RDF/XML JSON-LD N3/Turtle RDF/JSON

Carazo García, José María Autor

3DBIONOTES: A unified, enriched and interactive view of macromolecular information

  • Tabas-Madrid, D.
  • Segura, J.
  • Sanchez-Garcia, R.
  • Cuenca-Alba, J.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.

Journal of Structural Biology - 1/05/2016

10.1016/j.jsb.2016.02.007 Ver en origen

Número de citas: 6 (Web of Science) 6 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,767 (2016)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,732 (2016)
  • SNIP: 0,904 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,235
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

3DBionotes COVID-19 Edition.

  • Macias JR
  • Sanchez-Garcia R
  • Conesa P
  • Ramirez-Aportela E
  • Martinez Gonzalez M
  • Wert-Carvajal C
  • Parra-Perez AM
  • Segura Mora J
  • Horrell S
  • Thorn A
  • Carazo JM
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Bioinformatics (Oxford, England) - 15/05/2021

10.1093/bioinformatics/btab397

Número de citas: 1 (Web of Science)

3DBIONOTES v2.0: A web server for the automatic annotation of macromolecular structures

  • Segura, Joan
  • Sanchez-Garcia, Ruben
  • Martinez, Marta
  • Cuenca-Alba, Jesus
  • Tabas-Madrid, Daniel
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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Bioinformatics - 15/11/2017

10.1093/bioinformatics/btx483 Ver en origen

Número de citas: 14 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,481 (2017)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 6,14 (2017)
  • SNIP: 2,546 (2017)
  • Impacto JCR a 5 años: 8,561
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)

3DBIONOTES v3.0: Crossing molecular and structural biology data with genomic variations

  • Segura J.
  • Sanchez-Garcia R.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.
  • Valencia A.

Bioinformatics - 15/09/2019

10.1093/bioinformatics/btz118

Número de citas: 9 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,61 (2019)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 3,567 (2019)
  • SNIP: 1,864 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 9,853
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)
Open Access

3DCONS-DB: A Database of Position-Specific Scoring Matrices in Protein Structures

  • Sanchez-Garcia, Ruben
  • Sanchez Sorzano, Carlos Oscar
  • Maria Carazo, Jose
  • Segura, Joan

MOLECULES - 1/12/2017

10.3390/molecules22122230 Ver en origen

Número de citas: 29 (Web of Science) 15 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2017)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,468 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,456 (2017)
  • CiteScore: 3,4 (2020)
  • SJR: 0,818 (2018)
  • SNIP: 1,19 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,268
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Analytical Chemistry (Q1); Chemistry (miscellaneous) (Q1); Pharmaceutical Science (Q1); Drug Discovery (Q2); Medicine (miscellaneous) (Q2); Organic Chemistry (Q2); Physical and Theoretical Chemistry (Q2); Molecular Medicine (Q3)
Open Access

3DIANA: 3D Domain Interaction Analysis: A Toolbox for Quaternary Structure Modeling

  • Segura, Joan
  • Sanchez-Garcia, Ruben
  • Tabas-Madrid, Daniel
  • Cuenca-Alba, Jesus
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Maria Carazo, Jose

Biophysical Journal - 23/02/2016

10.1016/j.bpj.2015.11.3519 Ver en origen

Número de citas: 13 (Web of Science) 11 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,656 (2016)
  • CiteScore: 6,3 (2020)
  • SJR: 1,988 (2016)
  • SNIP: 1,042 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,743
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Biophysics (Q1)

3D reconstruction in electron microscopy using ART with smooth spherically symmetric volume elements (blobs)

  • Marabini, R.
  • Herman, G.T.
  • Carazo, J.M.

Ultramicroscopy - 1/04/1998

10.1016/s0304-3991(97)00127-7 Ver en origen

Número de citas: 122 (Web of Science) 132 (Scopus)
  • CiteScore: 5 (2020)

3D reconstruction of 2D crystals from projections in real space

  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • Fernandez, JJ
  • Matej, S
  • IEEE
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2002 Ieee International Symposium on Biomedical Imaging, Proceedings - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029351 Ver en origen

Número de citas: 1 (Scopus)

3-D reconstruction of 2-D crystals in real space

  • Marabini, R
  • Sorzano, COS
  • Matej, S
  • Fernandez, JJ
  • Carazo, JM
  • Herman, GT

