Carazo García, José María Autor
A deep learning approach to the automatic detection of alignment errors in cryo-electron tomographic reconstructions
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- Vilas J.L.
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- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
Journal of Structural Biology - 1/3/2024
- CiteScore: 6,3 (2023)
- SJR: 1,771 (2023)
- SNIP: 0,801 (2023)
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ICAM-1 nanoclusters regulate hepatic epithelial cell polarity by leukocyte adhesion-independent control of apical actomyosin
- Cristina Cacho Navas
- Lopez-Pujante, Carmen
- Reglero-Real, Natalia
- Natalia Colás-Algora
- Ana Cuervo
- J.J. Conesa
- Barroso, Susana
- de Rivas, Gema
- Sergio Ciordia
- Alberto Paradela
- Gianluca D'Agostino
- Manzo, Carlo
- Feito, Jorge
- German Andres
- Molina-Jimenez, Francisca
- Majano, Pedro
- Isabel Correas
- Jose Maria Carazo Garcia
- Nourshargh, Sussan
- Huch, Meritxell
- Jaime Millán
Elife - 10/04/2024
- ORCID
Scipion Flexibility Hub: an integrative framework for advanced analysis of conformational heterogeneity in cryoEM
- Herreros D.
- Krieger J.M.
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- Conesa P.
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- Jonic S.
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Acta Crystallographica Section D-Structural Biology - 1/7/2023
- Factor Impacto JCR: 2,6 (2023)
- CiteScore: 7,5 (2022)
- SJR: 3,87 (2022)
- SNIP: 1,47 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 5,2
- Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
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A Fijivirus Major Viroplasm Protein Shows RNA-Stimulated ATPase Activity by Adopting Pentameric and Hexameric Assemblies of Dimers
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- Cerutti M.L.
- Klinke S.
- Mikkelsen E.
- Tijman A.
- Arranz R.
- Alfonso V.
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- Carazo J.M.
- Kaufman S.B.
- Dans P.D.
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- Otero L.H.
mBio - 25/4/2023
- Factor Impacto JCR: 5,1 (2023)
- CiteScore: 10,8 (2022)
- SJR: 2,283 (2022)
- SNIP: 1,357 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 5,9
- Categorías JCR: MICROBIOLOGY
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A new algorithm for particle weighted subtraction to decrease signals from unwanted components in single particle analysis
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- Marabini R.
- Strelak D.
- Sánchez-García R.
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- Sorzano C.O.S.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/2023
- Factor Impacto JCR: 3 (2023)
- CiteScore: 6,1 (2022)
- SJR: 1,582 (2022)
- SNIP: 0,773 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 2,5
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
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Local defocus estimation in single particle analysis in cryo-electron microscopy
- Fernandez-Gimenez E.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/12/2023
- Factor Impacto JCR: 3 (2023)
- CiteScore: 6,1 (2022)
- SJR: 1,582 (2022)
- SNIP: 0,773 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 2,5
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
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Umbrella Data Management Plans to Integrate FAIR Data : Lessons From the ISIDORe and BY-COVID Consortia for Pandemic Preparedness
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- Connellan C.
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- Houde M.
- Kemmer I.
- Keppler A.
- Lieutaud P.
- Ohmann C.
- Panagiotopoulou M.
- Khan S.R.
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- Soiland-Reyes S.
- Wit C.
- Wittner R.
- Buono R.A.
- Marsh S.A.
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- Bonfils D.
- Carazo J.M.
- Charrel R.
- Coppens F.
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- Romano P.
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ZART: A Novel Multiresolution Reconstruction Algorithm with Motion-blur Correction for Single Particle Analysis
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JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY - 1/1/2023
- Factor Impacto JCR: 4,7 (2023)
- CiteScore: 10,8 (2022)
- SJR: 2,421 (2022)
- SNIP: 1,281 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 4,9
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
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- Web of Science
Performance and Quality Comparison of Movie Alignment Software for Cryogenic Electron Microscopy
- David Střelák
- Daniel Marchán
- José María Carazo
- Carlos O. S. Sorzano
Micromachines - 26/09/2023
- Factor Impacto JCR: 3 (2023)
- Impacto JCR a 5 años: 3
- Categorías JCR: NANOSCIENCE & NANOTECHNOLOGY
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Estimating conformational landscapes from Cryo-EM particles by 3D Zernike polynomials
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- J. M. Krieger
- A. Jiménez-Moreno
- M. Martínez
- D. Myška
- D. Strelak
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Nature Communications - 11/01/2023
- Factor Impacto JCR: 14,7 (2023)
- Impacto JCR a 5 años: 16,1
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
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Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
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- Strelak D.
- Filipovic J.
- Fernández-Giménez E.
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- Fonseca Y.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,711 (2020)
- SNIP: 0,57 (2020)
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Interchanging geometry information in electron microscopy single particle analysis: mathematical context for the development of a standard.
