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Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor

Open Access

Marker-free image registration of electron tomography tilt-series

  • Sanchez Sorzano, Carlos Oscar
  • Messaoudi, Cedric
  • Eibauer, Matthias
  • Bilbao-Castro, J. R.
  • Hegerl, R.
  • Nickell, S.
  • Marco, S.
  • Carazo, J. M.
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BMC BIOINFORMATICS - 27/04/2009

10.1186/1471-2105-10-124 Ver en origen

Número de citas: 87 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2009)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,428 (2009)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,733 (2009)
  • CiteScore: 4,6 (2019)
  • SJR: 1,626 (2019)
  • SNIP: 1,156 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,108
  • Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Biochemistry (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q2); Structural Biology (Q2)
Open Access

TomoJ: tomography software for three-dimensional reconstruction in transmission electron microscopy

  • Messaoudil, Cedric
  • Boudier, Thomas
  • Oscar Sanchez Sorzano, Carlos
  • Marco, Sergio

BMC BIOINFORMATICS - 6/08/2007

10.1186/1471-2105-8-288 Ver en origen

Número de citas: 242 (Web of Science) 227 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2007)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,493 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 4,837 (2007)
  • CiteScore: 5,7 (2020)
  • SJR: 1,973 (2007)
  • SNIP: 1,122 (2007)
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Biochemistry (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q2); Structural Biology (Q2)
Open Access

StructMap: Elastic Distance Analysis of Electron Microscopy Maps for Studying Conformational Changes

  • Sanchez Sorzano, Carlos Oscar
  • Lucia Alvarez-Cabrera, Ana
  • Kazemi, Mohsen
  • Maria Carazo, Jose
  • Jonic, Slavica

BIOPHYSICAL JOURNAL - 26/04/2016

10.1016/j.bpj.2016.03.019 Ver en origen

Número de citas: 21 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2016)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,656 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,859 (2016)
  • CiteScore: 6,3 (2020)
  • SJR: 1,988 (2016)
  • SNIP: 1,042 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,743
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Biophysics (Q1)
Open Access

3DIANA: 3D Domain Interaction Analysis: A Toolbox for Quaternary Structure Modeling

  • Segura, Joan
  • Sanchez-Garcia, Ruben
  • Tabas-Madrid, Daniel
  • Cuenca-Alba, Jesus
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Maria Carazo, Jose

Biophysical Journal - 23/02/2016

10.1016/j.bpj.2015.11.3519 Ver en origen

Número de citas: 13 (Web of Science) 11 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,656 (2016)
  • CiteScore: 6,3 (2020)
  • SJR: 1,988 (2016)
  • SNIP: 1,042 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,743
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Biophysics (Q1)
Open Access

Quantitative characterization of membrane-protein reversible association using FCS

  • Vesga A.G.
  • Villegas L.
  • Vequi-Suplicy C.C.
  • Sorzano C.O.S.
  • Requejo-Isidro J.

Biophysical Journal - 1/1/2023

10.1016/j.bpj.2023.01.026

Número de citas: 1 (Scopus)
  • CiteScore: 5,9 (2022)
  • SJR: 1,216 (2022)
  • SNIP: 0,842 (2022)
Open Access

A Survey of the Use of Iterative Reconstruction Algorithms in Electron Microscopy

  • Sorzano C.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • De La Rosa-Trevín J.
  • Vilas J.
  • Kazemi M.
  • Melero R.
  • Del Caño L.
  • Cuenca J.
  • Conesa P.
  • Gómez-Blanco J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Biomed Research International - 1/1/2017

10.1155/2017/6482567

Número de citas: 24 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2017)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,583 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,428 (2017)
  • CiteScore: 4,1 (2020)
  • SJR: 0,935 (2017)
  • SNIP: 1,034 (2017)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,931
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (Q1); Medicine (miscellaneous) (Q1); Immunology and Microbiology (miscellaneous) (Q2)
Open Access

Versatility of Approximating Single-Particle Electron Microscopy Density Maps Using Pseudoatoms and Approximation-Accuracy Control

  • Jonic, Slavica
  • Sorzano, Carlos Oscar S.

