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Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor

Translocation dynamics of sorting nexin 27 in activated T cells

  • Rincon, Esther
  • Saez de Guinoa, Julia
  • Gharbi, Severine I.
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Carrasco, Yolanda R.
  • Merida, Isabel

JOURNAL OF CELL SCIENCE - 1/03/2011

10.1242/jcs.072447 Ver en origen

Número de citas: 45 (Web of Science) 44 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 6,111 (2011)
  • CiteScore: 6,9 (2020)
  • SJR: 4,778 (2011)
  • SNIP: 1,402 (2011)
  • Impacto JCR a 5 años: 6,401
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Cell Biology (Q1)

Transfer function restoration in 3D electron microscopy via iterative data refinement

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Censor, Y
  • Carazo, JM

Physics in Medicine and Biology - 21/02/2004

10.1088/0031-9155/49/4/003 Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,368 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,34 (2004)
  • CiteScore: 5,9 (2020)
  • SJR: 1,047 (2004)
  • SNIP: 1,645 (2004)
  • Categorías SJR: Radiological and Ultrasound Technology (Q1); Radiology, Nuclear Medicine and Imaging (Q1)
Open Access

TomoJ: tomography software for three-dimensional reconstruction in transmission electron microscopy

  • Messaoudil, Cedric
  • Boudier, Thomas
  • Oscar Sanchez Sorzano, Carlos
  • Marco, Sergio

BMC BIOINFORMATICS - 6/08/2007

10.1186/1471-2105-8-288 Ver en origen

Número de citas: 242 (Web of Science) 227 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2007)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,493 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 4,837 (2007)
  • CiteScore: 5,7 (2020)
  • SJR: 1,973 (2007)
  • SNIP: 1,122 (2007)
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Biochemistry (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q2); Structural Biology (Q2)

Three-dimensional reconstruction methods in Single Particle Analysis from transmission electron microscopy data

  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Vargas, J.

Archives of Biochemistry and Biophysics - 1/09/2015

10.1016/j.abb.2015.05.003 Ver en origen

Número de citas: 18 (Web of Science) 14 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2015)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,807 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,299 (2015)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 1,513 (2015)
  • SNIP: 1,008 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,073
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Biophysics (Q1); Molecular Biology (Q2)

Three-dimensional reconstruction by Chahine's method from electron microscopic projections corrupted by instrumental aberrations

  • Zubelli, J.P.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C.O.S.
  • Herman, G.T.

INVERSE PROBLEMS - 1/08/2003

10.1088/0266-5611/19/4/310 Ver en origen

Número de citas: 13 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 3,7 (2020)
  • SJR: 0,796 (2003)
  • SNIP: 1,378 (2003)
  • Categorías SJR: Theoretical Computer Science (Q1); Applied Mathematics (Q2); Computer Science Applications (Q2); Signal Processing (Q2); Mathematical Physics (Q3)

Three-Dimensional Chemical Mapping by EFTEM-TomoJ Including Improvement of SNR by PCA and ART Reconstruction of Volume by Noise Suppression

  • Messaoudi, Cedric
  • Aschman, Nicolas
  • Cunha, Marcel
  • Oikawa, Tetsuo
  • Sanchez Sorzano, Carlos O.
  • Marco, Sergio

MICROSCOPY AND MICROANALYSIS - 1/12/2013

10.1017/s1431927613013317 Ver en origen

Número de citas: 20 (Web of Science) 20 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2013)
  • Cuartil SJR: Q3
  • Factor Impacto JCR: 2,161 (2013)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,92 (2013)
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,286 (2013)
  • SNIP: 0,279 (2013)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,624
  • Categorías JCR: MICROSCOPY
  • Categorías SJR: Instrumentation (Q3)

The Molecular Control of Calcitonin Receptor Signaling

  • Dal Maso E.
  • Glukhova A.
  • Zhu Y.
  • Garcia-Nafria J.
  • Tate C.G.
  • Atanasio S.
  • Reynolds C.A.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Carazo J.M.
  • Hick C.A.
  • Furness S.G.B.
  • Hay D.L.
  • Liang Y.L.
  • Miller L.J.
  • Christopoulos A.
  • Wang M.W.
  • Wootten D.
  • Sexton P.M.
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ACS Pharmacology and Translational Science - 8/2/2019

10.1021/acsptsci.8b00056

Número de citas: 36 (Web of Science) 25 (Scopus)

The HIV Vaccine Candidate MVA-B Triggers Robust, Polyfunctional and Memory T Cell Responses to HIV-1 Antigens in a Phase I Clinical Trial in Spain

  • Gomez, C.
  • Najera, J.
  • Perdiguero, B.
  • Garcia-Arriaza, J.
  • Sorzano, C. S.
  • Jimenez, V.
  • Gonzalez-Sanz, R.
  • Jimenez, J.
  • Munoz-Fernandez, M.
  • Lopez Bernaldo de Quiros, J.
  • Guardo, A. C.
  • Garcia, F.
  • Gatell, J. M.
  • Plana, M.
  • Esteban, M.
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AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES - 10/2011

