)
  • SJR: 5,137 (2013)
  • SNIP: 1,545 (2013)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,337
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)

Validation of electron microscopy initial models via small angle X-ray scattering curves

  • Jiménez A.
  • Jonic S.
  • Majtner T.
  • Otón J.
  • Vilas J.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Rancel Y.
  • Segura J.
  • Sánchez-García R.
  • Melero R.
  • Del Cano L.
  • Conesa P.
  • Skjaerven L.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
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Bioinformatics - 15/07/2019

10.1093/bioinformatics/bty985

Número de citas: 6 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,61 (2019)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 3,567 (2019)
  • SNIP: 1,864 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 9,853
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)

Vaccinia Virus with Selective Deletions Enhances T Cell Response to HIV Antigens by Specific Neutrophil Recruitment

  • Di Pilato, Mauro
  • Mejias-Perez, Ernesto
  • Zonca, Manuela
  • Perdiguero, Beatriz
  • Elena Gomez, Carmen
  • Trakala, Marianna
  • Nieto, Jacobo
  • Luis Najera, Jose
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Planelles, Lourdes
  • Esteban, Mariano
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Aids Research and Human Retroviruses - 1/10/2014

10.1089/aid.2014.5534.abstract Ver en origen

  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,325 (2014)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,162
  • Categorías JCR: VIROLOGY
  • Categorías SJR: Infectious Diseases (Q1); Immunology (Q2); Virology (Q2)

Using Scipion for stream image processing at Cryo-EM facilities

  • Gómez-Blanco J.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Marabini R.
  • del Cano L.
  • Jiménez A.
  • Martínez M.
  • Melero R.
  • Majtner T.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Rancel Y.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Vilas J.
  • Carroni M.
  • Fleischmann S.
  • Lindahl E.
  • Ashton A.
  • Basham M.
  • Clare D.
  • Savage K.
  • Siebert C.
  • Sharov G.
  • Sorzano C.
  • Conesa P.
  • Carazo J.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/2018

10.1016/j.jsb.2018.10.001

Número de citas: 23 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,754 (2018)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 5,254 (2018)
  • SNIP: 1,207 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,522
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Using neighborhood cohesiveness to infer interactions between protein domains

  • Segura, Joan
  • Sorzano, C. O. S.
  • Cuenca-Alba, Jesus
  • Aloy, Patrick
  • Carazo, J. M.

Bioinformatics - 1/08/2015

10.1093/bioinformatics/btv188 Ver en origen

Número de citas: 12 (Web of Science) 10 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,766 (2015)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 4,97 (2015)
  • SNIP: 2,178 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 7,685
  • Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)

Undergraduate students compete in the IEEE signal processing cup: Part 2

  • Sorzano, Carlos Oscar S.

IEEE Signal Processing Magazine - 1/09/2015

10.1109/msp.2015.2435816 Ver en origen

Número de citas:
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 6,671 (2015)
  • CiteScore: 18,8 (2020)
  • SJR: 2,39 (2015)
  • SNIP: 5,934 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,018
  • Categorías JCR: ENGINEERING, ELECTRICAL & ELECTRONIC
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Electrical and Electronic Engineering (Q1); Music (Q1); Signal Processing (Q1)

Undergraduate students compete in the IEEE signal processing cup: Part 1 [sp Education]

  • Lam, Kin-Man
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Zhang, Zhilin
  • Campisi, Patrizio

IEEE Signal Processing Magazine - 1/07/2015

10.1109/msp.2015.2419291 Ver en origen

Número de citas: 9 (Web of Science) 9 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 6,671 (2015)
  • CiteScore: 18,8 (2020)
  • SJR: 2,39 (2015)
  • SNIP: 5,934 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,018
  • Categorías JCR: ENGINEERING, ELECTRICAL & ELECTRONIC
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Electrical and Electronic Engineering (Q1); Music (Q1); Signal Processing (Q1)
Open Access

Two-step interferometry by a regularized optical flow algorithm

  • Vargas, J.
  • Antonio Quiroga, J.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Estrada, J. C.
  • Carazo, J. M.

