RDF/XML JSON-LD N3/Turtle RDF/JSON

Marabini Ruiz, Roberto Autor

ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation

  • Jiménez de la Morena J.
  • Conesa P.
  • Fonseca Y.C.
  • de Isidro-Gómez F.P.
  • Herreros D.
  • Fernández-Giménez E.
  • Strelak D.
  • Moebel E.
  • Buchholz T.O.
  • Jug F.
  • Martinez-Sanchez A.
  • Harastani M.
  • Jonic S.
  • Conesa J.J.
  • Cuervo A.
  • Losana P.
  • Sánchez I.
  • Iceta M.
  • del Cano L.
  • Gragera M.
  • Melero R.
  • Sharov G.
  • Castaño-Díez D.
  • Koster A.
  • Piccirillo J.G.
  • Vilas J.L.
  • Otón J.
  • Marabini R.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

Journal of Structural Biology - 1/9/2022

10.1016/j.jsb.2022.107872

Número de citas:
  • CiteScore: 5,3 (2021)
  • SJR: 1,594 (2021)
  • SNIP: 0,842 (2021)

On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Martínez M.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Melero R.
  • Cuervo A.
  • Conesa J.
  • Filipovic J.
  • Conesa P.
  • Del Caño L.
  • Fonseca Y.C.
  • Jiménez-de la Morena J.
  • Losana P.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.P.
  • Herreros D.
  • Vilas J.L.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

Acta crystallographica. Section D, Structural biology - 1/4/2022

10.1107/s2059798322001978

Número de citas: 2 (Scopus)

Image processing tools for the validation of CryoEM maps

  • C. O. S. Sorzano
  • J. L. Vilas
  • E. Ramírez-Aportela
  • J. Krieger
  • D. del Hoyo
  • D. Herreros
  • E. Fernandez-Giménez
  • D. Marchán
  • J. R. Macías
  • I. Sánchez
  • L. del Caño
  • Y. Fonseca-Reyna
  • P. Conesa
  • A. García-Mena
  • J. Burguet
  • J. García Condado
  • J. Méndez García
  • M. Martínez
  • A. Muñoz-Barrutia
  • R. Marabini
  • J. Vargas
  • J. M. Carazo
... Ver más Contraer

Faraday Discussions - 1/1/2022

10.1039/d2fd00059h

Número de citas:

Cryo-EM and Single-Particle Analysis with Scipion

  • Jiménez-Moreno A.
  • Del Caño L.
  • Martínez M.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.P.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • Fonseca Y.
  • Maluenda D.
  • Jiménez de la Morena J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
... Ver más Contraer

Journal of visualized experiments : JoVE - 29/5/2021

10.3791/62261

Número de citas: 6 (Web of Science) 2 (Scopus)

Near-atomic structure of an atadenovirus reveals a conserved capsid-binding motif and intergenera variations in cementing proteins

  • Marabini R.
  • Condezo G.N.
  • Krupovic M.
  • Menéndez-Conejero R.
  • Gómez-Blanco J.
  • Martín C.S.

Science Advances - 1/3/2021

10.1126/sciadv.abe6008

Número de citas: 7 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • CiteScore: 16,6 (2020)
  • SJR: 5,928 (2020)
  • SNIP: 3,445 (2020)

Algorithmic robustness to preferred orientations in single particle analysis by CryoEM

  • Sorzano C.O.S.
  • Semchonok D.
  • Lin S.C.
  • Lo Y.C.
  • Vilas J.L.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Gragera M.
  • Vacca S.
  • Maluenda D.
  • Martínez M.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Melero R.
  • Cuervo A.
  • Conesa J.J.
  • Conesa P.
  • Losana P.
  • Caño L.d.
  • de la Morena J.J.
  • Fonseca Y.C.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro F.
  • Herreros D.
  • Kastritis P.L.
  • Marabini R.
  • Bruce B.D.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

Journal of Structural Biology - 1/3/2021

10.1016/j.jsb.2020.107695

Número de citas: 10 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,564 (2020)
  • SNIP: 1,018 (2020)

FSC-Q: a CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier shell correlation

  • Ramírez-Aportela E.
  • Maluenda D.
  • Fonseca Y.C.
  • Conesa P.
  • Marabini R.
  • Heymann J.B.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
... Ver más Contraer

Nature Communications - 1/12/2021

10.1038/s41467-020-20295-w

Número de citas: 16 (Web of Science) 3 (Scopus)

Cryo-EM density maps adjustment for subtraction, consensus and sharpening

  • Fernández-Giménez E.
  • Martínez M.
  • Sánchez-García R.
  • Marabini R.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Conesa P.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
... Ver más Contraer

Journal of Structural Biology - 1/12/2021

10.1016/j.jsb.2021.107780

Número de citas: 2 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,564 (2020)
  • SNIP: 1,018 (2020)

