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Marabini Ruiz, Roberto Autor

Image processing approaches to biological three-dimensional electron microscopy

  • Herman, G.T.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.-M.
  • Garduño, E.
  • Lewitt, R.M.
  • Matej, S.

International Journal of Imaging Systems and Technology - 1/1/2000

10.1002/(sici)1098-1098(2000)11:1<12::aid-ima3>3.0.co;2-n

Número de citas: 18 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q2
  • CiteScore: 2,8 (2020)
  • SJR: 0,29 (2000)
  • SNIP: 0,587 (2000)
  • Categorías SJR: Electrical and Electronic Engineering (Q2); Computer Vision and Pattern Recognition (Q3); Electronic, Optical and Magnetic Materials (Q3); Software (Q3)

Image processing and 3-D reconstruction in electron microscopy

  • Fernandez, J.-J.
  • Sorzano, C.O.S.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.-M.

Ieee Signal Processing Magazine - 1/05/2006

10.1109/msp.2006.1628881 Ver en origen

Número de citas: 38 (Web of Science) 40 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2006)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,655 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,274 (2006)
  • CiteScore: 18,8 (2020)
  • SJR: 1,507 (2006)
  • SNIP: 5,057 (2006)
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Electrical and Electronic Engineering (Q1); Music (Q1); Signal Processing (Q1)

Image formation in cellular X-ray microscopy

  • Oton, Joaquin
  • Sorzano, C. O. S.
  • Pereiro, Eva
  • Cuenca-Alba, Jesus
  • Navarro, Rafael
  • Carazo, Jose M.
  • Marabini, Roberto
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Journal of Structural Biology - 1/04/2012

10.1016/j.jsb.2012.01.006 Ver en origen

Número de citas: 20 (Web of Science) 20 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2012)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,361 (2012)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,521 (2012)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,268 (2012)
  • SNIP: 1,235 (2012)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,549
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
Open Access

Grid Computing in structure determination of biological specimens by electron microscope tomography

  • Fernández J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • García I.

Lecture Notes In Computer Science - 1/12/2004

10.1007/978-3-540-24689-3_22

Número de citas: 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,347 (2004)
  • SNIP: 0,851 (2004)

FSC-Q: a CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier shell correlation

  • Ramírez-Aportela E.
  • Maluenda D.
  • Fonseca Y.C.
  • Conesa P.
  • Marabini R.
  • Heymann J.B.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
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Nature Communications - 1/12/2021

10.1038/s41467-020-20295-w

Número de citas: 22 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 17,694 (2021)
  • Impacto JCR a 5 años: 17,764
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES

Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion

  • Maluenda D.
  • Majtner T.
  • Horvath P.
  • Vilas J.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Mota J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Sánchez-García R.
  • Conesa P.
  • Del Caño L.
  • Rancel Y.
  • Fonseca Y.
  • Martínez M.
  • Sharov G.
  • García C.
  • Strelak D.
  • Melero R.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
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Acta Crystallographica Section D-Structural Biology - 1/10/2019

10.1107/s2059798319011860

Número de citas: 12 (Web of Science) 8 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2019)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,266 (2019)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,902 (2019)
  • CiteScore: 6,6 (2019)
  • SJR: 3,906 (2019)
  • SNIP: 1,429 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,181
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

FASTDEF: Fast defocus and astigmatism estimation for high-throughput transmission electron microscopy

  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Jonic, S.
  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/02/2013

10.1016/j.jsb.2012.12.006 Ver en origen

Número de citas: 24 (Web of Science) 22 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2013)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,369 (2013)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,645 (2013)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,596 (2013)
  • SNIP: 1,256 (2013)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,407
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Fast and automatic identification of particle tilt pairs based on Delaunay triangulation

  • Vilas, J. L.
  • Navas, J.
  • Gomez-Blanco, J.
  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Melero, R.
  • Peschiera, I.
  • Ferlenghi, I.
  • Cuenca, J.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • Vargas, J.
  • Sorzano, C. O. S.
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Journal of Structural Biology - 1/12/2016

10.1016/j.jsb.2016.10.007 Ver en origen

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,767 (2016)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,732 (2016)
  • SNIP: 0,904 (2016)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,235
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Fast and accurate conversion of atomic models into electron density maps

  • Sorzano C.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Abrishami V.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Riego S.
  • Fernández-Alderete A.
  • Martínez-Rey C.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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AIMS Biophysics - 1/1/2015

10.3934/biophy.2015.1.8

Número de citas: 31 (Web of Science) 21 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2015)
  • Cuartil SJR: Q4
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,306 (2015)
  • CiteScore: 3,9 (2020)
  • SJR: 0,108 (2015)
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q4); Biophysics (Q4); Molecular Biology (Q4); Structural Biology (Q4)

Exploiting desktop supercomputing for three-dimensional electron microscopy reconstructions using ART with blobs

  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Sorzano C.
  • García I.
  • Carazo J.
  • Fernández J.

Journal of Structural Biology - 1/01/2009

10.1016/j.jsb.2008.09.009

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2009)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,673 (2009)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,339 (2009)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 3,006 (2009)
  • SNIP: 1,22 (2009)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,925
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods In Molecular Biology (clifton, N.j.) - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Volumetric constraints in 3D tomography applied to electron microscopy

  • Marabini R.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.

Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029339 Ver en origen

Número de citas: 5 (Scopus)

Towards a data-bank of three-dimensional macromolecular structures: A WWW-based prototype

  • CARAZO, JM
  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FRANK, J
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C

Electron Microscopy 1994, Vol 1 - 1994

STUDY OF THE COLLARS EXTRACTED FROM T3 AND 029 VIRAL PARTICLES

  • MARCO, S
  • VALPUESTA, JM
  • CARAZO, JM
  • MARABINI, R
  • FUJISAWA, H
  • CARRASCOSA, JL
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C
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Electron Microscopy 1994, Vols 3a and 3b - 1994

Pattern recognition and classification of images of biological macromolecules using neural networks

  • MARABINI, R
  • CARAZO, JM
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C

Electron Microscopy 1994, Vol 1 - 1994

Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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Visualization In Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Iterative reconstruction for pet scanners with continuous scintillators

  • Iriarte A.
  • Caffarena G.
  • Lopez-Fernandez M.
  • Garcia-Carmona R.
  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.
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Proceedings of the Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, EMBS - 4/08/2015

10.1109/embc.2015.7318842 Ver en origen

Número de citas:
  • CiteScore: 1,5 (2020)
  • SJR: 0,263 (2015)
  • SNIP: 0,653 (2015)

Image processing for Cellular tomography using soft X-rays

  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Cuenca, J.
  • Zaldivar-Perez, A.
  • Caffarena, G.
  • Sanchez-Jimenez, J.
  • Messaoudi, C.
  • Marco, S.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE
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2012 9th Ieee International Symposium On Biomedical Imaging (isbi) - 2012

Effects of uneven sampling in 3D reconstructions.

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Rietzel, E
  • Schroeder, R
  • Herman, GT
  • Boisset, N
  • Benavides, HAC
  • Yacaman, MJ
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Electron Microscopy 1998, Vol 1 - 1998

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

Wisp 2009 - 6th Ieee International Symposium On Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Este autor no tiene patentes.

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
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FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,4
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL

Scopus: 23

Web of Science: 27

Scopus: 57

Web of Science: 69

Última actualización de los datos: 18/05/24 5:01
Próxima recolección programada: 25/05/24 3:00