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Marabini Ruiz, Roberto Autor

Image processing and 3-D reconstruction in electron microscopy

  • Fernandez, J.-J.
  • Sorzano, C.O.S.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.-M.

IEEE Signal Processing Magazine - 1/05/2006

10.1109/msp.2006.1628881 Ver en origen

Número de citas: 38 (Web of Science) 40 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2006)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,655 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 1,274 (2006)
  • CiteScore: 18,8 (2020)
  • SJR: 1,507 (2006)
  • SNIP: 5,057 (2006)
  • Categorías SJR: Applied Mathematics (Q1); Electrical and Electronic Engineering (Q1); Music (Q1); Signal Processing (Q1)

Multiobjective algorithm parameter optimization using multivariate statistics in three-dimensional electron microscopy reconstruction

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Carazo, JM

Pattern Recognition - 1/12/2005

10.1016/j.patcog.2005.03.013 Ver en origen

Número de citas: 7 (Web of Science) 7 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 15,7 (2020)
  • SJR: 1,069 (2005)
  • SNIP: 2,922 (2005)
  • Categorías SJR: Artificial Intelligence (Q1); Computer Vision and Pattern Recognition (Q1); Signal Processing (Q1); Software (Q1)

Classification of single-projection reconstructions for cryo-electron microscopy data of icosahedral viruses

  • Scheres, S.H.W.
  • Marabini, R.
  • Lanzavecchia, S.
  • Cantele, F.
  • Rutten, T.
  • Fuller, S.D.
  • Carazo, J.M.
  • Burnett, R.M.
  • San Martín, C.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/07/2005

10.1016/j.jsb.2005.04.003 Ver en origen

Número de citas: 18 (Web of Science) 20 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2005)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,49 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,325 (2005)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,846 (2005)
  • SNIP: 1,217 (2005)
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)

Maximum-likelihood multi-reference refinement for electron microscopy images

  • Scheres, SHW
  • Valle, M
  • Nunez, R
  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Carazo, JM
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JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY - 22/04/2005

10.1016/j.jmb.2005.02.031 Ver en origen

Número de citas: 203 (Web of Science) 190 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2005)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,229 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 3,14 (2005)
  • CiteScore: 8,5 (2020)
  • SJR: 4,147 (2005)
  • SNIP: 1,414 (2005)
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)
Open Access

Grid computing in structure determination of biological specimens by electron microscope tomography

  • Fernández J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • García I.

Grid Computing - 1/12/2004

10.1007/978-3-540-24689-3_22

Número de citas: 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,347 (2004)
  • SNIP: 0,851 (2004)

XMIPP: a new generation of an open-source image processing package for electron microscopy

  • Sorzano, C.O.S.
  • Marabini, R.
  • Velázquez-Muriel, J.
  • Bilbao-Castro, J.R.
  • Scheres, S.H.W.
  • Carazo, J.M.
  • Pascual-Montano, A.
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2004

10.1016/j.jsb.2004.06.006 Ver en origen

Número de citas: 380 (Web of Science) 363 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 3,132 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 6,073 (2004)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,385 (2004)
  • SNIP: 1,286 (2004)
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q2)

The potential of grid computing in three-dimensional electron microscopy

  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.
  • Fernandez J.

Parallel Processing Letters - 1/06/2004

10.1142/s0129626404001805

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 1,2 (2020)
  • SJR: 0,23 (2004)
  • SNIP: 0,664 (2004)
  • Categorías SJR: Hardware and Architecture (Q3); Software (Q3); Theoretical Computer Science (Q4)

3-D reconstruction of 2-D crystals in real space

  • Marabini, R
  • Sorzano, COS
  • Matej, S
  • Fernandez, JJ
  • Carazo, JM
  • Herman, GT

IEEE Transactions on Image Processing - 1/04/2004

10.1109/tip.2003.822620 Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2004)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,011 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,483 (2004)
  • CiteScore: 16,3 (2020)
  • SJR: 1,315 (2004)
  • SNIP: 4,401 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Graphics and Computer-Aided Design (Q1); Software (Q1)

Transfer function restoration in 3D electron microscopy via iterative data refinement

  • Sorzano, COS
  • Marabini, R
  • Herman, GT
  • Censor, Y
  • Carazo, JM

Physics in Medicine and Biology - 21/02/2004

10.1088/0031-9155/49/4/003 Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 16 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 2,368 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,34 (2004)
  • CiteScore: 5,9 (2020)
  • SJR: 1,047 (2004)
  • SNIP: 1,645 (2004)
  • Categorías SJR: Radiological and Ultrasound Technology (Q1); Radiology, Nuclear Medicine and Imaging (Q1)

Three-dimensional reconstruction by Chahine's method from electron microscopic projections corrupted by instrumental aberrations

  • Zubelli, J.P.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C.O.S.
  • Herman, G.T.