IEEE Transactions on Image Processing - 1/04/2004

10.1109/tip.2003.822620 Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2004)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,011 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,483 (2004)
  • CiteScore: 16,3 (2020)
  • SJR: 1,315 (2004)
  • SNIP: 4,401 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Graphics and Computer-Aided Design (Q1); Software (Q1)

A clustering approach to multireference alignment of single-particle projections in electron microscopy

  • Sorzano, C. O. S.
  • Bilbao-Castro, J. R.
  • Shkolnisky, Y.
  • Alcorlo, M.
  • Melero, R.
  • Caffarena-Fernandez, G.
  • Li, M.
  • Xu, G.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/08/2010

10.1016/j.jsb.2010.03.011 Ver en origen

Número de citas: 163 (Web of Science) 142 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2010)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,5 (2010)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 3,397 (2010)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,631 (2010)
  • SNIP: 1,091 (2010)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,152
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
Open Access

A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images

  • Merelo, JJ
  • Prieto, A
  • Moran, F
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Mira, J
  • MorenoDiaz, R
  • Cabestany, J
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Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997

10.1007/bfb0032577 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

AN INTRODUCTION TO MAXIMUM-LIKELIHOOD METHODS IN CRYO-EM

  • Sigworth, Fred J.
  • Doerschuk, Peter C.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Scheres, Sjors H. W.
  • Jensen, GJ

Methods in Enzymology - 1/1/2010

10.1016/s0076-6879(10)82011-7

Número de citas: 67 (Web of Science) 52 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 1,626 (2010)
  • CiteScore: 2,6 (2020)
  • SJR: 1,408 (2010)
  • SNIP: 0,493 (2010)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,185
  • Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS

Exploring the conformational flexibility of molecular machines

  • Sjors Scheres
  • Herman, Gabor T.
  • Jose Maria Carazo Garcia

Mathematical Methods In Biomedical Imaging and Intensity-modulated Radiation Therapy (imrt) - 2008

  • ORCID
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Interchanging geometry information in electron microscopy single particle analysis: mathematical context for the development of a standard.

  • Carlos Oscar S. Sorzano
  • Roberto Marabini
  • J. Vargas
  • J. Otón
  • J. Cuenca-Alba
  • A. Quintana
  • J.M. de la Rosa-Trevín
  • Jose Maria Carazo Garcia
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Computational Methods For Three-dimensional Microscopy Reconstruction - 2014

  • ORCID
Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Biological sequence analysis on distributed-shared memory multiprocessors

  • Rodriguez A.
  • de la Fraga L.G.
  • Zapata E.L.
  • Carazo J.M.
  • Trelles O.

Proceedings of The 6th Euromicro Workshop On Parallel and Distributed Processing, Pdp 1998 - 1/1/1998

10.1109/empdp.1998.647174

Número de citas: 1 (Scopus)

CBR-Tagger: A case-based reasoning approach to the gene/protein mention problem

  • Neves M.
  • Chagoyen M.
  • Carazo J.M.
  • Pascual-Montano A.

Bionlp 2008 - Current Trends In Biomedical Natural Language Processing, Proceedings of The Workshop - 1/1/2008

Número de citas: 3 (Scopus)
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Double Hexamer Structure Of The Archaeal Helicase MCM From Methanobacterium Thermoautotrophicum

  • Gomez-Llorente, Yacob
  • Fletcher, Ryan J.
  • Chen, Xiaojiang S.
  • Jose Maria Carazo Garcia
  • Carmen San Martín

Biophysical Journal - 02/2009

10.1016/j.bpj.2008.12.252

  • ORCID

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing

Electron tomography of biological specimens

  • Marabini R.
  • Carmen San Martin M.
  • Carazo J.

Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997

10.3233/978-1-60750-874-8-53

Número de citas: 2 (Scopus)
  • CiteScore: 1,2 (2020)

Evolutionary genomics of SARS-CoV-2: key for viral success

  • Álvarez-Herrera, M.
  • Jose Maria Carazo Garcia
  • Comas I
  • Coscollà, M.
  • Santiago F. Elena
  • Francés-Gómez, C.
  • Franco, M.L.
  • García Rasines, D.
  • Geller, R.
  • Carmen Gil
  • Fernando Gonzalez-Candelas
  • Hillung, J.
  • José Luis Llácer
  • Marina, A.
  • Marqués, M.C.
  • Naveiro Flores, R.
  • Ríos, D.
  • Rodríguez Santana, S.
  • Paula Ruiz-Rodriguez
  • Carlos Oscar S. Sorzano
  • Ulzurum, E.
  • Vidal, M.
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44º Congreso Nacional de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular - 2022

  • ORCID

Extending the incorporation of superfamily structural information in the process of flexible fitting in 3D-EM

  • Velázquez-Muriel J.
  • Carazo J.