OPTICS LETTERS - 1/09/2011

10.1364/ol.36.003485 Ver en origen

Número de citas: 116 (Web of Science) 112 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,399 (2011)
  • CiteScore: 7 (2020)
  • SJR: 2,519 (2011)
  • SNIP: 2,435 (2011)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,387
  • Categorías JCR: OPTICS
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1)
Open Access

Two-step demodulation based on the Gram-Schmidt orthonormalization method

  • Vargas, J.
  • Antonio Quiroga, J.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Estrada, J. C.
  • Carazo, J. M.

OPTICS LETTERS - 1/02/2012

10.1364/ol.37.000443 Ver en origen

Número de citas: 156 (Web of Science) 144 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,385 (2012)
  • CiteScore: 7 (2020)
  • SJR: 2,577 (2012)
  • SNIP: 1,902 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,3
  • Categorías JCR: OPTICS
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1)

Splines in Biomedical Image Processing

  • Jonic S.
  • Sorzano C.

Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011

10.1002/9783527635245.ch6

Número de citas: 3 (Scopus)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes

  • Devaux, Zaelle
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Jonic, Slavica
  • Conn, PM

Methods in Cell Biology - 1/1/2012

10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2012)
  • Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,908 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,932
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098380

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Molecular image registration using mutual information and differential evolution optimization

  • Telenczuk, Bartosz
  • Ledesma-Carbayo, Marta J.
  • Velazquez-Muriel, Javier A.
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Santos, Andres
  • IEEE
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2006 3rd Ieee International Symposium On Biomedical Imaging: From Nano To Macro - Proceedings - 17/11/2006

Número de citas: 4 (Web of Science) 11 (Scopus)

LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution

  • Ramirez-Aportela, E.
  • Vilas, J. L.
  • Carazo, J. M.
  • Sanchez Sorzano, C. O.

European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019

  • Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,888
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS

Intelligent alarms for patient supervision

  • Otero A.
  • Félix P.
  • Palacios F.
  • Pérez-Gandía C.
  • Sorzano C.

2007 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, CONFERENCE PROCEEDINGS BOOK - 1/12/2007

10.1109/wisp.2007.4447555 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 7 (Scopus)

Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations

  • Kazemi, M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Georges, A. Des
  • Carazo, J. M.
  • Vargas, J.

Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098446

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp

  • Scheres, SHW
  • Merino, AJ
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • IEEE Comp Soc

Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005

10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,194 (2005)
  • SNIP: 0,374 (2005)

Flexible image registration for the identification of best fitted protein models in 3D-EM maps

  • Fernandez-de-Manuell, Laura
  • Ledesma-Carbayol, Maria J.
  • Atienza-Herrero, Julian
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Santos, Andres
  • IEEE
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2008 5th Ieee International Symposium On Biomedical Imaging: From Nano To Macro, Proceedings, Isbi - 10/05/2008

10.1109/isbi.2008.4541163 Ver en origen

Número de citas:

Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows

  • Li M.
  • Xu G.
  • Sorzano C.
  • Melero R.
  • Bajaj C.

Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010

10.1109/bmei.2010.5639445

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management

Electric-Potential Reconstructions of Single Particles Using L-2-Gradient Flows

  • Li, Ming
  • Xu, Guoliang
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Melero, Roberto
  • Bajaj, Chandrajit
  • Yu, W
  • Zhang, M
  • Wang, L
  • Song, Y
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2010 3RD INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOMEDICAL ENGINEERING AND INFORMATICS (BMEI 2010), VOLS 1-7 - 2010

Elastic image registration with applications to proteomics

  • Sorzano, C. O. S.
  • Thevenaz, P.
  • Valdes, I.
  • Beloso, A.
  • Unser, M.
  • Cristobal, G
  • Javidi, B
  • Vallmitjana, S
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INFORMATION OPTICS - 1/12/2006

10.1063/1.2361232 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 0,7 (2020)
  • SJR: 0,184 (2006)
  • SNIP: 0,204 (2006)

Este autor no tiene patentes.

Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction

  • Almudena Mendez-Perez
  • Andres M Acosta-Moreno
  • Carlos Wert-Carvajal
  • Pilar Ballesteros-Cuartero
  • Ruben Sanchez-Garcia
  • Jose R Macias
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Ramon Alemany
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Arrate Munoz-Barrutia
  • Esteban Veiga
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22/11/2023

10.1101/2023.11.22.568042

  • ORCID
Open Access

The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation

  • Tiziana Ginex
  • Clara Marco-Marín
  • Miłosz Wieczór
  • Carlos P. Mata
  • James Krieger
  • Maria Luisa López-Redondo
  • Clara Francés-Gómez
  • Paula Ruiz-Rodriguez
  • Roberto Melero
  • Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
  • Marta Martínez
  • Nadine Gougeard
  • Alicia Forcada-Nadal
  • Sara Zamora-Caballero
  • Roberto Gozalbo-Rovira
  • Carla Sanz-Frasquet
  • Jeronimo Bravo
  • Vicente Rubio
  • Alberto Marina
  • Ron Geller
  • Iñaki Comas
  • Carmen Gil
  • Mireia Coscolla
  • Modesto Orozco
  • José Luis Llácer
  • José-Maria Carazo
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PLoS Pathogens - 7/12/2021

10.1371/journal.ppat.1010631

Número de citas: 8 (Web of Science)
  • Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
  • CiteScore: 10,5 (2021)
  • SJR: 2,596 (2021)
  • SNIP: 1,618 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 7,913
  • Categorías JCR: VIROLOGY

Statistical experiment design for animal research

  • Carlos Oscar S. Sorzano

2/06/2023

10.31219/osf.io/e9s25

  • ORCID

Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing

  • James Michael Krieger
  • Carlos Oscar S. Sorzano
  • Jose Maria Carazo

International Journal of Molecular Sciences - 10/08/2023

10.3390/ijms241814245

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • CiteScore: 7,8 (2022)
  • SJR: 1,154 (2022)
  • SNIP: 1,263 (2022)

Removal of the C6 vaccinia virus interferon-β inhibitor in the hepatitis C vaccine candidate MVA-HCV elicited in mice high immunogenicity in spite of reduced host gene expression

  • Q. Marín M
  • Pérez P
  • Gómez CE
  • S. Sorzano CO
  • Esteban M
  • García-Arriaza J

05/2018

10.1101/330902

  • ORCID

Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

  • Vargas J
  • Melero R
  • Gomez-Blanco J
  • Carazo J
  • Sorzano COS

11/2016

10.1101/088062

  • ORCID

NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice

  • Carlos Wert-Carvajal
  • Rubén Sánchez-García
  • José R Macías
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Almudena Méndez Pérez
  • Ramon Alemany
  • Esteban Veiga Chacón
  • Carlos Óscar S. Sorzano
  • Arrate Muñoz-Barrutia
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5/10/2020

10.1101/2020.10.05.327015

  • ORCID

Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19

  • Sorzano co
  • Crisman E
  • Carazo JM
  • leon r

15/07/2020

10.26434/chemrxiv.12652997.v1

  • ORCID

Improvements on marker-free images alignment for electron tomography

  • C.O.S. Sorzano
  • F. de Isidro-Gómez
  • E. Fernández-Giménez
  • D. Herreros
  • S. Marco
  • J.M. Carazo
  • C. Messaoudi
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Journal of Structural Biology: X - 24/05/2020

10.1101/2020.05.22.110445

Número de citas: 8 (Web of Science)
  • Cuartil SJR: Q4
  • Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,474
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q4)

Growth hormone remodels the 3D-structure of the mitochondria of inflammatory macrophages and promotes metabolic reprogramming

  • Blanca Soler Palacios
  • Ricardo Villares
  • Pilar Lucas
  • Jose Miguel Rodriguez Frade
  • Ana Cayuela
  • Jonathan Gabriel Piccirillo
  • David Delgado Gestoso
  • Cristina Risco
  • Fernando Corrales
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Nuria Martinez
  • Jose Javier Conesa
  • Francisco J. Iborra
  • Mario Mellado
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Frontiers in Immunology - 22/08/2022

10.1101/2022.08.22.504729

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 7,3 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 8
  • Categorías JCR: IMMUNOLOGY

Scopus: 36

Web of Science: 42

Scopus: 129

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