Sánchez Sorzano, Carlos Oscar Autor
ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation
- Jiménez de la Morena J.
- Conesa P.
- Fonseca Y.C.
- de Isidro-Gómez F.P.
- Herreros D.
- Fernández-Giménez E.
- Strelak D.
- Moebel E.
- Buchholz T.O.
- Jug F.
- Martinez-Sanchez A.
- Harastani M.
- Jonic S.
- Conesa J.J.
- Cuervo A.
- Losana P.
- Sánchez I.
- Iceta M.
- del Cano L.
- Gragera M.
- Melero R.
- Sharov G.
- Castaño-Díez D.
- Koster A.
- Piccirillo J.G.
- Vilas J.L.
- Otón J.
- Marabini R.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/9/2022
- Cuartil JCR: Q2 (2022)
- Factor Impacto JCR: 3 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 1,467 (2022)
- CiteScore: 5,3 (2021)
- SJR: 1,594 (2021)
- SNIP: 0,842 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 3,3
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
- Scopus
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- Web of Science
Scipion PKPD: an Open-Source Platform for Biopharmaceutics, Pharmacokinetics and Pharmacodynamics Data Analysis
- Sorzano C.O.S.
- Fonseca-Reyna Y.
- de la Cruz-Moreno M.A.P.
Pharmaceutical Research - 23/07/2021
- Factor Impacto JCR: 4,58 (2021)
- CiteScore: 6,4 (2020)
- SJR: 0,815 (2020)
- SNIP: 1,028 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,914
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
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- Web of Science
Scipion Flexibility Hub: an integrative framework for advanced analysis of conformational heterogeneity in cryoEM
- Herreros D.
- Krieger J.M.
- Fonseca Y.
- Conesa P.
- Harastani M.
- Vuillemot R.
- Hamitouche I.
- Serrano Gutiérrez R.
- Gragera M.
- Melero R.
- Jonic S.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
Acta crystallographica. Section D, Structural biology - 1/7/2023
- CiteScore: 7,5 (2022)
- SJR: 3,87 (2022)
- SNIP: 1,47 (2022)
- Scopus
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- Web of Science
ScipionCloud: An integrative and interactive gateway for large scale cryo electron microscopy image processing on commercial and academic clouds
- Cuenca-Alba J.
- del Cano L.
- Gómez Blanco J.
- de la Rosa Trevín J.
- Conesa Mingo P.
- Marabini R.
- Carlos C.
- Carazo J.
Journal of Structural Biology - 1/10/2017
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,433 (2017)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 3,948 (2017)
- SNIP: 0,97 (2017)
- Impacto JCR a 5 años: 3,489
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
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Scipion-Chem: An Open Platform for Virtual Drug Screening
- Del Hoyo D.
- Salinas M.
- Lomas A.
- Ulzurrun E.
- Campillo N.E.
- Sorzano C.O.
Journal of Chemical Information and Modeling - 1/1/2023
- CiteScore: 9,8 (2022)
- SJR: 1,357 (2022)
- SNIP: 1,379 (2022)
Scipion: A software framework toward integration, reproducibility and validation in 3D electron microscopy
- de la Rosa-Trevin, J. M.
- Quintana, A.
- del Cano, L.
- Zaldivar, A.
- Foche, I.
- Gutierrez, J.
- Gomez-Blanco, J.
- Burguet-Castell, J.
- Cuenca-Alba, J.
- Abrishami, V.
- Vargas, J.
- Oton, J.
- Sharov, G.
- Vilas, J. L.
- Navas, J.
- Conesa, P.
- Kazemi, M.
- Marabini, R.
- Sorzano, C. O. S.
- Carazo, J. M.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/07/2016
10.1016/j.jsb.2016.04.010 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 2,767 (2016)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,732 (2016)
- SNIP: 0,904 (2016)
- Impacto JCR a 5 años: 3,235
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
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- Web of Science
Safety and vaccine-induced HIV-1 immune responses in healthy volunteers following a late MVA-B boost 4 years after the last immunization
- Guardo, Alberto C.
