Marabini Ruiz, Roberto Autor

Publicaciones

Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion

  • Martínez M.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Melero R.
  • Cuervo A.
  • Conesa P.
  • Del Caño L.
  • Fonseca Y.C.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Conesa J.J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro F.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Marabini R.
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Journal of chemical information and modeling - 26/5/2020

10.1021/acs.jcim.9b01032

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)

Re-examining the spectra of macromolecules. Current practice of spectral quasi B-factor flattening

  • Vilas J.L.
  • Vargas J.
  • Martinez M.
  • Ramirez-Aportela E.
  • Melero R.
  • Jimenez-Moreno A.
  • Garduño E.
  • Conesa P.
  • Marabini R.
  • Maluenda D.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
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Journal of Structural Biology - 1/3/2020

10.1016/j.jsb.2020.107447

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)

Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps

  • Ramírez-Aportela E.
  • Vilas J.
  • Glukhova A.
  • Melero R.
  • Conesa P.
  • Martínez M.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Jiménez A.
  • Vargas J.
  • Marabini R.
  • Sexton P.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
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Bioinformatics (Oxford, England) - 1/2/2020

10.1093/bioinformatics/btz671

Número de citas: 14 (Web of Science) 9 (Scopus)

Measurement of local resolution in electron tomography

  • Vilas J.
  • Oton J.
  • Messaoudi C.
  • Melero R.
  • Conesa P.
  • Ramirez-Aportela E.
  • Mota J.
  • Martinez M.
  • Jimenez A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Vargas J.
  • Sorzano C.
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Journal of Structural Biology: X - 1/1/2020

10.1016/j.yjsbx.2019.100016

Número de citas: 1 (Scopus)

Validation of electron microscopy initial models via small angle X-ray scattering curves

  • Jiménez A.
  • Jonic S.
  • Majtner T.
  • Otón J.
  • Vilas J.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Rancel Y.
  • Segura J.
  • Sánchez-García R.
  • Melero R.
  • Del Cano L.
  • Conesa P.
  • Skjaerven L.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
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Bioinformatics - 15/7/2019

10.1093/bioinformatics/bty985

Número de citas: 0 (Scopus)

Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion

  • Maluenda D.
  • Majtner T.
  • Horvath P.
  • Vilas J.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Mota J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Sánchez-García R.
  • Conesa P.
  • Del Caño L.
  • Rancel Y.
  • Fonseca Y.
  • Martínez M.
  • Sharov G.
  • García C.
  • Strelak D.
  • Melero R.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
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Acta Crystallographica Section D: Structural Biology - 1/10/2019

10.1107/s2059798319011860

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)

Survey of the analysis of continuous conformational variability of biological macromolecules by electron microscopy

  • Sorzano C.
  • Jiménez A.
  • Mota J.
  • Vilas J.
  • Maluenda D.
  • Martínez M.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Majtner T.
  • Segura J.
  • Sánchez-García R.
  • Rancel Y.
  • Del Caño L.
  • Conesa P.
  • Melero R.
  • Jonic S.
  • Vargas J.
  • Cazals F.
  • Freyberg Z.
  • Krieger J.
  • Bahar I.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications - 1/1/2019

10.1107/s2053230x18015108

Número de citas: 11 (Web of Science) 15 (Scopus)

Blind estimation of DED camera gain in Electron Microscopy

  • Sorzano C.
  • Fernández-Giménez E.
  • Peredo-Robinson V.
  • Vargas J.
  • Majtner T.
  • Caffarena G.
  • Otón J.
  • Vilas J.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Melero R.
  • Gómez-Blanco J.
  • Cuenca J.
  • del Cano L.
  • Conesa P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Journal of Structural Biology - 1/8/2018

10.1016/j.jsb.2018.03.007

Número de citas: 3 (Web of Science) 3 (Scopus)
Open Access

MonoRes: Automatic and Accurate Estimation of Local Resolution for Electron Microscopy Maps

  • Vilas J.
  • Gómez-Blanco J.
  • Conesa P.
  • Melero R.
  • Miguel de la Rosa-Trevín J.
  • Otón J.
  • Cuenca J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Vargas J.
  • Sorzano C.
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Structure - 6/2/2018

10.1016/j.str.2017.12.018

Número de citas: 51 (Web of Science) 57 (Scopus)

Map challenge: Analysis using a pair comparison method based on Fourier shell correlation

  • Marabini R.
  • Kazemi M.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.

