Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor
Hybrid Electron Microscopy Normal Mode Analysis with Scipion
- Harastani M.
- Sorzano C.
- Joni? S.
PROTEIN SCIENCE - 1/1/2020
- Cuartil JCR: Q2 (2020)
- Factor Impacto JCR: 3,876 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,806 (2020)
- CiteScore: 7,5 (2020)
- SJR: 3,353 (2020)
- SNIP: 1,511 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,316
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Scipion web tools: Easy to use cryo-EM image processing over the web
- Conesa Mingo, Pablo
- Gutierrez, Jose
- Quintana, Adrian
- de la Rosa Trevin, Jose Miguel
- Zaldivar-Peraza, Airen
- Cuenca Alba, Jesus
- Kazemi, Mohsen
- Vargas, Javier
- del Cano, Laura
- Segura, Joan
- Sorzano, Carlos Oscar S.
- Maria Carazo, Jose
PROTEIN SCIENCE - 1/01/2018
10.1002/pro.3315 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 2,42 (2018)
- CiteScore: 7,5 (2020)
- SJR: 1,566 (2018)
- SNIP: 0,69 (2018)
- Impacto JCR a 5 años: 2,767
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Medicine (miscellaneous) (Q1); Molecular Biology (Q2)
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State-dependent sequential allostery exhibited by chaperonin TRiC/CCT revealed by network analysis of Cryo-EM maps
- Zhang Y.
- Krieger J.
- Mikulska-Ruminska K.
- Kaynak B.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
- Xing J.
- Bahar I.
Progress in Biophysics and Molecular Biology - 1/1/2020
10.1016/j.pbiomolbio.2020.08.006
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,667 (2020)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 0,859 (2020)
- SNIP: 0,995 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 3,196
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A review of resolution measures and related aspects in 3D Electron Microscopy.
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- Vargas J
- Otón J
- Abrishami V
- de la Rosa-Trevín JM
- Gómez-Blanco J
- Vilas JL
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- Carazo JM
Progress in Biophysics and Molecular Biology - 1/03/2017
10.1016/j.pbiomolbio.2016.09.005 Ver en origen
- Cuartil JCR: Q2 (2017)
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,427 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,501 (2017)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 1,446 (2017)
- SNIP: 1,236 (2017)
- Impacto JCR a 5 años: 3,125
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
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Localized reconstruction in Scipion expedites the analysis of symmetry mismatches in cryo-EM data
- Abrishami V.
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- Gomez-Blanco J.
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- de la Rosa-Trevín J.M.
- Reddy V.S.
- Carazo J.M.
- Huiskonen J.T.
Progress in Biophysics and Molecular Biology - 1/1/2020
10.1016/j.pbiomolbio.2020.05.004
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,667 (2020)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 0,859 (2020)
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- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
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NF kappa B activation by modified vaccinia virus as a novel strategy to enhance neutrophil migration and HIV-specific T-cell responses
- Di Pilato, Mauro
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- Zonca, Manuela
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- Elena Gomez, Carmen
- Trakala, Marianna
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- Combadiere, Christophe
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PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA - 17/03/2015
10.1073/pnas.1424341112 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 9,423 (2015)
- CiteScore: 16,2 (2020)
- SJR: 6,814 (2015)
- SNIP: 2,677 (2015)
- Impacto JCR a 5 años: 10,285
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)
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Structural analysis of receptors and actin polarity in platelet protrusions
- Sorrentino S.
- Conesa J.J.
- Cuervo A.
- Melero R.
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- De Isidro-Gomez F.P.
- De la Morena J.
- Studt J.D.
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- Eibauer M.
- Carazo J.M.
- Medalia O.
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA - 14/9/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Factor Impacto JCR: 12,779 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 1,064 (2021)
- CiteScore: 16,2 (2020)
- SJR: 5,011 (2020)
- SNIP: 2,904 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 13,451
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
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Iterative reconstruction for pet scanners with continuous scintillators.
- Iriarte A.
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- Garcia-Carmona R.
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Proceedings of the Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, EMBS - 4/08/2015
10.1109/embc.2015.7318842 Ver en origen
- CiteScore: 1,5 (2020)
- SJR: 0,263 (2015)
- SNIP: 0,653 (2015)
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Outlier detection for single particle analysis in Electron Microscopy
- Sorzano, C. O. S.