- Elena Gomez, Carmen
- Diaz-Brito, Vicens
- Pich, Judit
- Albert Arnaiz, Joan
- Perdiguero, Beatriz
- Garcia-Arriaza, Juan
- Gonzalez, Nuria
- Sorzano, Carlos O. S.
- Jimenez, Laura
- Luis Jimenez, Jose
- Angeles Munoz-Fernandez, Maria
- Gatell, Jose M.
- Alcam, Jose
- Esteban, Mariano
- Bernaldo de Quiros, Juan Carlos Lopez
- Garcia, Felipe
- Plana, Montserrat
- RISVAC02boost Study
PLoS One - 24/10/2017
10.1371/journal.pone.0186602 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 2,766 (2017)
- CiteScore: 5,3 (2020)
- SJR: 1,164 (2017)
- SNIP: 1,15 (2017)
- Impacto JCR a 5 años: 3,352
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- Categorías SJR: Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous) (Q1); Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (Q1); Medicine (miscellaneous) (Q1)
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Safety and immunogenicity of a modified vaccinia Ankara-based HIV-1 vaccine (MVA-B) in HIV-1-infected patients alone or in combination with a drug to reactivate latent HIV-1
- Mothe, Beatriz
- Climent, Nuria
- Plana, Montserrat
- Rosas, Miriam
- Luis Jimenez, Jose
- Angeles Munoz-Fernandez, Maria
- Puertas, Maria C.
- Carrillo, Jorge
- Gonzalez, Nuria
- Leon, Agathe
- Pich, Judit
- Albert Arnaiz, Joan
- Gatell, Jose M.
- Clotet, Bonaventura
- Blanco, Julia
- Alcami, Jose
- Martinez-Picado, Javier
- Alvarez-Fernandez, Carmen
- Sanchez-Palomino, Sonsoles
- Guardo, Alberto C.
- Pena, Jose
- Benito, Jose M.
- Rallon, Norma
- Gomez, Carmen E.
- Perdiguero, Beatriz
- Garcia-Arriaza, Juan
- Esteban, Mariano
- Lopez Bernaldo de Quiros, Juan Carlos
- Brander, Christian
- Garcia, Felipe
- RISVAC-03 Study Grp
Journal of Antimicrobial Chemotherapy - 12/06/2014
10.1093/jac/dkv046 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 4,919 (2015)
- CiteScore: 9,1 (2020)
- SJR: 2,298 (2014)
- SNIP: 1,765 (2014)
- Impacto JCR a 5 años: 5,093
- Categorías JCR: INFECTIOUS DISEASES
- Categorías SJR: Infectious Diseases (Q1); Pharmacology (Q1); Pharmacology (medical) (Q1)
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- Web of Science
Role of clathrin in the inmune synapse formation
- Calabia-Linares, C.
- Alfonso-Perez, M. J.
- Martin-Cofreces, N.
- Perez-Martinez, M.
- Aguado-Ballano, C.
- Urbano-Olmos, F. R.
- Sanchez-Sorzano, C. O.
- Sanchez-Madrid, F.
- Veiga, E.
MICROSCOPY AND MICROANALYSIS - 1/07/2009
10.1017/s1431927609099449 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q3
- Factor Impacto JCR: 3,035 (2009)
- CiteScore: 2,8 (2020)
- SJR: 0,264 (2009)
- SNIP: 0,298 (2009)
- Impacto JCR a 5 años: 2,695
- Categorías JCR: MATERIALS SCIENCE, MULTIDISCIPLINARY
- Categorías SJR: Instrumentation (Q3)
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Ribosome-associated vesicles: A dynamic subcompartment of the endoplasmic reticulum in secretory cells
- Carter S.D.
- Hampton C.M.
- Langlois R.
- Melero R.
- Farino Z.J.
- Calderon M.J.
- Li W.
- Wallace C.T.
- Tran N.H.
- Grassucci R.A.
- Siegmund S.E.