Journal of Structural Biology - 1/12/2018

10.1016/j.jsb.2018.09.009

Número de citas: 3 (Scopus)

New computational methods toward atomic resolution in single particle cryo-electron microscopy

  • Vahid Abrishami
  • Carlos Óscar Sánchez Sorzano
  • José María Carazo García
  • Roberto Marabini Ruiz

2016

Número de citas: 0 (Dialnet)
  • Dialnet

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 2 (Web of Science) 3 (Scopus)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)

Procesamiento automatizado de datos proteómicos: Desde la espectrometría de masas al conocimiento biológico

  • Juan Alberto Medina Auñón
  • Juan Pablo Albar
  • José María Carazo García
  • Roberto Marabini Ruiz

2013

Número de citas: 0 (Dialnet)
  • Dialnet

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 17 (Scopus)

Clasificación y alineamiento de imágenes obtenidas mediante microscopia electrónica

  • Roberto Marabini Ruiz
  • José María Carazo García

1994

Número de citas: 0 (Dialnet)
  • Dialnet

Iterative Reconstruction for PET scanners with continuous scintillators

  • Iriarte A.
  • Caffarena G.
  • Lopez-Fernandez M.
  • Garcia-Carmona R.
  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.
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2015 37TH ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE ENGINEERING IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY (EMBC) - 4/11/2015

10.1109/embc.2015.7318842

Número de citas: 0 (Scopus)

AN IMAGE PROCESSING APPROACH TO THE SIMULATION OF ELECTRON MICROSCOPY VOLUMES OF ATOMIC STRUCTURES

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • De La Rosa-Trevin, J.M.
  • Del Riego, S.
  • Fernandez-Alderete, A.
  • Martinez-Rey, C.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
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2014 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON IMAGE PROCESSING (ICIP) - 28/1/2014

10.1109/icip.2014.7025420

Número de citas: 0 (Scopus)

Image processing for Cellular tomography using soft X-rays

  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Cuenca, J.
  • Zaldivar-Perez, A.
  • Caffarena, G.
  • Sanchez-Jimenez, J.
  • Messaoudi, C.
  • Marco, S.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE
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2012 9TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING (ISBI) - 2012

Effects of the Downsampling Scheme on Three-dimensional Electron Microscopy of Single Particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009: 6TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, PROCEEDINGS - 10/12/2009

10.1109/wisp.2009.5286563

Número de citas: 3 (Scopus)

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8

Número de citas: 167 (Web of Science) 165 (Scopus)

3D reconstruction of 2D crystals from projections in real space

  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • Fernandez, JJ
  • Matej, S
  • IEEE
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2002 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING, PROCEEDINGS - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029351

Número de citas: 1 (Scopus)

Volumetric constraints in 3D tomography applied to electron microscopy

  • Marabini R.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.

2002 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING, PROCEEDINGS - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029339

Número de citas: 5 (Scopus)

Effects of uneven sampling in 3D reconstructions.

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Rietzel, E
  • Schroeder, R
  • Herman, GT
  • Boisset, N
  • Benavides, HAC
  • Yacaman, MJ
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ELECTRON MICROSCOPY 1998, VOL 1 - 1998

Zero-loss P-contrast in EFTEM

  • Rietzel, E
  • Schorsch, P
  • Muller, H
  • Marabini, R
  • Sorzano, C
  • Carazo, JM
  • Schimpf, U
  • Leue, C
  • Holmes, KC
  • Schroder, RR
  • Benavides, HAC
  • Yacaman, MJ
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ELECTRON MICROSCOPY 1998, VOL 4 - 1998

Three-dimensional reconstruction from reduced sets of very noisy images acquired following a single-axis tilt schema: Application of a new three-dimensional reconstruction algorithm and objective comparison with weighted backprojection

  • Marabini, R.
  • Rietzel, E.
  • Schroeder, R.
  • Herman, G.T.
  • Carazo, J.M.

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/1997

10.1006/jsbi.1997.3923

Número de citas: 44 (Web of Science) 49 (Scopus)

Este autor no tiene patentes.

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Scopus: 21

Web of Science: 21

  • Acrónimo P10-TIC-06002
    Desde: 15 de marzo de 2011
    Hasta: 15 de marzo de 2014
    Financiado por: Consejería de Innovación, Ciencia y Empresa
    Importe de financiación: 105.730,00 EUR
    Rol: Investigador
El autor no tiene palabras clave.
  • El histórico del autor está vacío.
Última actualización de los datos: 17/10/20 15:30
Próxima recolección programada: 24/10/20 3:00