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Marabini Ruiz, Roberto Autor

Three-dimensional reconstruction methods in Single Particle Analysis from transmission electron microscopy data

  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Vargas, J.

Archives of Biochemistry and Biophysics - 1/09/2015

10.1016/j.abb.2015.05.003 Ver en origen

Número de citas: 18 (Web of Science) 14 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2015)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,807 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,299 (2015)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 1,513 (2015)
  • SNIP: 1,008 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,073
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Biophysics (Q1); Molecular Biology (Q2)

Structures of Adenovirus Incomplete Particles Clarify Capsid Architecture and Show Maturation Changes of Packaging Protein L1 52/55k

  • Condezo, G.N.
  • Marabini, R.
  • Ayora, S.
  • Carazo, J.M.
  • Alba, R.
  • Chillón, M.
  • Martín, C.S.
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JOURNAL OF VIROLOGY - 1/09/2015

10.1128/jvi.01453-15 Ver en origen

Número de citas: 39 (Web of Science) 33 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,606 (2015)
  • CiteScore: 8,9 (2020)
  • SJR: 3,282 (2015)
  • SNIP: 1,132 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,428
  • Categorías JCR: VIROLOGY
  • Categorías SJR: Immunology (Q1); Insect Science (Q1); Microbiology (Q1); Virology (Q1)

Iterative reconstruction for pet scanners with continuous scintillators.

  • Iriarte A.
  • Caffarena G.
  • Lopez-Fernandez M.
  • Garcia-Carmona R.
  • Otero A.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.
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Proceedings of the Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, EMBS - 4/08/2015

10.1109/embc.2015.7318842 Ver en origen

Número de citas:
  • CiteScore: 1,5 (2020)
  • SJR: 0,263 (2015)
  • SNIP: 0,653 (2015)

CTF Challenge: Result summary

  • Marabini, R.
  • Carragher, B.
  • Chen, S.
  • Chen, J.
  • Cheng, A.
  • Downing, K.H.
  • Frank, J.
  • Grassucci, R.A.
  • Bernard Heymann, J.
  • Jiang, W.
  • Jonic, S.
  • Liao, H.Y.
  • Ludtke, S.J.
  • Patwari, S.
  • Piotrowski, A.L.
  • Quintana, A.
  • Sorzano, C.O.S.
  • Stahlberg, H.
  • Vargas, J.
  • Voss, N.R.
  • Chiu, W.
  • Carazo, J.M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/06/2015

10.1016/j.jsb.2015.04.003 Ver en origen

Número de citas: 26 (Web of Science) 23 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,57 (2015)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 3,448 (2015)
  • SNIP: 1,109 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,067
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
Open Access

Measurement of the modulation transfer function of an X-ray microscope based on multiple Fourier orders analysis of a Siemens star

  • Oton, Joaquin
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Marabini, Roberto
  • Pereiro, Eva
  • Carazo, Jose M.

OPTICS EXPRESS - 20/04/2015

10.1364/oe.23.009567 Ver en origen

Número de citas: 21 (Web of Science) 19 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,148 (2015)
  • CiteScore: 7,2 (2020)
  • SJR: 1,91 (2015)
  • SNIP: 1,651 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,25
  • Categorías JCR: OPTICS
  • Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1)

A statistical approach to the initial volume problem in Single Particle Analysis by Electron Microscopy

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • de la Rosa-Trevín, J.M.
  • Otón, J.
  • Álvarez-Cabrera, A.L.
  • Abrishami, V.
  • Sesmero, E.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/03/2015

10.1016/j.jsb.2015.01.009 Ver en origen

Número de citas: 27 (Web of Science) 21 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2015)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,57 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,818 (2015)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 3,448 (2015)
  • SNIP: 1,109 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,067
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Alignment of direct detection device micrographs using a robust Optical Flow approach

  • Abrishami, Vahid
  • Vargas, Javier
  • Li, Xueming
  • Cheng, Yifan
  • Marabini, Roberto
  • Sanchez Sorzano, Carlos Oscar
  • Maria Carazo, Jose
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/03/2015

10.1016/j.jsb.2015.02.001 Ver en origen

Número de citas: 49 (Web of Science) 45 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,57 (2015)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 3,448 (2015)
  • SNIP: 1,109 (2015)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,067
  • Categorías JCR: BIOPHYSICS
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

The soft x-ray transform

  • Klukowska, J.
  • Herman, G.T.
  • Otón, J.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.-M.

Inverse Problems - 1/12/2014

10.1088/0266-5611/30/12/125015 Ver en origen

Número de citas: 3 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 1,323 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,232 (2014)
  • CiteScore: 3,7 (2020)
  • SJR: 1,252 (2014)
  • SNIP: 1,397 (2014)
  • Impacto JCR a 5 años: 1,95
  • Categorías JCR: PHYSICS, MATHEMATICAL
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Mathematical Physics (Q1); Signal Processing (Q1); Theoretical Computer Science (Q1)

Efficient initial volume determination from electron microscopy images of single particles

  • Vargas, Javier
  • Alvarez-Cabrera, Ana-Lucia
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose M.
  • Sorzano, C. O. S.

BIOINFORMATICS - 15/10/2014

10.1093/bioinformatics/btu404 Ver en origen

Número de citas: 52 (Web of Science) 46 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,981 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,633 (2014)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 4,171 (2014)
  • SNIP: 1,834 (2014)
  • Impacto JCR a 5 años: 8,136
  • Categorías JCR: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)

3D Cryo-Electron Reconstruction of BmrA, a Bacterial Multidrug ABC Transporter in an Inward-Facing Conformation and in a Lipidic Environment

  • Fribourg, Pierre Frederic
  • Chami, Mohamed
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Gubellini, Francesca
  • Marabini, Roberto
  • Marco, Sergio
  • Jault, Jean-Michel
  • Levy, Daniel
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JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY - 15/05/2014

10.1016/j.jmb.2014.03.002 Ver en origen

Número de citas: 21 (Web of Science) 21 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,333 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,657 (2014)
  • CiteScore: 8,5 (2020)
  • SJR: 2,823 (2014)
  • SNIP: 1,107 (2014)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,702
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)
Open Access

A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images

  • Merelo, JJ
  • Prieto, A
  • Moran, F
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Mira, J
  • MorenoDiaz, R
  • Cabestany, J
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Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997

10.1007/bfb0032577 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

An image processing approach to the simulation of electron microscopy volumes of atomic structures

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • De La Rosa-Trevin, J.M.
  • Del Riego, S.
  • Fernandez-Alderete, A.
  • Martinez-Rey, C.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
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2014 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2014 - 28/01/2014

10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen

Número de citas:
  • Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
... Ver más Contraer

COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Electron tomography of biological specimens

  • Marabini R.
  • Carmen San Martin M.
  • Carazo J.

Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997

10.3233/978-1-60750-874-8-53

Número de citas: 2 (Scopus)
  • CiteScore: 1,2 (2020)

Este autor no tiene patentes.

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,4
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

On the suitability of biological structure determination by electron microscopy to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/03/2005

10.1007/bf03037653

Número de citas: 7 (Web of Science) 6 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q3 (2005)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,5 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,442 (2005)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,6 (2005)
  • SNIP: 1,719 (2005)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Biological structure determination by EM is well suited to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/06/2004

10.1007/bf03040957

Número de citas:
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,854 (2022)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,556 (2004)
  • SNIP: 1,19 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Scopus: 23

Web of Science: 27

Scopus: 57

Web of Science: 69

Última actualización de los datos: 20/04/24 8:36
Próxima recolección programada: 27/04/24 3:00