Marabini Ruiz, Roberto Autor
A new algorithm for particle weighted subtraction to decrease signals from unwanted components in single particle analysis
- Fernández-Giménez E.
- Martínez M.M.
- Marabini R.
- Strelak D.
- Sánchez-García R.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/2023
- Factor Impacto JCR: 3 (2023)
- CiteScore: 6,1 (2022)
- SJR: 1,582 (2022)
- SNIP: 0,773 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 2,5
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
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ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation
- Jiménez de la Morena J.
- Conesa P.
- Fonseca Y.C.
- de Isidro-Gómez F.P.
- Herreros D.
- Fernández-Giménez E.
- Strelak D.
- Moebel E.
- Buchholz T.O.
- Jug F.
- Martinez-Sanchez A.
- Harastani M.
- Jonic S.
- Conesa J.J.
- Cuervo A.
- Losana P.
- Sánchez I.
- Iceta M.
- del Cano L.
- Gragera M.
- Melero R.
- Sharov G.
- Castaño-Díez D.
- Koster A.
- Piccirillo J.G.
- Vilas J.L.
- Otón J.
- Marabini R.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/9/2022
- Cuartil JCR: Q2 (2022)
- Factor Impacto JCR: 3 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 1,467 (2022)
- CiteScore: 5,3 (2021)
- SJR: 1,594 (2021)
- SNIP: 0,842 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 3,3
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
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On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy
- Sorzano C.O.S.
- Jiménez-Moreno A.
- Maluenda D.
- Martínez M.
- Ramírez-Aportela E.
- Krieger J.
- Melero R.
- Cuervo A.
- Conesa J.
- Filipovic J.
- Conesa P.
- Del Caño L.
- Fonseca Y.C.
- Jiménez-de la Morena J.
- Losana P.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.P.
- Herreros D.
- Vilas J.L.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
Acta Crystallographica Section D-Structural Biology - 1/4/2022
- Cuartil JCR: Q2 (2022)
- Factor Impacto JCR: 2,2 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 2,434 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 5,7
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
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Image processing tools for the validation of CryoEM maps
- C. O. S. Sorzano
- J. L. Vilas
- E. Ramírez-Aportela
- J. Krieger
- D. del Hoyo
- D. Herreros
- E. Fernandez-Giménez
- D. Marchán
- J. R. Macías
- I. Sánchez
- L. del Caño
- Y. Fonseca-Reyna
- P. Conesa
- A. García-Mena
- J. Burguet
- J. García Condado
- J. Méndez García
- M. Martínez
- A. Muñoz-Barrutia
- R. Marabini
- J. Vargas
- J. M. Carazo
Faraday Discussions - 4/04/2022
- Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 3,4
- Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL
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Cryo-EM and Single-Particle Analysis with Scipion
- Jiménez-Moreno A.
- Del Caño L.
- Martínez M.
- Ramírez-Aportela E.
- Cuervo A.
- Melero R.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.P.
- Herreros D.
- Conesa P.
- Fonseca Y.
- Maluenda D.
- Jiménez de la Morena J.
- Macías J.R.
- Losana P.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
Jove-Journal of Visualized Experiments - 29/5/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Factor Impacto JCR: 1,424 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,87 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 1,789
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
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Near-atomic structure of an atadenovirus reveals a conserved capsid-binding motif and intergenera variations in cementing proteins
- Marabini R.
- Condezo G.N.
- Krupovic M.
- Menéndez-Conejero R.
- Gómez-Blanco J.
- Martín C.S.
Science Advances - 1/3/2021
- Factor Impacto JCR: 14,98 (2021)
- CiteScore: 16,6 (2020)
- SJR: 5,928 (2020)
- SNIP: 3,445 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 16,9
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
Algorithmic robustness to preferred orientations in single particle analysis by CryoEM
- Sorzano C.O.S.
- Semchonok D.
- Lin S.C.
- Lo Y.C.
- Vilas J.L.
- Jiménez-Moreno A.
- Gragera M.
- Vacca S.
- Maluenda D.
- Martínez M.
- Ramírez-Aportela E.
- Melero R.
- Cuervo A.
- Conesa J.J.
- Conesa P.
- Losana P.
- Caño L.d.
- de la Morena J.J.
- Fonseca Y.C.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro F.
- Herreros D.
- Kastritis P.L.
- Marabini R.
- Bruce B.D.
- Carazo J.M.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/3/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Factor Impacto JCR: 3,234 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 1,479 (2021)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,564 (2020)
- SNIP: 1,018 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,064
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
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Cryo-EM density maps adjustment for subtraction, consensus and sharpening
- Fernández-Giménez E.
- Martínez M.
- Sánchez-García R.
- Marabini R.
- Ramírez-Aportela E.
- Conesa P.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/2021
- Factor Impacto JCR: 3,234 (2021)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,564 (2020)
- SNIP: 1,018 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,064
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
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FSC-Q: a CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier shell correlation
- Ramírez-Aportela E.
- Maluenda D.
- Fonseca Y.C.
- Conesa P.
- Marabini R.
- Heymann J.B.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
Nature Communications - 1/12/2021
- Factor Impacto JCR: 17,694 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 17,764
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
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Advances in xmipp for cryo–electron microscopy: From xmipp to scipion
- Strelak D.
- Jiménez-Moreno A.
- Vilas J.L.
- Ramírez-Aportela E.
- Sánchez-García R.
- Maluenda D.
- Vargas J.
- Herreros D.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.P.
- Horacek J.
- Myska D.
- Horacek M.
- Conesa P.
- Fonseca-Reyna Y.C.
