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Marabini Ruiz, Roberto Autor

Open Access

XTEND: Extending the depth of field in cryo soft X-ray tomography

  • Otón J.
  • Pereiro E.
  • Conesa J.
  • Chichón F.
  • Luque D.
  • Rodríguez J.
  • Pérez-Berná A.
  • Sorzano C.
  • Klukowska J.
  • Herman G.
  • Vargas J.
  • Marabini R.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
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SCIENTIFIC REPORTS - 4/4/2017

10.1038/srep45808

Número de citas: 14 (Web of Science) 12 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2017)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,122 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,886 (2017)
  • CiteScore: 7,1 (2020)
  • SJR: 1,533 (2017)
  • SNIP: 1,263 (2017)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,609
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)

Xmipp: An image processing package for electron microscopy

  • Marabini, R.
  • Masegosa, I.M.
  • San Martín, M.C.
  • Marco, S.
  • Fernández, J.J.
  • De La Fraga, L.G.
  • Vaquerizo, C.
  • Carazo, J.M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/01/1996

10.1006/jsbi.1996.0036 Ver en origen

Número de citas: 171 (Web of Science) 169 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 3,071 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 3,149 (1996)
  • CiteScore: 5,5 (2020)

XMIPP:: a new generation of an open-source image processing package for electron microscopy

  • Sorzano, C.O.S.
  • Marabini, R.
  • Velázquez-Muriel, J.
  • Bilbao-Castro, J.R.
  • Scheres, S.H.W.
  • Carazo, J.M.
  • Pascual-Montano, A.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2004

10.1016/j.jsb.2004.06.006 Ver en origen

Número de citas: 387 (Web of Science) 363 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 3,132 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 6,073 (2004)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,385 (2004)
  • SNIP: 1,286 (2004)
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q2)

Xmipp 3.0: An improved software suite for image processing in electron microscopy

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Zaldivar, A.
  • Vargas, J.
  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2013

10.1016/j.jsb.2013.09.015 Ver en origen

Número de citas: 228 (Web of Science) 172 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2013)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,369 (2013)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 5,507 (2013)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,596 (2013)
  • SNIP: 1,256 (2013)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,407
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Volurnetric restrictions in single particle 3DEM reconstruction

  • Sorzano, C.O.S.
  • Velázquez-Muriel, J.A.
  • Marabini, R.
  • Herman, G.T.
  • Carazo, J.M.

PATTERN RECOGNITION - 1/2/2008

10.1016/j.patcog.2007.06.010 Ver en origen

Número de citas: 10 (Web of Science) 8 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2008)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,279 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,326 (2008)
  • CiteScore: 15,7 (2020)
  • SJR: 1,196 (2008)
  • SNIP: 2,213 (2008)
  • Categorías SJR: Artificial Intelligence (Q1); Computer Vision and Pattern Recognition (Q1); Signal Processing (Q1); Software (Q1)

Validation of electron microscopy initial models via small angle X-ray scattering curves

  • Jiménez A.
  • Jonic S.
  • Majtner T.
  • Otón J.
  • Vilas J.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Rancel Y.
  • Segura J.
  • Sánchez-García R.
  • Melero R.
  • Del Cano L.
  • Conesa P.
  • Skjaerven L.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
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BIOINFORMATICS - 15/7/2019

10.1093/bioinformatics/bty985

Número de citas: 7 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,61 (2019)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 3,567 (2019)
  • SNIP: 1,864 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 9,853
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
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ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES - 7/2018

10.1107/s0108767318098380

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Using <i>Scipion</i> for stream image processing at Cryo-EM facilities

  • Gómez-Blanco J.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Marabini R.
  • del Cano L.
  • Jiménez A.
  • Martínez M.
  • Melero R.
  • Majtner T.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Rancel Y.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Vilas J.
  • Carroni M.
  • Fleischmann S.
  • Lindahl E.
  • Ashton A.
  • Basham M.
  • Clare D.
  • Savage K.
  • Siebert C.
  • Sharov G.
  • Sorzano C.
  • Conesa P.
  • Carazo J.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 3/12/2018

10.1016/j.jsb.2018.10.001

Número de citas: 24 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,754 (2018)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 5,254 (2018)
  • SNIP: 1,207 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,522
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Transfer function restoration in 3D electron microscopy via iterative data refinement

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Censor, Y
  • Carazo, JM

PHYSICS IN MEDICINE AND BIOLOGY - 21/2/2004

10.1088/0031-9155/49/4/003 Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,368 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,34 (2004)
  • CiteScore: 5,9 (2020)
  • SJR: 1,047 (2004)
  • SNIP: 1,645 (2004)
  • Categorías SJR: Radiological and Ultrasound Technology (Q1); Radiology, Nuclear Medicine and Imaging (Q1)

Three-dimensional reconstruction methods in Single Particle Analysis from transmission electron microscopy data

  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Vargas, J.

ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS - 1/9/2015

10.1016/j.abb.2015.05.003 Ver en origen

Número de citas: 19 (Web of Science) 14 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2015)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,807 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,299 (2015)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 1,513 (2015)
  • SNIP: 1,008 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,073
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Biophysics (Q1); Molecular Biology (Q2)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Zero-loss P-contrast in EFTEM

  • Rietzel, E
  • Schorsch, P
  • Muller, H
  • Marabini, R
  • Sorzano, C
  • Carazo, JM
  • Schimpf, U
  • Leue, C
  • Holmes, KC
  • Schroder, RR
  • Benavides, HAC
  • Yacaman, MJ
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ELECTRON MICROSCOPY 1998, VOL 4 - 1998

Número de citas:

Volumetric constraints in 3D tomography applied to electron microscopy

  • Marabini R.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.

2002 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING, PROCEEDINGS - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029339 Ver en origen

Número de citas: 5 (Scopus)

Towards a data-bank of three-dimensional macromolecular structures: A WWW-based prototype

  • CARAZO, JM
  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FRANK, J
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C

ELECTRON MICROSCOPY 1994, VOL 1 - 1994

Número de citas:

STUDY OF THE COLLARS EXTRACTED FROM T3 AND 029 VIRAL PARTICLES

  • MARCO, S
  • VALPUESTA, JM
  • CARAZO, JM
  • MARABINI, R
  • FUJISAWA, H
  • CARRASCOSA, JL
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C
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ELECTRON MICROSCOPY 1994, VOLS 3A AND 3B - 1994

Número de citas:

Pattern recognition and classification of images of biological macromolecules using neural networks

  • MARABINI, R
  • CARAZO, JM
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C

ELECTRON MICROSCOPY 1994, VOL 1 - 1994

Número de citas:

Outlier detection for single particle analysis in Electron Microscopy

  • Sorzano, C. O. S.
  • Vargas, J.
  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Zaldivar-Peraza, A.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • Foche, I.
  • Marabini, R.
  • Caffarena, G.
  • Carazo, J. M.
  • Ortuno, F
  • Rojas, I
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PROCEEDINGS IWBBIO 2014: INTERNATIONAL WORK-CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOMEDICAL ENGINEERING, VOLS 1 AND 2 - 2014

Número de citas: 10 (Web of Science)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 3,192 (2014)
Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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VISUALIZATION IN BIOMEDICAL COMPUTER 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Iterative Reconstruction for PET scanners with continuous scintillators

  • Iriarte A.
  • Caffarena G.
  • Lopez-Fernandez M.
  • Garcia-Carmona R.
  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.
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2015 37TH ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE ENGINEERING IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY (EMBC) - 4/08/2015

10.1109/embc.2015.7318842 Ver en origen

Número de citas:
  • CiteScore: 1,5 (2020)
  • SJR: 0,263 (2015)
  • SNIP: 0,653 (2015)

Image processing for Cellular tomography using soft X-rays

  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Cuenca, J.
  • Zaldivar-Perez, A.
  • Caffarena, G.
  • Sanchez-Jimenez, J.
  • Messaoudi, C.
  • Marco, S.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE
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2012 9TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING (ISBI) - 2012

Número de citas:

Electron tomography of biological specimens

  • Marabini R.
  • Carmen San Martin M.
  • Carazo J.

Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997

10.3233/978-1-60750-874-8-53

Número de citas: 2 (Scopus)
  • CiteScore: 1,2 (2020)

Este autor no tiene patentes.

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

Scopus: 23

Web of Science: 28

Scopus: 57

Web of Science: 72

Última actualización de los datos: 20/11/24 2:20
Próxima recolección programada: 23/11/24 3:00