- Pemberton J.
- Morgenstern T.J.
- Eisenman L.
- Aguilar J.I.
- Greenberg N.L.
- Levy E.S.
- Yi E.
- Mitchell W.G.
- Rice W.J.
- Wigge C.
- Pilli J.
- George E.W.
- Aslanoglou D.
- Courel M.
- Freyberg R.J.
- Javitch J.A.
- Wills Z.P.
- Area-Gomez E.
- Shiva S.
- Bartolini F.
- Volchuk A.
- Murray S.A.
- Aridor M.
- Fish K.N.
- Walter P.
- Balla T.
- Fass D.
- Wolf S.G.
- Watkins S.C.
- Carazo J.M.
- Jensen G.J.
- Frank J.
- Freyberg Z.
Science Advances - 1/4/2020
- Cuartil JCR: Q1 (2020)
- Factor Impacto JCR: 14,143 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 1,359 (2020)
- CiteScore: 16,6 (2020)
- SJR: 5,928 (2020)
- SNIP: 3,445 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 16,45
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
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- Web of Science
Splines in Biomedical Image Processing
- Jonic S.
- Sorzano C.
Optical and Digital Image Processing: Fundamentals and Applications - 29/4/2011
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Soft X-ray tomography imaging for biological samples
- Otón J.
- Sorzano C.
- Chichón F.
- Carrascosa J.
- Carazo J.
- Marabini R.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy
- Sorzano C.
- De La Rosa Trevín J.
- Otón J.
- Vega J.
- Cuenca J.
- Zaldívar-Peraza A.
- Gómez-Blanco J.
- Vargas J.
- Quintana A.
- Marabini R.
- Carazo J.
Methods in Molecular Biology - 1/1/2013
- Cuartil SJR: Q3
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,751 (2013)
- SNIP: 0,362 (2013)
- Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)
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Processing of Transmission Electron Microscopy Images for Single-Particle Analysis of Macromolecular Complexes
- Devaux, Zaelle
- Sorzano, Carlos Oscar S.
- Jonic, Slavica
- Conn, PM
Methods in Cell Biology - 1/1/2012
10.1016/b978-0-12-405914-6.00016-0 Ver en origen
- Cuartil JCR: Q2 (2012)
- Factor Impacto JCR: 1,444 (2012)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,027 (2012)
- CiteScore: 2,8 (2020)
- SJR: 0,908 (2012)
- Impacto JCR a 5 años: 1,932
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
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- Web of Science
Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards
- Sorzano C.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Otón J.
- Cuenca-Alba J.
- Quintana A.
- de la Rosa-Trevín J.
- Carazo J.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
- Sorzano C.O.S.
- Jiménez-Moreno A.
- Maluenda D.
- Ramírez-Aportela E.
- Martínez M.
- Cuervo A.
- Melero R.
- Conesa J.J.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Filipovic J.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.
- Herreros D.
- Conesa P.
- del Caño L.
- Fonseca Y.
- de la Morena J.J.
- Macías J.R.
- Losana P.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
Methods in Molecular Biology - 1/1/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,711 (2020)
- SNIP: 0,57 (2020)
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- Web of Science
Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy
- Carazo J.
- Herman G.
- Sorzano C.
- Marabini R.
Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006
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Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities
- de la Rosa-Trevin, J. M.
- Gomez-Blanco, J.
- Conesa, P.
- Rancel, Y.
- del Cano, L.
- Arranz, R.
- Chichon, F. J.
- Martin-Benito, J.
- Carroni, M.
- Fleichman, S.
- Lindahl, E.
- Basham, M.
- Clare, D. K.
- Savage, K.
- Siebert, C. A.
- Ashton, A. W.
- Marabini, R.
- Sorzano, C. O. S.
- Carazo, J. M.
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018
- Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
- Impacto JCR a 5 años: 4,647
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
- ORCID
- Web of Science
Molecular image registration using mutual information and differential evolution optimization
- Telenczuk, Bartosz
- Ledesma-Carbayo, Marta J.
