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Marabini Ruiz, Roberto Autor

Open Access

Characterization of transfer function, resolution and depth of field of a soft X-ray microscope applied to tomography enhancement by Wiener deconvolution

  • Oton, Joaquin
  • Pereiro, Eva
  • Perez-Berna, Ana J.
  • Millach, Laia
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose M.
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Biomedical Optics Express - 1/12/2016

10.1364/boe.7.005092 Ver en origen

Número de citas: 27 (Web of Science) 19 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,337 (2016)
  • CiteScore: 7,2 (2020)
  • SJR: 1,453 (2016)
  • SNIP: 1,456 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,544
  • Categorías JCR: OPTICS
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1); Biotechnology (Q1)

Scipion: A software framework toward integration, reproducibility and validation in 3D electron microscopy

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Quintana, A.
  • del Cano, L.
  • Zaldivar, A.
  • Foche, I.
  • Gutierrez, J.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Burguet-Castell, J.
  • Cuenca-Alba, J.
  • Abrishami, V.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Sharov, G.
  • Vilas, J. L.
  • Navas, J.
  • Conesa, P.
  • Kazemi, M.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/07/2016

10.1016/j.jsb.2016.04.010 Ver en origen

Número de citas: 342 (Web of Science) 235 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,767 (2016)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,732 (2016)
  • SNIP: 0,904 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,235
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Local analysis of strains and rotations for macromolecular electron microscopy maps

  • Sorzano, C. O. S.
  • Martin-Ramos, A.
  • Prieto, F.
  • Melero, R.
  • Martin-Benito, J.
  • Jonic, S.
  • Navas-Calvente, J.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Vilas, J. L.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/07/2016

10.1016/j.jsb.2016.04.001 Ver en origen

Número de citas: 8 (Web of Science) 5 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,767 (2016)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,732 (2016)
  • SNIP: 0,904 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,235
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

The Electron Microscopy eXchange (EMX) initiative.

  • Marabini R
  • Ludtke SJ
  • Murray SC
  • Chiu W
  • de la Rosa-Trevín JM
  • Patwardhan A
  • Heymann JB
  • Carazo JM
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Journal of Structural Biology - 1/05/2016

10.1016/j.jsb.2016.02.008 Ver en origen

Número de citas: 8 (Web of Science) 9 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,767 (2016)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,732 (2016)
  • SNIP: 0,904 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,235
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

System models for PET statistical iterative reconstruction: A review

  • Iriarte A
  • Marabini R
  • Matej S
  • Sorzano CO
  • Lewitt RM

COMPUTERIZED MEDICAL IMAGING AND GRAPHICS - 1/03/2016

10.1016/j.compmedimag.2015.12.003 Ver en origen

Número de citas: 35 (Web of Science) 22 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 1,738 (null)
  • CiteScore: 8,8 (2020)
  • SJR: 0,621 (2016)
  • SNIP: 1,231 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,889
  • Categorías JCR: ENGINEERING, BIOMEDICAL
  • Categorías SJR: Computer Graphics and Computer-Aided Design (Q1); Computer Vision and Pattern Recognition (Q2); Health Informatics (Q2); Radiological and Ultrasound Technology (Q2); Radiology, Nuclear Medicine and Imaging (Q2)
Open Access

Particle alignment reliability in single particle electron cryomicroscopy: a general approach.

  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.

Scientific Reports - 22/02/2016

10.1038/srep21626 Ver en origen

Número de citas: 20 (Web of Science) 15 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2016)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,259 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,712 (2016)
  • CiteScore: 7,1 (2020)
  • SJR: 1,692 (2016)
  • SNIP: 1,368 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,847
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)

MRC2014: Extensions to the MRC format header for electron cryo-microscopy and tomography

  • Cheng, A.
  • Henderson, R.
  • Mastronarde, D.
  • Ludtke, S.J.
  • Schoenmakers, R.H.M.
  • Short, J.
  • Marabini, R.
  • Dallakyan, S.
  • Agard, D.
  • Winn, M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2015

10.1016/j.jsb.2015.04.002 Ver en origen

Número de citas: 44 (Web of Science) 30 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,57 (null)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 3,448 (2015)
  • SNIP: 1,109 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,067
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

A fast iterative convolution weighting approach for gridding-based direct Fourier three-dimensional reconstruction with correction for the contrast transfer function

  • Abrishami, V.
  • Bilbao-Castro, J. R.
  • Vargas, J.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.

Ultramicroscopy - 1/10/2015

10.1016/j.ultramic.2015.05.018 Ver en origen

Número de citas: 23 (Web of Science) 17 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,874 (2015)
  • CiteScore: 5 (2020)
  • SJR: 2,066 (2015)
  • SNIP: 1,304 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,63
  • Categorías JCR: MICROSCOPY
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1); Electronic, Optical and Magnetic Materials (Q1); Instrumentation (Q1)

Fast and accurate conversion of atomic models into electron density maps

  • Sorzano C.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Abrishami V.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Riego S.
  • Fernández-Alderete A.
  • Martínez-Rey C.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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AIMS Biophysics - 1/1/2015

10.3934/biophy.2015.1.8

Número de citas: 31 (Web of Science) 21 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2015)
  • Cuartil SJR: Q4
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,306 (2015)
  • CiteScore: 3,9 (2020)
  • SJR: 0,108 (2015)
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q4); Biophysics (Q4); Molecular Biology (Q4); Structural Biology (Q4)
Open Access

Cryo-EM and the elucidation of new macromolecular structures: Random Conical Tilt revisited

  • Sorzano, C. O. S.
  • Alcorlo, M.
  • de la Rosa-Trevn, J. M.
  • Melero, R.
  • Foche, I.
  • Zaldivar-Peraza, A.
  • del Cano, L.
  • Vargas, J.
  • Abrishami, V.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
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Scientific Reports - 22/09/2015

10.1038/srep14290 Ver en origen

Número de citas: 14 (Web of Science) 9 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2015)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,228 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,38 (2015)
  • CiteScore: 7,1 (2020)
  • SJR: 2,034 (2015)
  • SNIP: 1,599 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 5,525
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)
Open Access

A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images

  • Merelo, JJ
  • Prieto, A
  • Moran, F
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Mira, J
  • MorenoDiaz, R
  • Cabestany, J
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Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997

10.1007/bfb0032577 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

An image processing approach to the simulation of electron microscopy volumes of atomic structures

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • De La Rosa-Trevin, J.M.
  • Del Riego, S.
  • Fernandez-Alderete, A.
  • Martinez-Rey, C.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
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2014 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2014 - 28/01/2014

10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen

Número de citas:
  • Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Electron tomography of biological specimens

  • Marabini R.
  • Carmen San Martin M.
  • Carazo J.

Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997

10.3233/978-1-60750-874-8-53

Número de citas: 2 (Scopus)
  • CiteScore: 1,2 (2020)

Este autor no tiene patentes.

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
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FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,4
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

On the suitability of biological structure determination by electron microscopy to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/03/2005

10.1007/bf03037653

Número de citas: 7 (Web of Science) 6 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q3 (2005)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,5 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,442 (2005)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,6 (2005)
  • SNIP: 1,719 (2005)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Biological structure determination by EM is well suited to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/06/2004

10.1007/bf03040957

Número de citas:
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,854 (2022)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,556 (2004)
  • SNIP: 1,19 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Scopus: 23

Web of Science: 27

Scopus: 57

Web of Science: 69

Última actualización de los datos: 15/04/24 7:47
Próxima recolección programada: 20/04/24 3:00