- Jiménez J.
- Martínez M.
- Harastani M.
- Jonić S.
- Filipovic J.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
MOLECULES - 1/10/2021
- Factor Impacto JCR: 4,927 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 5,11
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
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Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
- Sorzano C.O.S.
- Jiménez-Moreno A.
- Maluenda D.
- Ramírez-Aportela E.
- Martínez M.
- Cuervo A.
- Melero R.
- Conesa J.J.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Filipovic J.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.
- Herreros D.
- Conesa P.
- del Caño L.
- Fonseca Y.
- de la Morena J.J.
- Macías J.R.
- Losana P.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
Methods in Molecular Biology - 1/1/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,711 (2020)
- SNIP: 0,57 (2020)
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- Web of Science
Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards
- Sorzano C.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Otón J.
- Cuenca-Alba J.
- Quintana A.
- de la Rosa-Trevín J.
- Carazo J.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
Soft X-ray tomography imaging for biological samples
- Otón J.
- Sorzano C.
- Chichón F.
- Carrascosa J.
- Carazo J.
- Marabini R.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy
- Sorzano C.
- De La Rosa Trevín J.
- Otón J.
- Vega J.
- Cuenca J.
- Zaldívar-Peraza A.
- Gómez-Blanco J.
- Vargas J.
- Quintana A.
- Marabini R.
- Carazo J.
Methods in Molecular Biology - 1/1/2013
- Cuartil SJR: Q3
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,751 (2013)
- SNIP: 0,362 (2013)
- Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)
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Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy
- Carazo J.
- Herman G.
- Sorzano C.
- Marabini R.
Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006
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A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images
- Merelo, JJ
- Prieto, A
- Moran, F
- Marabini, R
- Carazo, JM
- Mira, J
- MorenoDiaz, R
- Cabestany, J
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997
10.1007/bfb0032577 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
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- Web of Science
ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING
- MARABINI, R
- VAQUERIZO, C
- FERNANDEZ, JJJ
- CARAZO, JM
- LADJADJ, M
- ODESANYA, O
- FRANK, J
- Robb, RA
Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994
10.1117/12.185208 Ver en origen
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
An image processing approach to the simulation of electron microscopy volumes of atomic structures
- Sorzano, C.O.S.
- Vargas, J.
- Oton, J.
- Abrishami, V.
- De La Rosa-Trevin, J.M.
- Del Riego, S.
- Fernandez-Alderete, A.
- Martinez-Rey, C.
- Marabini, R.
- Carazo, J.M.
2014 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2014 - 28/01/2014
10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen
- Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition
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- ORCID
- Web of Science
Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles
- Sorzano, C. O. S.
- Iriarte, A.
- Marabini, R.
- Carazo, J. M.
- IEEE
WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009
10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen
- Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
- Scopus
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- Web of Science
Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization
- Arganda-Carreras, Ignacio
- Sorzano, Carlos O. S.
- Marabini, Roberto
- Carazo, Jose Maria
- Ortiz-de-Solorzano, Carlos
- Kybic, Jan
- Beichel, RR
COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006
10.1007/11889762_8 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
- SJR: 0,317 (2006)
- SNIP: 0,679 (2006)
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- Web of Science
Electron tomography of biological specimens
- Marabini R.
- Carmen San Martin M.
- Carazo J.
Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997
- CiteScore: 1,2 (2020)
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Este autor no tiene patentes.
Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)
- Sorzano C.O.S.
- Vilas J.L.
- Ramírez-Aportela E.
- Krieger J.
- Del Hoyo D.
- Herreros D.
- Fernandez-Giménez E.
- Marchán D.
- De Isidro Gómez F.
- Macías J.R.
- Sánchez I.
- Del Caño L.
- Fonseca-Reyna Y.
- Conesa P.
- García-Mena A.
- Burguet J.
- García Condado J.
- Méndez García J.
- Martínez M.
- Muñoz-Barrutia A.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Carazo J.M.
FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022
- Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 3,4
- Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL
Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins
- Roberto Marabini
- Gabriela N. Condezo
- Josué Gómez-Blanco
- Carmen San Martín
Science Advances - 24/07/2020
- Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 16,45
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- ORCID
On the suitability of biological structure determination by electron microscopy to grid computing
- Fernandez J.
- Bilbao-Castro J.
- Marabini R.
- Carazo J.
- Garcia I.
New Generation Computing - 1/03/2005
- Cuartil JCR: Q3 (2005)
- Cuartil SJR: Q2
- Factor Impacto JCR: 0,5 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,442 (2005)
- CiteScore: 2,1 (2020)
- SJR: 0,6 (2005)
- SNIP: 1,719 (2005)
- Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Biological structure determination by EM is well suited to grid computing
- Fernandez J.
- Bilbao-Castro J.
- Marabini R.
- Carazo J.
- Garcia I.
New Generation Computing - 1/06/2004
- Cuartil JCR: Q2 (2004)
- Cuartil SJR: Q2
- Factor Impacto JCR: 0,854 (2022)
- CiteScore: 2,1 (2020)
- SJR: 0,556 (2004)
- SNIP: 1,19 (2004)
- Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)
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- ORCID
- Web of Science
Índice h
Scopus: 23
Web of Science: 27
Índice i10
Scopus: 57
Web of Science: 69
Perfiles de autor
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ORCID
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Web of Science ResearcherID
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Scopus Author ID
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Dialnet id
Proyectos de investigación en la UAL
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Acrónimo P10-TIC-06002Desde: 15 de marzo de 2011Hasta: 15 de marzo de 2014Financiado por: JUNTAImporte de financiación: 105.730,00 EURRol: Investigador