Carazo García, José María Autor
Fringe pattern denoising by image dimensionality reduction
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OPTICS AND LASERS IN ENGINEERING - 1/07/2013
10.1016/j.optlaseng.2013.02.016 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 1,695 (2013)
- CiteScore: 8,5 (2020)
- SJR: 0,864 (2013)
- SNIP: 1,843 (2013)
- Impacto JCR a 5 años: 1,948
- Categorías JCR: OPTICS
- Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1); Electrical and Electronic Engineering (Q1); Electronic, Optical and Magnetic Materials (Q1); Mechanical Engineering (Q1)
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- Janowski, Robert
- Mortuza, Gulnahar
- Bertero, Michela G.
- Boutin, Mailys
- Guarin, Nayibe
- Mendez-Giraldez, Raul
- Nunez, Alfonso
- Pedrero, Juan G.
- Redondo, Pilar
- Sanz, Maria
- Speroni, Silvia
- Teichert, Florian
- Bruix, Marta
- Carazo, Jose M.
- Gonzalez, Cayetano
- Reina, Jose
- Valpuesta, Jose M.
- Vernos, Isabelle
- Zabala, Juan C.
- Montoya, Guillermo
- Coll, Miquel
- Bastolla, Ugo
- Serrano, Luis
Plos One - 9/05/2013
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,534 (2013)
- CiteScore: 5,3 (2020)
- SJR: 1,772 (2013)
- SNIP: 1,166 (2013)
- Impacto JCR a 5 años: 4,015
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- Categorías SJR: Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous) (Q1); Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (Q1); Medicine (miscellaneous) (Q1)
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On the development of three new tools for organizing and sharing information in three-dimensional electron microscopy
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Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography - 1/05/2013
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- Factor Impacto JCR: 7,232 (2013)
- CiteScore: 5,5 (2015)
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/02/2013
10.1016/j.jsb.2012.12.006 Ver en origen
- Cuartil JCR: Q2 (2013)
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,369 (2013)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,645 (2013)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,596 (2013)
- SNIP: 1,256 (2013)
- Impacto JCR a 5 años: 3,407
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
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Generalization of the Principal Component Analysis algorithm for interferometry
- Vargas, J.
- Sorzano, C. O. S.
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OPTICS COMMUNICATIONS - 1/01/2013
10.1016/j.optcom.2012.09.017 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 1,542 (2013)
- CiteScore: 4,4 (2020)
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- SNIP: 1,147 (2013)
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- Categorías JCR: OPTICS
- Categorías SJR: Electrical and Electronic Engineering (Q1); Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q2); Electronic, Optical and Magnetic Materials (Q2); Physical and Theoretical Chemistry (Q2)
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Image processing for Cellular tomography using soft X-rays
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2012 9th Ieee International Symposium on Biomedical Imaging (Isbi) - 2012
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Data management challenges in three-dimensional EM
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- Henderson, Richard
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- Jensen, Grant J.
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- Roseman, Alan
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NATURE STRUCTURAL and MOLECULAR BIOLOGY - 1/12/2012
10.1038/nsmb.2426 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 11,902 (2012)
- CiteScore: 19,3 (2020)
- SJR: 12,177 (2012)
- SNIP: 2,607 (2012)
- Impacto JCR a 5 años: 12,307
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)
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Corrigendum to "Fast, robust and accurate determination of transmission electron microscopy contrast transfer function" [J. Struct. Biol. 160 (2007) 249-262]
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JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2012
10.1016/j.jsb.2012.05.022 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,361 (2012)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,268 (2012)
- SNIP: 1,235 (2012)
- Impacto JCR a 5 años: 3,549
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
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Shack-Hartmann centroid detection using the spiral phase transform
- Vargas, J.
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APPLIED OPTICS - 20/10/2012
10.1364/ao.51.007362 Ver en origen
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 1,689 (2012)
- CiteScore: 3,8 (2020)
- SJR: 1,042 (2012)
- SNIP: 1,469 (2012)
- Impacto JCR a 5 años: 1,701
- Categorías JCR: OPTICS
- Categorías SJR: Atomic and Molecular Physics, and Optics (Q1); Electrical and Electronic Engineering (Q1); Engineering (miscellaneous) (Q1)
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Image formation in cellular X-ray microscopy
- Oton, Joaquin
- Sorzano, C. O. S.