- Vargas, J.
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- Caffarena, G.
- Carazo, J. M.
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- Rojas, I
Proceedings Iwbbio 2014: International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, Vols 1 and 2 - 2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 3,192 (2014)
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- Web of Science
2D and 3D Alignment for Electron Microscopy via Graphics Processing Units
- Garcia, Eduardo
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- Iriarte, Ana
- Sorzano, Carlos O. S.
- Caffarena, Gabriel
- Ortuno, F
- Rojas, I
Proceedings Iwbbio 2014: International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, Vols 1 and 2 - 2014
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Splines in Biomedical Image Processing
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Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011
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Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
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- Cuervo A.
- Melero R.
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- de Isidro-Gómez F.
- Herreros D.
- Conesa P.
- del Caño L.
- Fonseca Y.
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- Losana P.
- Marabini R.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,711 (2020)
- SNIP: 0,57 (2020)
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Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013
- Cuartil SJR: Q3
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,751 (2013)
- SNIP: 0,362 (2013)
- Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)
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Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes
- Devaux, Zaelle
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- Jonic, Slavica
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Methods in Cell Biology - 1/1/2012
10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen
- Cuartil JCR: Q2 (2012)
- Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
- CiteScore: 2,8 (2020)
- SJR: 0,908 (2012)
- Impacto JCR a 5 años: 1,932
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
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- Web of Science
Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy
- Carazo J.
- Herman G.
- Sorzano C.
- Marabini R.
Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006
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Soft X-ray tomography imaging for biological samples
- Otón J.
- Sorzano C.
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- Marabini R.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards
- Sorzano C.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Otón J.
- Cuenca-Alba J.
- Quintana A.
- de la Rosa-Trevín J.
- Carazo J.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
Clustering of biomedical scientific papers
- Bravo-Alcobendas D.
- Sorzano C.
WISP 2009: 6TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, PROCEEDINGS - 10/12/2009
10.1109/wisp.2009.5286530 Ver en origen
- Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
- Scopus
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- Web of Science
Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles
- Sorzano, C. O. S.
- Iriarte, A.
- Marabini, R.
- Carazo, J. M.
- IEEE
WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009
10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen
- Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
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- Web of Science
Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp
- Scheres, SHW
- Merino, AJ
- Sorzano, COS
- Carazo, JM
- IEEE Comp Soc
Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005
10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
- SJR: 0,194 (2005)
- SNIP: 0,374 (2005)
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- Web of Science
Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows
- Li M.
- Xu G.
- Sorzano C.
- Melero R.
- Bajaj C.
Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010
- Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management
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Elastic image registration with applications to proteomics
- Sorzano, C. O. S.
- Thevenaz, P.
- Valdes, I.
- Beloso, A.
- Unser, M.
- Cristobal, G
- Javidi, B
- Vallmitjana, S
INFORMATION OPTICS - 1/12/2006
10.1063/1.2361232 Ver en origen
- CiteScore: 0,7 (2020)
- SJR: 0,184 (2006)
- SNIP: 0,204 (2006)
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- Web of Science
LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution
- Ramirez-Aportela, E.
- Vilas, J. L.
- Carazo, J. M.
- Sanchez Sorzano, C. O.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
- Impacto JCR a 5 años: 1,888
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
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- Web of Science
Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization
- Arganda-Carreras, Ignacio
- Sorzano, Carlos O. S.
- Marabini, Roberto
- Carazo, Jose Maria
- Ortiz-de-Solorzano, Carlos
- Kybic, Jan
- Beichel, RR
COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006
10.1007/11889762_8 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
- SJR: 0,317 (2006)
- SNIP: 0,679 (2006)
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- Web of Science
Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities
- de la Rosa-Trevin, J. M.
- Gomez-Blanco, J.
- Conesa, P.
- Rancel, Y.
- del Cano, L.
- Arranz, R.
- Chichon, F. J.
- Martin-Benito, J.
- Carroni, M.
- Fleichman, S.
- Lindahl, E.
- Basham, M.
- Clare, D. K.
- Savage, K.
- Siebert, C. A.
- Ashton, A. W.
- Marabini, R.
- Sorzano, C. O. S.
- Carazo, J. M.
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018
- Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
- Impacto JCR a 5 años: 4,647
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
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- Web of Science
Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations
- Kazemi, M.