2005 Ieee Computational Systems Bioinformatics Conference, Workshops and Poster Abstracts - 1/12/2005

10.1109/csbw.2005.65

Número de citas:
  • Categorías SJR: Engineering (miscellaneous)
Open Access

Extracting and normalizing gene/protein mentions with the flexible and trainable Moara Java library

  • Neves M.
  • Carazo J.
  • Pascual-Montano A.

Lecture Notes In Computer Science - 25/6/2010

10.1007/978-3-642-13131-8_9

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 1,433 (2010)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,322 (2010)
  • SNIP: 0,674 (2010)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,27
  • Categorías JCR: COMPUTER SCIENCE, INFORMATION SYSTEMS

Extracting and searching for structural information: A multiresolution approach

  • Jimenez-Lozano, N
  • Monica Chagoyen
  • De-Alarcon, PA
  • Jose Maria Carazo Garcia

Methods In Proteome and Protein Analysis - 2004

  • ORCID

Este autor no tiene patentes.

Open Access

Accessing Information on the Conformational Flexibility of Molecular Machines

  • Carazo, JM

Structure - 1/02/2004

10.1016/j.str.2004.01.017

Número de citas: 3 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 9 (2020)
  • SJR: 4,47 (2004)
  • SNIP: 1,507 (2004)
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)

Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps.

  • Ramirez-Aportela E
  • Vilas JL
  • Melero R
  • Conesa P
  • Martinez M
  • Maluenda D
  • Mota J
  • Jimenez A
  • Vargas J
  • Marabini R
  • Carazo JM
  • Sorzano COS
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10/2018

10.1101/433284

  • ORCID

A variant to the \'random approximation\' of the reference-free alignment algorithm

  • Marco S.
  • Chagoyen M.
  • De La Fraga L.
  • Carazo J.
  • Carrascosa J.

Ultramicroscopy - 1/11/1996

10.1016/s0304-3991(96)00083-6

Número de citas: 62 (Scopus)
  • CiteScore: 5 (2020)

Biological structure determination by EM is well suited to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/06/2004

10.1007/bf03040957

Número de citas:
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,854 (2022)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,556 (2004)
  • SNIP: 1,19 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing

  • Ruben Sanchez Garcia
  • Josue Gomez-Blanco
  • Ana Cuervo
  • Jose Maria Carazo
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Javier Vargas

13/06/2020

10.1101/2020.06.12.148296

  • ORCID

Dynamic Kinetochore Size Regulation Promotes Microtubule Capture And Chromosome Biorientation In Mitosis

  • Sacristan C
  • Ahmad M
  • Keller J
  • Fermie J
  • Groenewold V
  • Tromer E
  • Fish A
  • Melero R
  • Carazo JM
  • Klumperman J
  • Musacchio A
  • Perrakis A
  • Kops GJ
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03/2018

10.1101/279398

  • ORCID

ENRICH: a fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M
  • Sorzano COS
  • Des Georges A
  • Carazo JM
  • Vargas J

08/2018

10.1101/400317

  • ORCID
Open Access

ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Georges A.d.
  • Abrishami V.
  • Vargas J.

Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021

10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001

Número de citas: 2 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 0,859 (2020)
  • SNIP: 0,995 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,907
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Open Access

Erratum: Crystal structure of a near-full-length archaeal MCM: Functional insights for an AAA+ hexameric helicase (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (2008) 23:51 (20191-20196))

  • Brewster A.
  • Wang G.
  • Yu X.
  • Greenleaf W.
  • Carazo J.
  • Tjajadi M.
  • Klein M.
  • Chen X.
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PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA - 7/4/2009

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 9,432 (2009)
  • CiteScore: 16,2 (2020)
  • SJR: 7,025 (2009)
  • SNIP: 2,563 (2009)
  • Impacto JCR a 5 años: 10,312
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
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FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,4
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL

Scopus: 52

Web of Science: 54

Scopus: 178

Web of Science: 192

Última actualización de los datos: 27/04/24 8:34
Próxima recolección programada: 4/05/24 3:00