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- Marabini, Roberto
Journal of Structural Biology - 1/04/2012
10.1016/j.jsb.2012.01.006 Ver en origen
- Cuartil JCR: Q2 (2012)
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 3,361 (2012)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,521 (2012)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,268 (2012)
- SNIP: 1,235 (2012)
- Impacto JCR a 5 años: 3,549
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
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Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
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- Herreros D.
- Conesa P.
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Methods in Molecular Biology - 1/1/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,711 (2020)
- SNIP: 0,57 (2020)
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Interchanging geometry information in electron microscopy single particle analysis: mathematical context for the development of a standard.
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Roberto Marabini
- J. Vargas
- J. Otón
- J. Cuenca-Alba
- A. Quintana
- J.M. de la Rosa-Trevín
- Jose Maria Carazo Garcia
Computational Methods For Three-dimensional Microscopy Reconstruction - 2014
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Soft X-ray tomography imaging for biological samples
- Otón J.
- Sorzano C.
- Chichón F.
- Carrascosa J.
- Carazo J.
- Marabini R.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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- Web of Science
Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards
- Sorzano C.
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- Cuenca-Alba J.
- Quintana A.
- de la Rosa-Trevín J.
- Carazo J.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
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Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy
- Sorzano C.
- De La Rosa Trevín J.
- Otón J.
- Vega J.
- Cuenca J.
- Zaldívar-Peraza A.
- Gómez-Blanco J.
- Vargas J.
- Quintana A.
- Marabini R.
- Carazo J.
Methods in Molecular Biology - 1/1/2013
- Cuartil SJR: Q3
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,751 (2013)
- SNIP: 0,362 (2013)
- Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)
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AN INTRODUCTION TO MAXIMUM-LIKELIHOOD METHODS IN CRYO-EM
- Sigworth, Fred J.
- Doerschuk, Peter C.
- Carazo, Jose-Maria
- Scheres, Sjors H. W.
- Jensen, GJ
Methods in Enzymology - 1/1/2010
- Factor Impacto JCR: 1,626 (2010)
- CiteScore: 2,6 (2020)
- SJR: 1,408 (2010)
- SNIP: 0,493 (2010)
- Impacto JCR a 5 años: 2,185
- Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
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- Web of Science
Exploring the conformational flexibility of molecular machines
- Sjors Scheres
- Herman, Gabor T.
- Jose Maria Carazo Garcia
Mathematical Methods In Biomedical Imaging and Intensity-modulated Radiation Therapy (imrt) - 2008
- ORCID
Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy
- Carazo J.
- Herman G.
- Sorzano C.
- Marabini R.
Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006
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A GA-optimized neural network for classification of biological particles from electron-microscopy images
- Merelo, JJ
- Prieto, A
- Moran, F
- Marabini, R
- Carazo, JM
- Mira, J
- MorenoDiaz, R
- Cabestany, J
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) - 1/1/1997
10.1007/bfb0032577 Ver en origen
- CiteScore: 1,8 (2020)
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ON A PROTOTYPE FOR A NEW DISTRIBUTED DATA-BASE OF VOLUME DATA OBTAINED BY 3D IMAGING
- MARABINI, R
- VAQUERIZO, C
- FERNANDEZ, JJJ
- CARAZO, JM
- LADJADJ, M
- ODESANYA, O
- FRANK, J
- Robb, RA
Visualization in Biomedical Computer 1994 - 9/09/1994
10.1117/12.185208 Ver en origen
- CiteScore: 0,8 (2020)
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Evolutionary genomics of SARS-CoV-2: key for viral success
- Álvarez-Herrera, M.
- Jose Maria Carazo Garcia
- Comas I
- Coscollà, M.
- Santiago F. Elena
- Francés-Gómez, C.
- Franco, M.L.