INVERSE PROBLEMS - 1/08/2003

10.1088/0266-5611/19/4/310 Ver en origen

Número de citas: 13 (Web of Science) 13 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 3,7 (2020)
  • SJR: 0,796 (2003)
  • SNIP: 1,378 (2003)
  • Categorías SJR: Theoretical Computer Science (Q1); Applied Mathematics (Q2); Computer Science Applications (Q2); Signal Processing (Q2); Mathematical Physics (Q3)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)
Open Access

A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images

  • Merelo, JJ
  • Prieto, A
  • Moran, F
  • Marabini, R
  • Carazo, JM
  • Mira, J
  • MorenoDiaz, R
  • Cabestany, J
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Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997

10.1007/bfb0032577 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
Open Access

ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING

  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FERNANDEZ, JJJ
  • CARAZO, JM
  • LADJADJ, M
  • ODESANYA, O
  • FRANK, J
  • Robb, RA
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Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994

10.1117/12.185208 Ver en origen

Número de citas: 1 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • CiteScore: 0,8 (2020)

An image processing approach to the simulation of electron microscopy volumes of atomic structures

  • Sorzano, C.O.S.
  • Vargas, J.
  • Oton, J.
  • Abrishami, V.
  • De La Rosa-Trevin, J.M.
  • Del Riego, S.
  • Fernandez-Alderete, A.
  • Martinez-Rey, C.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J.M.
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2014 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2014 - 28/01/2014

10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen

Número de citas:
  • Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition

Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particles

  • Sorzano, C. O. S.
  • Iriarte, A.
  • Marabini, R.
  • Carazo, J. M.
  • IEEE

WISP 2009 - 6th IEEE International Symposium on Intelligent Signal Processing - Proceedings - 10/08/2009

10.1109/wisp.2009.5286563 Ver en origen

Número de citas: 3 (Scopus)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications; Media Technology; Signal Processing
Open Access

Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization

  • Arganda-Carreras, Ignacio
  • Sorzano, Carlos O. S.
  • Marabini, Roberto
  • Carazo, Jose Maria
  • Ortiz-de-Solorzano, Carlos
  • Kybic, Jan
  • Beichel, RR
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COMPUTER VISION APPROACHES TO MEDICAL IMAGE ANALYSIS - 1/1/2006

10.1007/11889762_8 Ver en origen

Número de citas: 262 (Web of Science) 203 (Scopus)
  • CiteScore: 1,8 (2020)
  • SJR: 0,317 (2006)
  • SNIP: 0,679 (2006)

Electron tomography of biological specimens

  • Marabini R.
  • Carmen San Martin M.
  • Carazo J.

Studies in Health Technology and Informatics - 1/1/1997

10.3233/978-1-60750-874-8-53

Número de citas: 2 (Scopus)
  • CiteScore: 1,2 (2020)

Este autor no tiene patentes.

Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)

  • Sorzano C.O.S.
  • Vilas J.L.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Krieger J.
  • Del Hoyo D.
  • Herreros D.
  • Fernandez-Giménez E.
  • Marchán D.
  • De Isidro Gómez F.
  • Macías J.R.
  • Sánchez I.
  • Del Caño L.
  • Fonseca-Reyna Y.
  • Conesa P.
  • García-Mena A.
  • Burguet J.
  • García Condado J.
  • Méndez García J.
  • Martínez M.
  • Muñoz-Barrutia A.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Carazo J.M.
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FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022

10.1039/d2fd90074b

Número de citas:
  • Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,4
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL

Near Atomic Structure of an Atadenovirus Reveals a Conserved Capsid-Binding Motif and Intergenera Variations in Cementing Proteins

  • Roberto Marabini
  • Gabriela N. Condezo
  • Josué Gómez-Blanco
  • Carmen San Martín

Science Advances - 24/07/2020

10.1101/2020.07.24.220046

  • Factor Impacto JCR: 14,143 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 16,45
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • ORCID

On the suitability of biological structure determination by electron microscopy to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/03/2005

10.1007/bf03037653

Número de citas: 7 (Web of Science) 6 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q3 (2005)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,5 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,442 (2005)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,6 (2005)
  • SNIP: 1,719 (2005)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Biological structure determination by EM is well suited to grid computing

  • Fernandez J.
  • Bilbao-Castro J.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Garcia I.

New Generation Computing - 1/06/2004

10.1007/bf03040957

Número de citas:
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 0,854 (2022)
  • CiteScore: 2,1 (2020)
  • SJR: 0,556 (2004)
  • SNIP: 1,19 (2004)
  • Categorías SJR: Computer Networks and Communications (Q2); Hardware and Architecture (Q2); Software (Q2); Theoretical Computer Science (Q2)

Scopus: 23

Web of Science: 27

Scopus: 57

Web of Science: 69

Última actualización de los datos: 27/04/24 8:34
Próxima recolección programada: 4/05/24 3:00