- Velazquez-Muriel, Javier A.
- Sorzano, Carlos O. S.
- Carazo, Jose-Maria
- Santos, Andres
- IEEE
2006 3rd Ieee International Symposium On Biomedical Imaging: From Nano To Macro - Proceedings - 17/11/2006
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution
- Ramirez-Aportela, E.
- Vilas, J. L.
- Carazo, J. M.
- Sanchez Sorzano, C. O.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
- Impacto JCR a 5 años: 1,888
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
- ORCID
- Web of Science
Intelligent alarms for patient supervision
- Otero A.
- Félix P.
- Palacios F.
- Pérez-Gandía C.
- Sorzano C.
2007 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, CONFERENCE PROCEEDINGS BOOK - 1/12/2007
10.1109/wisp.2007.4447555 Ver en origen
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Improving 3D reconstructions of macromolecular conformations
- Kazemi, M.
- Sorzano, C. O. S.
- Georges, A. Des
- Carazo, J. M.
- Vargas, J.
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018
- Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
- Impacto JCR a 5 años: 4,647
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
- ORCID
- Web of Science
Grid computing in 3D-EM image processing using Xmipp
- Scheres, SHW
- Merino, AJ
- Sorzano, COS
- Carazo, JM
- IEEE Comp Soc
Proceedings - Ieee Symposium On Computer-based Medical Systems - 10/11/2005
10.1109/cbms.2005.60 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
- SJR: 0,194 (2005)
- SNIP: 0,374 (2005)
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- Web of Science
Flexible image registration for the identification of best fitted protein models in 3D-EM maps
- Fernandez-de-Manuell, Laura
- Ledesma-Carbayol, Maria J.
- Atienza-Herrero, Julian
- Sorzano, Carlos O. S.
- Carazo, Jose-Maria
- Santos, Andres
- IEEE
2008 5th Ieee International Symposium On Biomedical Imaging: From Nano To Macro, Proceedings, Isbi - 10/05/2008
10.1109/isbi.2008.4541163 Ver en origen
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- Web of Science
Electric-potential reconstructions of single particles using L <sup>2</sup>-gradient flows
- Li M.
- Xu G.
- Sorzano C.
- Melero R.
- Bajaj C.
Proceedings - 2010 3rd International Conference on Biomedical Engineering and Informatics, BMEI 2010 - 1/12/2010
- Categorías SJR: Biomedical Engineering; Health Informatics; Health Information Management
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Electric-Potential Reconstructions of Single Particles Using L-2-Gradient Flows
- Li, Ming
- Xu, Guoliang
- Sorzano, Carlos O. S.
- Melero, Roberto
- Bajaj, Chandrajit
- Yu, W
- Zhang, M
- Wang, L
- Song, Y
2010 3RD INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOMEDICAL ENGINEERING AND INFORMATICS (BMEI 2010), VOLS 1-7 - 2010
Elastic image registration with applications to proteomics
- Sorzano, C. O. S.
- Thevenaz, P.
- Valdes, I.
- Beloso, A.
- Unser, M.
- Cristobal, G
- Javidi, B
- Vallmitjana, S
INFORMATION OPTICS - 1/12/2006
10.1063/1.2361232 Ver en origen
- CiteScore: 0,7 (2020)
- SJR: 0,184 (2006)
- SNIP: 0,204 (2006)
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Este autor no tiene patentes.