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- Roberto Marabini
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- J. Otón
- J. Cuenca-Alba
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- J.M. de la Rosa-Trevín
- Jose Maria Carazo Garcia
Computational Methods For Three-dimensional Microscopy Reconstruction - 2014
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Soft X-ray tomography imaging for biological samples
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards
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Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2013
- Cuartil SJR: Q3
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,751 (2013)
- SNIP: 0,362 (2013)
- Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)
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AN INTRODUCTION TO MAXIMUM-LIKELIHOOD METHODS IN CRYO-EM
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Methods in Enzymology - 1/1/2010
- Factor Impacto JCR: 1,626 (2010)
- CiteScore: 2,6 (2020)
- SJR: 1,408 (2010)
- SNIP: 0,493 (2010)
- Impacto JCR a 5 años: 2,185
- Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
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- Web of Science
Exploring the conformational flexibility of molecular machines
- Sjors Scheres
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- Jose Maria Carazo Garcia
Mathematical Methods In Biomedical Imaging and Intensity-modulated Radiation Therapy (imrt) - 2008
- ORCID
Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy
- Carazo J.
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Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006
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- ORCID
High performance computing in electron microscope tomography of complex biological structures
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Lecture Notes In Computer Science - 1/12/2003
- CiteScore: 1,8 (2020)
- SJR: 0,41 (2003)
- SNIP: 0,882 (2003)
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A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images
- Merelo, JJ
- Prieto, A
- Moran, F
- Marabini, R
- Carazo, JM
- Mira, J
- MorenoDiaz, R
- Cabestany, J
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997
10.1007/bfb0032577 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
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- Web of Science
Fast Global Image Alignment Algorithm for CryoEM through Vector Compression
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- Ramirez-Aportela E.
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Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging - 1/1/2024
10.1109/isbi56570.2024.10635352
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Scipion flexibility hub and Scipion chem: New frameworks coupling computational biophysics of protein dynamics and virtual screening to cryo-electron microscopy
- James Krieger
- David Herreros
- del Hoyo, Daniel
- Fonseca, Yunior
- Marcos Gragera
- Carlos P. Mata
- Lomas, Alba
- Ulzurrun, Eugenia
- Pablo Conesa Mingo
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
Biophysical Journal - 8/02/2024
- ORCID
The role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the spike A222V mutation
- Tiziana Ginex
- Wieczór, M.
- Krieger, J.
- Orozco, M.
- Jose Maria Carazo Garcia
- Carmen Gil
Xx Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica - 2022
- ORCID
Imaging Data: Adding a new type of annotations to 3DBionotes-WS
- Carolina Simón Guerrero
- Jose Ramon Macias
- Erney Ramírez-Aportela
- Jose Luis Vilas Prieto
- Marta Martinez Gonzalez
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
21st European Conference On Computational Biology - 2022
- ORCID
3DBionotes COVID-19 Structural Hub: a central resource for validation information and refined models
- Jose Ramon Macias
- Carolina Simon-Guerrero
- Erney Ramírez-Aportela
- Jose Luis Vilas Prieto
- Marta Martínez González
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
21st European Conference On Computational Biology - 2022
- ORCID
Stream processing of CryoElectron Microscopy images at the acquisition site
- D. Marchán
- A. García-Mena
- P. Conesa
- Francisco Javier Chichón García
- R. Arranz
- Y. Fonseca-Reyna
- L. del Caño
- I. Sánchez-López
- M. Iceta
- Jose Maria Carazo Garcia
- Carlos Oscar S. Sorzano
Instruct Biennial Structural Biology Conference - 2022
- ORCID
Evolutionary genomics of SARS-CoV-2: keys for viral success (Conf. Invitada: S2.2 2)
- Miguel Álvarez-Herrera
- Jose Maria Carazo Garcia
- Comas I
- Mireia Coscolla
- Santiago F. Elena
- Clara Francés-Gómez
- Maria Luisa Franco
- Daniel García Rasines
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- Carmen Gil
- Fernando González-Candelas
- Julia Hillung
- José Luis Llácer
- Marina, A.
- María Carmen Marques
- Roi Naveiro Flores
- David Rios Insua
- Simón Rodríguez Santana
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Carlos Óscar S. Sorzano
- Eugenia Ulzurum
- Marçal Vilar
44º Congreso de la Sebbm - 2022
- ORCID
Evolutionary genomics of SARS-CoV-2: key for viral success
- Álvarez-Herrera, M.
- Jose Maria Carazo Garcia
- Comas I
- Coscollà, M.
- Santiago F. Elena
- Francés-Gómez, C.
- Franco, M.L.
- García Rasines, D.
- Geller, R.
- Carmen Gil
- Fernando Gonzalez-Candelas
- Hillung, J.
- José Luis Llácer
- Marina, A.
- Marqués, M.C.
- Naveiro Flores, R.
- Ríos, D.
- Rodríguez Santana, S.
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Ulzurum, E.
- Vidal, M.