  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 2,246 (2011)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,105
  • Categorías JCR: IMMUNOLOGY
  • Categorías SJR: Immunology (Q2); Infectious Diseases (Q2); Virology (Q2)

The HIV/AIDS Vaccine Candidate MVA-B Administered as a Single Immunogen in Humans Triggers Robust, Polyfunctional, and Selective Effector Memory T Cell Responses to HIV-1 Antigens

  • Elena Gomez, Carmen
  • Luis Najera, Jose
  • Perdiguero, Beatriz
  • Garcia-Arriaza, Juan
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Jimenez, Victoria
  • Gonzalez-Sanz, Ruben
  • Luis Jimenez, Jose
  • Angeles Munoz-Fernandez, Maria
  • Lopez Bernaldo de Quiros, Juan Carlos
  • Guardo, Alberto C.
  • Garcia, Felipe
  • Gatell, Jose M.
  • Plana, Montserrat
  • Esteban, Mariano
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JOURNAL OF VIROLOGY - 1/11/2011

10.1128/jvi.05165-11 Ver en origen

Número de citas: 58 (Web of Science) 54 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,402 (2011)
  • CiteScore: 8,9 (2020)
  • SJR: 3,429 (2011)
  • SNIP: 1,281 (2011)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,324
  • Categorías JCR: VIROLOGY
  • Categorías SJR: Immunology (Q1); Insect Science (Q1); Microbiology (Q1); Virology (Q1)

The first single particle analysis Map Challenge: A summary of the assessments

  • Heymann J.
  • Marabini R.
  • Kazemi M.
  • Sorzano C.
  • Holmdahl M.
  • Mendez J.
  • Stagg S.
  • Jonic S.
  • Palovcak E.
  • Armache J.
  • Zhao J.
  • Cheng Y.
  • Pintilie G.
  • Chiu W.
  • Patwardhan A.
  • Carazo J.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2018

10.1016/j.jsb.2018.08.010

Número de citas: 14 (Web of Science) 9 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,754 (2018)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 5,254 (2018)
  • SNIP: 1,207 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,522
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Splines in Biomedical Image Processing

  • Jonic S.
  • Sorzano C.

Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011

10.1002/9783527635245.ch6

Número de citas: 3 (Scopus)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes

  • Devaux, Zaelle
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Jonic, Slavica
  • Conn, PM

Methods in Cell Biology - 1/1/2012

10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2012)
  • Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,908 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,932
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098380

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Molecular image registration using mutual information and differential evolution optimization

  • Telenczuk, Bartosz
  • Ledesma-Carbayo, Marta J.
  • Velazquez-Muriel, Javier A.
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Santos, Andres
  • IEEE
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2006 3rd Ieee International Symposium On Biomedical Imaging: From Nano To Macro - Proceedings - 17/11/2006

Número de citas: 4 (Web of Science) 11 (Scopus)

LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution

  • Ramirez-Aportela, E.
  • Vilas, J. L.
  • Carazo, J. M.
  • Sanchez Sorzano, C. O.

European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019

  • Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,888
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS

Intelligent alarms for patient supervision

  • Otero A.
  • Félix P.
  • Palacios F.
  • Pérez-Gandía C.
  • Sorzano C.

2007 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, CONFERENCE PROCEEDINGS BOOK - 1/12/2007

10.1109/wisp.2007.4447555 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 7 (Scopus)

Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations

  • Kazemi, M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Georges, A. Des
  • Carazo, J. M.
  • Vargas, J.

Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098446

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp

  • Scheres, SHW
  • Merino, AJ
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • IEEE Comp Soc

Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005

10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,194 (2005)
  • SNIP: 0,374 (2005)

Flexible image registration for the identification of best fitted protein models in 3D-EM maps

  • Fernandez-de-Manuell, Laura
  • Ledesma-Carbayol, Maria J.
  • Atienza-Herrero, Julian
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Santos, Andres
  • IEEE
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2008 5th Ieee International Symposium On Biomedical Imaging: From Nano To Macro, Proceedings, Isbi - 10/05/2008

10.1109/isbi.2008.4541163 Ver en origen

Número de citas:

Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows

  • Li M.
  • Xu G.
  • Sorzano C.
  • Melero R.
  • Bajaj C.

Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010

10.1109/bmei.2010.5639445

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management

Electric-Potential Reconstructions of Single Particles Using L-2-Gradient Flows

  • Li, Ming
  • Xu, Guoliang
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Melero, Roberto
  • Bajaj, Chandrajit
  • Yu, W
  • Zhang, M
  • Wang, L
  • Song, Y
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2010 3RD INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOMEDICAL ENGINEERING AND INFORMATICS (BMEI 2010), VOLS 1-7 - 2010

Elastic image registration with applications to proteomics

  • Sorzano, C. O. S.
  • Thevenaz, P.
  • Valdes, I.
  • Beloso, A.
  • Unser, M.
  • Cristobal, G
  • Javidi, B
  • Vallmitjana, S
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INFORMATION OPTICS - 1/12/2006

10.1063/1.2361232 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 0,7 (2020)
  • SJR: 0,184 (2006)
  • SNIP: 0,204 (2006)

Este autor no tiene patentes.

Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction

  • Almudena Mendez-Perez
  • Andres M Acosta-Moreno
  • Carlos Wert-Carvajal
  • Pilar Ballesteros-Cuartero
  • Ruben Sanchez-Garcia
  • Jose R Macias
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Ramon Alemany
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Arrate Munoz-Barrutia
  • Esteban Veiga
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22/11/2023

10.1101/2023.11.22.568042

  • ORCID
Open Access

The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation

  • Tiziana Ginex
  • Clara Marco-Marín
  • Miłosz Wieczór
  • Carlos P. Mata
  • James Krieger
  • Maria Luisa López-Redondo
  • Clara Francés-Gómez
  • Paula Ruiz-Rodriguez
  • Roberto Melero
  • Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
  • Marta Martínez
  • Nadine Gougeard
  • Alicia Forcada-Nadal
  • Sara Zamora-Caballero
  • Roberto Gozalbo-Rovira
  • Carla Sanz-Frasquet
  • Jeronimo Bravo
  • Vicente Rubio
  • Alberto Marina
  • Ron Geller
  • Iñaki Comas
  • Carmen Gil
  • Mireia Coscolla
  • Modesto Orozco
  • José Luis Llácer
  • José-Maria Carazo
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PLoS Pathogens - 7/12/2021

10.1371/journal.ppat.1010631

Número de citas: 8 (Web of Science)
  • Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
  • CiteScore: 10,5 (2021)
  • SJR: 2,596 (2021)
  • SNIP: 1,618 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 7,913
  • Categorías JCR: VIROLOGY

Statistical experiment design for animal research

  • Carlos Oscar S. Sorzano

2/06/2023

10.31219/osf.io/e9s25

  • ORCID

Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing

  • James Michael Krieger
  • Carlos Oscar S. Sorzano
  • Jose Maria Carazo

International Journal of Molecular Sciences - 10/08/2023

10.3390/ijms241814245

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • CiteScore: 7,8 (2022)
  • SJR: 1,154 (2022)
  • SNIP: 1,263 (2022)

Removal of the C6 vaccinia virus interferon-β inhibitor in the hepatitis C vaccine candidate MVA-HCV elicited in mice high immunogenicity in spite of reduced host gene expression

  • Q. Marín M
  • Pérez P
  • Gómez CE
  • S. Sorzano CO
  • Esteban M
  • García-Arriaza J

05/2018

10.1101/330902

  • ORCID

Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

  • Vargas J
  • Melero R
  • Gomez-Blanco J
  • Carazo J
  • Sorzano COS

11/2016

10.1101/088062

  • ORCID

NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice

  • Carlos Wert-Carvajal
  • Rubén Sánchez-García
  • José R Macías
  • Rebeca Sanz-Pamplona
  • Almudena Méndez Pérez
  • Ramon Alemany
  • Esteban Veiga Chacón
  • Carlos Óscar S. Sorzano
  • Arrate Muñoz-Barrutia
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5/10/2020

10.1101/2020.10.05.327015

  • ORCID

Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19

  • Sorzano co
  • Crisman E
  • Carazo JM
  • leon r

15/07/2020

10.26434/chemrxiv.12652997.v1

  • ORCID

Improvements on marker-free images alignment for electron tomography

  • C.O.S. Sorzano
  • F. de Isidro-Gómez
  • E. Fernández-Giménez
  • D. Herreros
  • S. Marco
  • J.M. Carazo
  • C. Messaoudi
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Journal of Structural Biology: X - 24/05/2020

10.1101/2020.05.22.110445

Número de citas: 8 (Web of Science)
  • Cuartil SJR: Q4
  • Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,474
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q4)

Growth hormone remodels the 3D-structure of the mitochondria of inflammatory macrophages and promotes metabolic reprogramming

  • Blanca Soler Palacios
  • Ricardo Villares
  • Pilar Lucas
  • Jose Miguel Rodriguez Frade
  • Ana Cayuela
  • Jonathan Gabriel Piccirillo
  • David Delgado Gestoso
  • Cristina Risco
  • Fernando Corrales
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Nuria Martinez
  • Jose Javier Conesa
  • Francisco J. Iborra
  • Mario Mellado
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Frontiers in Immunology - 22/08/2022

10.1101/2022.08.22.504729

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 7,3 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 8
  • Categorías JCR: IMMUNOLOGY

Scopus: 36

Web of Science: 42

Scopus: 129

Web of Science: 163

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