Advances in xmipp for cryo–electron microscopy: From xmipp to scipion

  • Strelak D.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Sánchez-García R.
  • Maluenda D.
  • Vargas J.
  • Herreros D.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.P.
  • Horacek J.
  • Myska D.
  • Horacek M.
  • Conesa P.
  • Fonseca-Reyna Y.C.
  • Jiménez J.
  • Martínez M.
  • Harastani M.
  • Jonić S.
  • Filipovic J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.
... Ver más Contraer

Molecules - 1/10/2021

10.3390/molecules26206224

Número de citas: 4 (Web of Science)

Cryo-EM structure of enteric adenovirus HAdV-F41 highlights structural variations among human adenoviruses

  • Marta Pérez-Illana
  • Marta Martínez
  • Gabriela N. Condezo
  • Mercedes Hernando-Pérez
  • Casandra Mangroo
  • Martha Brown
  • Roberto Marabini
  • Carmen San Martín
... Ver más Contraer

Science Advances - 24/02/2021

10.1126/sciadv.abd9421

Número de citas: 9 (Web of Science) 5 (Scopus)
  • CiteScore: 16,6 (2020)
  • SJR: 5,928 (2020)
  • SNIP: 3,445 (2020)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 3 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
... Ver más Contraer

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 8 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Iterative Reconstruction for PET scanners with continuous scintillators

  • Iriarte A.
  • Caffarena G.
  • Lopez-Fernandez M.
  • Garcia-Carmona R.
  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.
... Ver más Contraer

2015 37TH ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE ENGINEERING IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY (EMBC) - 4/11/2015

10.1109/embc.2015.7318842 Ver en origen

Número de citas:
  • CiteScore: 1,5 (2020)
  • SJR: 0,263 (2015)
  • SNIP: 0,653 (2015)

AN IMAGE PROCESSING APPROACH TO THE SIMULATION OF ELECTRON MICROSCOPY VOLUMES OF ATOMIC STRUCTURES

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • De La Rosa-Trevin, J.M.
  • Del Riego, S.
  • Fernandez-Alderete, A.
  • Martinez-Rey, C.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
... Ver más Contraer

2014 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON IMAGE PROCESSING (ICIP) - 28/1/2014

10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen

Número de citas:
  • Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition

Image processing for Cellular tomography using soft X-rays

  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Cuenca, J.
  • Zaldivar-Perez, A.
  • Caffarena, G.
  • Sanchez-Jimenez, J.
  • Messaoudi, C.
  • Marco, S.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE
... Ver más Contraer

2012 9TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING (ISBI) - 2012

Effects of the Downsampling Scheme on Three-dimensional Electron Microscopy of Single Particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009: 6TH IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTELLIGENT SIGNAL PROCESSING, PROCEEDINGS - 10/12/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
... Ver más Contraer

COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 235 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

3D reconstruction of 2D crystals from projections in real space

  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Sorzano, COS
  • Carazo, JM
  • Fernandez, JJ
  • Matej, S
  • IEEE
... Ver más Contraer

2002 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING, PROCEEDINGS - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029351 Ver en origen

Número de citas: 1 (Scopus)

Volumetric constraints in 3D tomography applied to electron microscopy

  • Marabini R.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.

2002 IEEE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOMEDICAL IMAGING, PROCEEDINGS - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029339 Ver en origen

Número de citas: 5 (Scopus)

Zero-loss P-contrast in EFTEM

  • Rietzel, E
  • Schorsch, P
  • Muller, H
  • Marabini, R
  • Sorzano, C
  • Carazo, JM
  • Schimpf, U
  • Leue, C
  • Holmes, KC
  • Schroder, RR
  • Benavides, HAC
  • Yacaman, MJ
... Ver más Contraer

ELECTRON MICROSCOPY 1998, VOL 4 - 1998

Effects of uneven sampling in 3D reconstructions.

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Rietzel, E
  • Schroeder, R
  • Herman, GT
  • Boisset, N
  • Benavides, HAC
  • Yacaman, MJ
... Ver más Contraer

ELECTRON MICROSCOPY 1998, VOL 1 - 1998

Three-dimensional reconstruction from reduced sets of very noisy images acquired following a single-axis tilt schema: Application of a new three-dimensional reconstruction algorithm and objective comparison with weighted backprojection

  • Marabini, R.
  • Rietzel, E.
  • Schroeder, R.
  • Herman, G.T.
  • Carazo, J.M.

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/1997

10.1006/jsbi.1997.3923 Ver en origen

Número de citas: 46 (Web of Science) 49 (Scopus)
  • CiteScore: 5,5 (2020)

Este autor no tiene patentes.

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

Faraday Discussions - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

Scopus: 23

Web of Science: 27

Scopus: 57

Web of Science: 64

  • Acrónimo P10-TIC-06002
    Desde: 1 de enero de 2020
    Hasta: 30 de junio de 2021
    Financiado por: Consejería de Economía, Conocimiento, Empresas y Universidad
    Importe de financiación: 49.900,00 EUR
    Rol: Investigador
Última actualización de los datos: 18/03/23 15:49
Próxima recolección programada: 25/03/23 3:00