- Sorzano, C. O. S.
- Georges, A. Des
- Carazo, J. M.
- Vargas, J.
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018
- Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
- Impacto JCR a 5 años: 4,647
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
- ORCID
- Web of Science
A fuzzy constraint satisfaction approach to identify and characterize apnea episodes
- Otero A.
- Sorzano C.
- Félix P.
- Álvarez M.
- Zamarrón C.
2nd International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, iCBBE 2008 - 1/1/2008
- Categorías SJR: Biomedical Engineering; Biotechnology
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Este autor no tiene patentes.
Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction
- Almudena Mendez-Perez
- Andres M Acosta-Moreno
- Carlos Wert-Carvajal
- Pilar Ballesteros-Cuartero
- Ruben Sanchez-Garcia
- Jose R Macias
- Rebeca Sanz-Pamplona
- Ramon Alemany
- Carlos Oscar S Sorzano
- Arrate Munoz-Barrutia
- Esteban Veiga
22/11/2023
- ORCID
ENRICH: a fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions
- Kazemi M
- Sorzano COS
- Des Georges A
- Carazo JM
- Vargas J
08/2018
- ORCID
Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis
- Vargas J
- Melero R
- Gomez-Blanco J
- Carazo J
- Sorzano COS
11/2016
- ORCID
DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing
- Ruben Sanchez Garcia
- Josue Gomez-Blanco
- Ana Cuervo
- Jose Maria Carazo
- Carlos Oscar S Sorzano
- Javier Vargas
13/06/2020
- ORCID
NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice
- Carlos Wert-Carvajal
- Rubén Sánchez-García
- José R Macías
- Rebeca Sanz-Pamplona
- Almudena Méndez Pérez
- Ramon Alemany
- Esteban Veiga Chacón
- Carlos Óscar S. Sorzano
- Arrate Muñoz-Barrutia
5/10/2020
- ORCID
Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19
- Sorzano co
- Crisman E
- Carazo JM
- leon r
15/07/2020
- ORCID
Statistical experiment design for animal research
- Carlos Oscar S. Sorzano
2/06/2023
- ORCID
Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps.
- Ramirez-Aportela E
- Vilas JL
- Melero R
- Conesa P
- Martinez M
- Maluenda D
- Mota J
- Jimenez A
- Vargas J
- Marabini R
- Carazo JM
- Sorzano COS
10/2018
- ORCID
ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions
- Kazemi M.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
- Georges A.d.
- Abrishami V.
- Vargas J.
Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021
10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001
- Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 0,859 (2020)
- SNIP: 0,995 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 3,907
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
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- Web of Science
Erratum: The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation (PLoS Pathog (2022) 18:7 (e1010631) DOI: 10.1371/journal.ppat.1010631)
- Ginex T.
- Marco-Marín C.
- Wieczór M.
- Mata C.
- Krieger J.
- Ruiz-Rodriguez P.
- López-Redondo M.L.
- Francés-Gómez C.
- Melero R.
- Sánchez-Sorzano C.Ó.
- Martínez M.
- Gougeard N.
- Forcada-Nadal A.
- Zamora-Caballero S.
- Gozalbo-Rovira R.
- Sanz-Frasquet C.
- Arranz R.
- Bravo J.
- Rubio V.
- Marina A.
- Geller R.
- Comas I.
- Gil C.
- Coscolla M.
- Orozco M.
- Llácer J.L.
- Carazo J.M.
PLoS Pathogens - 1/11/2022
- Factor Impacto JCR: 6,7 (2022)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 6,7
- Categorías JCR: VIROLOGY
Índice h
Scopus: 36
Web of Science: 42
Índice i10
Scopus: 129
Web of Science: 163
Perfiles de autor
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-
Web of Science ResearcherID
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Google Scholar Id
Otros identificadores
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URI Datos BNE
Proyectos de investigación en la UAL
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Acrónimo P10-TIC-06002Desde: 15 de marzo de 2011Hasta: 15 de marzo de 2014Financiado por: JUNTAImporte de financiación: 105.730,00 EURRol: Investigador
-
Acrónimo 99109Desde: 2 de junio de 1999Hasta: 2 de junio de 2000Financiado por: Ministerio de Asuntos ExterioresImporte de financiación: 19.232,39 EURRol: Investigador