Biomed Research International - 1/1/2016

10.1155/2016/7060348 Ver en origen

Número de citas: 8 (Web of Science) 5 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,476 (2016)
  • CiteScore: 4,1 (2020)
  • SJR: 0,885 (2016)
  • SNIP: 0,964 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,587
  • Categorías JCR: MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL
  • Categorías SJR: Medicine (miscellaneous) (Q1); Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (Q2); Immunology and Microbiology (miscellaneous) (Q2)
Open Access

Characterization of transfer function, resolution and depth of field of a soft X-ray microscope applied to tomography enhancement by Wiener deconvolution

  • Oton, Joaquin
  • Pereiro, Eva
  • Perez-Berna, Ana J.
  • Millach, Laia
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose M.
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Biomedical Optics Express - 1/12/2016

10.1364/boe.7.005092 Ver en origen

Número de citas: 27 (Web of Science) 19 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,337 (2016)
  • CiteScore: 7,2 (2020)
  • SJR: 1,453 (2016)
  • SNIP: 1,456 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,544
  • Categorías JCR: OPTICS
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1); Biotechnology (Q1)

Cell-TypeAnalyzer: A flexible Fiji/ImageJ plugin to classify cells according to user-defined criteria

  • Ana Cayuela López
  • José Antonio Gómez-Pedrero
  • Ana María Oña Blanco
  • Carlos Oscar S. Sorzano

Biological Imaging - 20/05/2022

10.1017/s2633903x22000058

  • ORCID

3DBionotes COVID-19 Edition.

  • Macias JR
  • Sanchez-Garcia R
  • Conesa P
  • Ramirez-Aportela E
  • Martinez Gonzalez M
  • Wert-Carvajal C
  • Parra-Perez AM
  • Segura Mora J
  • Horrell S
  • Thorn A
  • Carazo JM
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Bioinformatics (Oxford, England) - 15/05/2021

10.1093/bioinformatics/btab397

Número de citas: 1 (Web of Science)

Splines in Biomedical Image Processing

  • Jonic S.
  • Sorzano C.

Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011

10.1002/9783527635245.ch6

Número de citas: 3 (Scopus)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes

  • Devaux, Zaelle
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Jonic, Slavica
  • Conn, PM

Methods in Cell Biology - 1/1/2012

10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2012)
  • Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,908 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,932
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Clustering of biomedical scientific papers

  • Bravo-Alcobendas D.
  • Sorzano C.

WISP 2009: 6TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, PROCEEDINGS - 10/12/2009

10.1109/wisp.2009.5286530 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp

  • Scheres, SHW
  • Merino, AJ
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • IEEE Comp Soc

Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005

10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,194 (2005)
  • SNIP: 0,374 (2005)

Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows

  • Li M.
  • Xu G.
  • Sorzano C.
  • Melero R.
  • Bajaj C.

Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010

10.1109/bmei.2010.5639445

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management

Elastic image registration with applications to proteomics

  • Sorzano, C. O. S.
  • Thevenaz, P.
  • Valdes, I.
  • Beloso, A.
  • Unser, M.
  • Cristobal, G
  • Javidi, B
  • Vallmitjana, S
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INFORMATION OPTICS - 1/12/2006

10.1063/1.2361232 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 0,7 (2020)
  • SJR: 0,184 (2006)
  • SNIP: 0,204 (2006)

LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution

  • Ramirez-Aportela, E.
  • Vilas, J. L.
  • Carazo, J. M.
  • Sanchez Sorzano, C. O.

European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019

  • Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,888
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098380

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations

  • Kazemi, M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Georges, A. Des
  • Carazo, J. M.
  • Vargas, J.

Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098446

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

A fuzzy constraint satisfaction approach to identify and characterize apnea episodes

  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Félix P.
  • Álvarez M.
  • Zamarrón C.

2nd International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, iCBBE 2008 - 1/1/2008

10.1109/icbbe.2008.835

Número de citas: 2 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Biotechnology

Este autor no tiene patentes.

Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction

  • Almudena Mendez-Perez
  • Andres M Acosta-Moreno
  • Carlos Wert-Carvajal
  • Pilar Ballesteros-Cuartero
  • Ruben Sanchez-Garcia
  • Jose R Macias
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Ramon Alemany
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Arrate Munoz-Barrutia
  • Esteban Veiga
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22/11/2023

10.1101/2023.11.22.568042

  • ORCID

ENRICH: a fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M
  • Sorzano COS
  • Des Georges A
  • Carazo JM
  • Vargas J

08/2018

10.1101/400317

  • ORCID

Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

  • Vargas J
  • Melero R
  • Gomez-Blanco J
  • Carazo J
  • Sorzano COS

11/2016

10.1101/088062

  • ORCID

DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing

  • Ruben Sanchez Garcia
  • Josue Gomez-Blanco
  • Ana Cuervo
  • Jose Maria Carazo
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Javier Vargas

13/06/2020

10.1101/2020.06.12.148296

  • ORCID

NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice

  • Carlos Wert-Carvajal
  • Rubén Sánchez-García
  • José R Macías
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Almudena Méndez Pérez
  • Ramon Alemany
  • Esteban Veiga Chacón
  • Carlos Óscar S. Sorzano
  • Arrate Muñoz-Barrutia
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5/10/2020

10.1101/2020.10.05.327015

  • ORCID

Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19

  • Sorzano co
  • Crisman E
  • Carazo JM
  • leon r

15/07/2020

10.26434/chemrxiv.12652997.v1

  • ORCID

Statistical experiment design for animal research

  • Carlos Oscar S. Sorzano

2/06/2023

10.31219/osf.io/e9s25

  • ORCID

Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps.

  • Ramirez-Aportela E
  • Vilas JL
  • Melero R
  • Conesa P
  • Martinez M
  • Maluenda D
  • Mota J
  • Jimenez A
  • Vargas J
  • Marabini R
  • Carazo JM
  • Sorzano COS
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10/2018

10.1101/433284

  • ORCID
Open Access

ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Georges A.d.
  • Abrishami V.
  • Vargas J.

Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021

10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001

Número de citas: 2 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 0,859 (2020)
  • SNIP: 0,995 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,907
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Open Access

Erratum: The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation (PLoS Pathog (2022) 18:7 (e1010631) DOI: 10.1371/journal.ppat.1010631)

  • Ginex T.
  • Marco-Marín C.
  • Wieczór M.
  • Mata C.
  • Krieger J.
  • Ruiz-Rodriguez P.
  • López-Redondo M.L.
  • Francés-Gómez C.
  • Melero R.
  • Sánchez-Sorzano C.Ó.
  • Martínez M.
  • Gougeard N.
  • Forcada-Nadal A.
  • Zamora-Caballero S.
  • Gozalbo-Rovira R.
  • Sanz-Frasquet C.
  • Arranz R.
  • Bravo J.
  • Rubio V.
  • Marina A.
  • Geller R.
  • Comas I.
  • Gil C.
  • Coscolla M.
  • Orozco M.
  • Llácer J.L.
  • Carazo J.M.
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PLoS Pathogens - 1/11/2022

10.1371/journal.ppat.1010995

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 6,7 (2022)
  • CiteScore: 10,5 (2021)
  • SJR: 2,596 (2021)
  • SNIP: 1,618 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,7
  • Categorías JCR: VIROLOGY

Scopus: 36

Web of Science: 42

Scopus: 129

Web of Science: 163

Última actualización de los datos: 11/05/24 8:46
Próxima recolección programada: 18/05/24 3:00