44º Congreso Nacional de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular - 2022
- ORCID
Caracterización estructural de la proteína mayoritaria de viroplasma P9-1 del virus del mal de Río Cuarto
- Gabriela Llauger
- Roberto Melero
- Demian Monti
- Gabriela Sycz
- Cristina Huck-Iriart
- María L. Cerutti
- Sebastian Klinke
- Rocío Arranz
- Yann G.Sterckx
- Vcitoria Alonso
- Sofia Maite Arellano
- Jose Maria Carazo Garcia
- FernandoA.Goldbaum
- Mariana del VAs
- Lisandro H. Otero
Xiii Congreso Argentino de Virología 2021 - 2021
- ORCID
FSC-Q: A method for quality analysis of cryoEM-derived models
- Erney Ramírez-Aportela
- David Maluenda Niubó
- Fonseca, Yunior C.
- Pablo Conesa Mingo
- Roberto Marabini
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 08/2021
- ORCID
Este autor no tiene patentes.
Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing
- James Michael Krieger
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES - 10/08/2023
- Factor Impacto JCR: 4,9 (2023)
- CiteScore: 7,8 (2022)
- SJR: 1,154 (2022)
- SNIP: 1,263 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 5,6
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Scopus
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- Web of Science
Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)
- Sorzano C.O.S.
- Vilas J.L.
- Ramírez-Aportela E.
- Krieger J.
- Del Hoyo D.
- Herreros D.
- Fernandez-Giménez E.
- Marchán D.
- De Isidro Gómez F.
- Macías J.R.
- Sánchez I.
- Del Caño L.
- Fonseca-Reyna Y.
- Conesa P.
- García-Mena A.
- Burguet J.
- García Condado J.
- Méndez García J.
- Martínez M.
- Muñoz-Barrutia A.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Carazo J.M.
FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022
- Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 3,4
- Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL
Erratum: The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation (PLoS Pathog (2022) 18:7 (e1010631) DOI: 10.1371/journal.ppat.1010631)
- Ginex T.
- Marco-Marín C.
- Wieczór M.
- Mata C.
- Krieger J.
- Ruiz-Rodriguez P.
- López-Redondo M.L.
- Francés-Gómez C.
- Melero R.
- Sánchez-Sorzano C.Ó.
- Martínez M.
- Gougeard N.
- Forcada-Nadal A.
- Zamora-Caballero S.
- Gozalbo-Rovira R.
- Sanz-Frasquet C.
- Arranz R.
- Bravo J.
- Rubio V.
- Marina A.
- Geller R.
- Comas I.
- Gil C.
- Coscolla M.
- Orozco M.
- Llácer J.L.
- Carazo J.M.
PLoS Pathogens - 1/11/2022
- Factor Impacto JCR: 6,7 (2022)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 6,7
- Categorías JCR: VIROLOGY
The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation
- Tiziana Ginex
- Clara Marco-Marín
- Miłosz Wieczór
- Carlos P. Mata
- James Krieger
- Maria Luisa López-Redondo
- Clara Francés-Gómez
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Roberto Melero
- Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
- Marta Martínez
- Nadine Gougeard
- Alicia Forcada-Nadal
- Sara Zamora-Caballero
- Roberto Gozalbo-Rovira
- Carla Sanz-Frasquet
- Jeronimo Bravo
- Vicente Rubio
- Alberto Marina
- Ron Geller
- Iñaki Comas
- Carmen Gil
- Mireia Coscolla
- Modesto Orozco
- José Luis Llácer
- José-Maria Carazo
PLoS Pathogens - 7/12/2021
- Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 7,913
- Categorías JCR: VIROLOGY
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- Web of Science
ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions
- Kazemi M.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
- Georges A.d.
- Abrishami V.
- Vargas J.
Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021
10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001
- Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 0,859 (2020)
- SNIP: 0,995 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 3,907
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
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- Web of Science
Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19
- Sorzano co
- Crisman E
- Carazo JM
- leon r
15/07/2020
- ORCID
DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing
- Ruben Sanchez Garcia
- Josue Gomez-Blanco
- Ana Cuervo
- Jose Maria Carazo
- Carlos Oscar S Sorzano
- Javier Vargas
13/06/2020
- ORCID
FSC-Q: A CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier Shell Correlation
- Ramírez-Aportela E
- Maluenda D
- Fonseca YC
- Conesa P
- Marabini R
- Heymann JB
- Carazo JM
- Sorzano COS
05/2020
- ORCID
Improvements on marker-free images alignment for electron tomography
- C.O.S. Sorzano
- F. de Isidro-Gómez
- E. Fernández-Giménez
- D. Herreros
- S. Marco
- J.M. Carazo
- C. Messaoudi
Journal of Structural Biology: X - 24/05/2020
- Cuartil SJR: Q4
- Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,474
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q4)
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- ORCID
- Web of Science
Índice h
Scopus: 52
Web of Science: 54
Índice i10
Scopus: 178
Web of Science: 192
Perfiles de autor
-
ORCID
-
Web of Science ResearcherID
-
Scopus Author ID
-
Dialnet id
Proyectos de investigación en la UAL
-
Acrónimo 99109Desde: 2 de junio de 1999Hasta: 2 de junio de 2000Financiado por: Ministerio de Asuntos ExterioresImporte de financiación: 19.232,39 EURRol: Investigador