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Marabini Ruiz, Roberto Autor

3D Cryo-Electron Reconstruction of BmrA, a Bacterial Multidrug ABC Transporter in an Inward-Facing Conformation and in a Lipidic Environment

  • Fribourg, Pierre Frederic
  • Chami, Mohamed
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Gubellini, Francesca
  • Marabini, Roberto
  • Marco, Sergio
  • Jault, Jean-Michel
  • Levy, Daniel
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JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY - 15/05/2014

10.1016/j.jmb.2014.03.002 Ver en origen

Número de citas: 21 (Web of Science) 21 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,333 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,657 (2014)
  • CiteScore: 8,5 (2020)
  • SJR: 2,823 (2014)
  • SNIP: 1,107 (2014)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,702
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)

3D reconstruction in electron microscopy using ART with smooth spherically symmetric volume elements (blobs)

  • Marabini, R.
  • Herman, G.T.
  • Carazo, J.M.

Ultramicroscopy - 1/04/1998

10.1016/s0304-3991(97)00127-7 Ver en origen

Número de citas: 122 (Web of Science) 132 (Scopus)
  • CiteScore: 5 (2020)

3D reconstruction of 2D crystals from projections in real space

  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • Fernandez, JJ
  • Matej, S
  • IEEE
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2002 Ieee International Symposium on Biomedical Imaging, Proceedings - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029351 Ver en origen

Número de citas: 1 (Scopus)

3-D reconstruction of 2-D crystals in real space

  • Marabini, R
  • Sorzano, COS
  • Matej, S
  • Fernandez, JJ
  • Carazo, JM
  • Herman, GT

IEEE Transactions on Image Processing - 1/04/2004

10.1109/tip.2003.822620 Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2004)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,011 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,483 (2004)
  • CiteScore: 16,3 (2020)
  • SJR: 1,315 (2004)
  • SNIP: 4,401 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Graphics and Computer-Aided Design (Q1); Software (Q1)

A clustering approach to multireference alignment of single-particle projections in electron microscopy

  • Sorzano, C. O. S.
  • Bilbao-Castro, J. R.
  • Shkolnisky, Y.
  • Alcorlo, M.
  • Melero, R.
  • Caffarena-Fernandez, G.
  • Li, M.
  • Xu, G.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/08/2010

10.1016/j.jsb.2010.03.011 Ver en origen

Número de citas: 163 (Web of Science) 142 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2010)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,5 (2010)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 3,397 (2010)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,631 (2010)
  • SNIP: 1,091 (2010)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,152
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Advances in xmipp for cryo–electron microscopy: From xmipp to scipion

  • Strelak D.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Sánchez-García R.
  • Maluenda D.
  • Vargas J.
  • Herreros D.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.P.
  • Horacek J.
  • Myska D.
  • Horacek M.
  • Conesa P.
  • Fonseca-Reyna Y.C.
  • Jiménez J.
  • Martínez M.
  • Harastani M.
  • Jonić S.
  • Filipovic J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
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MOLECULES - 1/10/2021

10.3390/molecules26206224

Número de citas: 17 (Web of Science)
  • Factor Impacto JCR: 4,927 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,11
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

A fast iterative convolution weighting approach for gridding-based direct Fourier three-dimensional reconstruction with correction for the contrast transfer function

  • Abrishami, V.
  • Bilbao-Castro, J. R.
  • Vargas, J.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.

Ultramicroscopy - 1/10/2015

10.1016/j.ultramic.2015.05.018 Ver en origen

Número de citas: 23 (Web of Science) 17 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,874 (2015)
  • CiteScore: 5 (2020)
  • SJR: 2,066 (2015)
  • SNIP: 1,304 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,63
  • Categorías JCR: MICROSCOPY
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1); Electronic, Optical and Magnetic Materials (Q1); Instrumentation (Q1)

Algorithmic robustness to preferred orientations in single particle analysis by CryoEM

  • Sorzano C.O.S.
  • Semchonok D.
  • Lin S.C.
  • Lo Y.C.
  • Vilas J.L.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Gragera M.
  • Vacca S.
  • Maluenda D.
  • Martínez M.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Melero R.
  • Cuervo A.
  • Conesa J.J.
  • Conesa P.
  • Losana P.
  • Caño L.d.
  • de la Morena J.J.
  • Fonseca Y.C.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro F.
  • Herreros D.
  • Kastritis P.L.
  • Marabini R.
  • Bruce B.D.
  • Carazo J.M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/3/2021

10.1016/j.jsb.2020.107695

Número de citas: 14 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Factor Impacto JCR: 3,234 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,479 (2021)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,564 (2020)
  • SNIP: 1,018 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,064
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY

Alignment of direct detection device micrographs using a robust Optical Flow approach

  • Abrishami, Vahid
  • Vargas, Javier
  • Li, Xueming
  • Cheng, Yifan
  • Marabini, Roberto
  • Sanchez Sorzano, Carlos Oscar
  • Maria Carazo, Jose
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/03/2015

10.1016/j.jsb.2015.02.001 Ver en origen

Número de citas: 49 (Web of Science) 45 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,57 (2015)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 3,448 (2015)
  • SNIP: 1,109 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,067
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

A new algorithm for high-resolution reconstruction of single particles by electron microscopy

  • Sorzano C.
  • Vargas J.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Jiménez A.
  • Maluenda D.
  • Melero R.
  • Martínez M.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Conesa P.
  • Vilas J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2018

10.1016/j.jsb.2018.08.002

Número de citas: 22 (Web of Science) 15 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2018)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,754 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,891 (2018)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 5,254 (2018)
  • SNIP: 1,207 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,522
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
Open Access

A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images

  • Merelo, JJ
  • Prieto, A
  • Moran, F
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Mira, J
  • MorenoDiaz, R
  • Cabestany, J
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Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997

10.1007/bfb0032577 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

An image processing approach to the simulation of electron microscopy volumes of atomic structures

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • De La Rosa-Trevin, J.M.
  • Del Riego, S.
  • Fernandez-Alderete, A.
  • Martinez-Rey, C.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
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2014 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2014 - 28/01/2014

10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen

Número de citas:
  • Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Electron tomography of biological specimens

  • Marabini R.
  • Carmen San Martin M.
  • Carazo J.

Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997

10.3233/978-1-60750-874-8-53

Número de citas: 2 (Scopus)
  • CiteScore: 1,2 (2020)

Este autor no tiene patentes.

Biological structure determination by EM is well suited to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/06/2004

10.1007/bf03040957

Número de citas:
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,854 (2022)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,556 (2004)
  • SNIP: 1,19 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
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FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,4
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

On the suitability of biological structure determination by electron microscopy to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/03/2005

10.1007/bf03037653

Número de citas: 7 (Web of Science) 6 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q3 (2005)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,5 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,442 (2005)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,6 (2005)
  • SNIP: 1,719 (2005)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Scopus: 23

Web of Science: 27

Scopus: 57

Web of Science: 69

Última actualización de los datos: 15/04/24 7:47
Próxima recolección programada: 20/04/24 3:00