Unraveling the Power of NAP-CNB’s Machine Learning-enhanced Tumor Neoantigen Prediction
- Almudena Mendez-Perez
- Andres M Acosta-Moreno
- Carlos Wert-Carvajal
- Pilar Ballesteros-Cuartero
- Ruben Sanchez-Garcia
- Jose R Macias
- Rebeca Sanz-Pamplona
- Ramon Alemany
- Carlos Oscar S Sorzano
- Arrate Munoz-Barrutia
- Esteban Veiga
22/11/2023
- ORCID
The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation
- Tiziana Ginex
- Clara Marco-Marín
- Miłosz Wieczór
- Carlos P. Mata
- James Krieger
- Maria Luisa López-Redondo
- Clara Francés-Gómez
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Roberto Melero
- Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
- Marta Martínez
- Nadine Gougeard
- Alicia Forcada-Nadal
- Sara Zamora-Caballero
- Roberto Gozalbo-Rovira
- Carla Sanz-Frasquet
- Jeronimo Bravo
- Vicente Rubio
- Alberto Marina
- Ron Geller
- Iñaki Comas
- Carmen Gil
- Mireia Coscolla
- Modesto Orozco
- José Luis Llácer
- José-Maria Carazo
PLoS Pathogens - 7/12/2021
- Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 7,913
- Categorías JCR: VIROLOGY
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- Web of Science
Statistical experiment design for animal research
- Carlos Oscar S. Sorzano
2/06/2023
- ORCID
Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing
- James Michael Krieger
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo
International Journal of Molecular Sciences - 10/08/2023
- CiteScore: 7,8 (2022)
- SJR: 1,154 (2022)
- SNIP: 1,263 (2022)
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- Web of Science
Removal of the C6 vaccinia virus interferon-β inhibitor in the hepatitis C vaccine candidate MVA-HCV elicited in mice high immunogenicity in spite of reduced host gene expression
- Q. Marín M
- Pérez P
- Gómez CE
- S. Sorzano CO
- Esteban M
- García-Arriaza J
05/2018
- ORCID
Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis
- Vargas J
- Melero R
- Gomez-Blanco J
- Carazo J
- Sorzano COS
11/2016
- ORCID
NAP-CNB: Bioinformatic pipeline to predict MHC-I-restricted T cell epitopes in mice
- Carlos Wert-Carvajal
- Rubén Sánchez-García
- José R Macías
- Rebeca Sanz-Pamplona
- Almudena Méndez Pérez
- Ramon Alemany
- Esteban Veiga Chacón
- Carlos Óscar S. Sorzano
- Arrate Muñoz-Barrutia
5/10/2020
- ORCID
Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19
- Sorzano co
- Crisman E
- Carazo JM
- leon r
15/07/2020
- ORCID
Improvements on marker-free images alignment for electron tomography
- C.O.S. Sorzano
- F. de Isidro-Gómez
- E. Fernández-Giménez
- D. Herreros
- S. Marco
- J.M. Carazo
- C. Messaoudi
Journal of Structural Biology: X - 24/05/2020
- Cuartil SJR: Q4
- Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,474
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q4)
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Growth hormone remodels the 3D-structure of the mitochondria of inflammatory macrophages and promotes metabolic reprogramming
- Blanca Soler Palacios
- Ricardo Villares
- Pilar Lucas
- Jose Miguel Rodriguez Frade
- Ana Cayuela
- Jonathan Gabriel Piccirillo
- David Delgado Gestoso
- Cristina Risco
- Fernando Corrales
- Carlos Oscar S Sorzano
- Nuria Martinez
- Jose Javier Conesa
- Francisco J. Iborra
- Mario Mellado
Frontiers in Immunology - 22/08/2022
- Factor Impacto JCR: 7,3 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 8
- Categorías JCR: IMMUNOLOGY
- Scopus
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Índice h
Scopus: 36
Web of Science: 42
Índice i10
Scopus: 129
Web of Science: 163
Perfiles de autor
-
ORCID
-
Web of Science ResearcherID
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Scopus Author ID
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Dialnet id
-
Google Scholar Id
Otros identificadores
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URI Datos BNE
Proyectos de investigación en la UAL
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Acrónimo P10-TIC-06002Desde: 15 de marzo de 2011Hasta: 15 de marzo de 2014Financiado por: JUNTAImporte de financiación: 105.730,00 EURRol: Investigador
-
Acrónimo 99109Desde: 2 de junio de 1999Hasta: 2 de junio de 2000Financiado por: Ministerio de Asuntos ExterioresImporte de financiación: 19.232,39 EURRol: Investigador