- García Rasines, D.
- Geller, R.
- Carmen Gil
- Fernando Gonzalez-Candelas
- Hillung, J.
- José Luis Llácer
- Marina, A.
- Marqués, M.C.
- Naveiro Flores, R.
- Ríos, D.
- Rodríguez Santana, S.
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Ulzurum, E.
- Vidal, M.
44º Congreso Nacional de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular - 2022
- ORCID
The role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the spike A222V mutation
- Tiziana Ginex
- Wieczór, M.
- Krieger, J.
- Orozco, M.
- Jose Maria Carazo Garcia
- Carmen Gil
Xx Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica - 2022
- ORCID
Stream processing of CryoElectron Microscopy images at the acquisition site
- D. Marchán
- A. García-Mena
- P. Conesa
- Francisco Javier Chichón García
- R. Arranz
- Y. Fonseca-Reyna
- L. del Caño
- I. Sánchez-López
- M. Iceta
- Jose Maria Carazo Garcia
- Carlos Oscar S. Sorzano
Instruct Biennial Structural Biology Conference - 2022
- ORCID
FSC-Q: A method for quality analysis of cryoEM-derived models
- Erney Ramírez-Aportela
- David Maluenda Niubó
- Fonseca, Yunior C.
- Pablo Conesa Mingo
- Roberto Marabini
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 08/2021
- ORCID
Scipion for tomography: An expansion of Scipion software framework towards integration, reproducibility and validation in cryo-electron tomography
- Federico P. de Isidro-Gómez
- de la Morena, Jorge Jimenez
- Pablo Conesa Mingo
- David Herreros
- Fernandez-Gimenez, Estrella
- Fonseca, Yunior C.
- Strelak, David
- J.J. Conesa
- Ana Cuervo
- Patricia Losana
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 08/2021
- ORCID
Oligomeric self-assembly of a coiled-coil-based bipyramidal protein cage
- Lapenta, F.
- Aupic, J.
- Vezzoli, M.
- Strmsek, Z.
- Da Vela, S.
- Svergun, D. I.
- Jose Maria Carazo Garcia
- Roberto Melero
- Jerala, R.
Febs Open Bio - 07/2021
- ORCID
Mesa redonda sobre investigadores y Ciencia Abierta
- Alonso, F.
- Emilio Cano
- María P. Martín
- Jose Maria Carazo Garcia
- Jan Thiele
5as Jornadas de Análisis de la Red de Bibliotecas y Archivos del Csic. Bibliotecas y Archivos del Csic Por la Ciencia Abierta: Presente y Futuro - 2019
- ORCID
Towards High Throughput cryoEM data acquisition and processing, assuring reproducibility
- Jose Maria Carazo Garcia
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- ORCID
Analysing cryoEM data quality in the post resolution revolution era: Validity criteria
- Jose Maria Carazo Garcia
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- ORCID
LocalDeblur: An automatic map sharpening by restauration of local resolution
- Ramirez-Aportela, E.
- Vilas, J. L.
- Carazo, J. M.
- Sanchez Sorzano, C. O.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- Factor Impacto JCR: 2,094 (2019)
- Impacto JCR a 5 años: 1,888
- Categorías JCR: BIOPHYSICS
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Este autor no tiene patentes.
Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing
- James Michael Krieger
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo
International Journal of Molecular Sciences - 10/08/2023
- CiteScore: 7,8 (2022)
- SJR: 1,154 (2022)
- SNIP: 1,263 (2022)
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- Web of Science
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Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)
- Sorzano C.O.S.
- Vilas J.L.
- Ramírez-Aportela E.
- Krieger J.
- Del Hoyo D.
- Herreros D.
- Fernandez-Giménez E.
- Marchán D.
- De Isidro Gómez F.
- Macías J.R.
- Sánchez I.
- Del Caño L.
- Fonseca-Reyna Y.
- Conesa P.
- García-Mena A.
- Burguet J.
- García Condado J.
- Méndez García J.
- Martínez M.
- Muñoz-Barrutia A.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Carazo J.M.
FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022
- Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 3,4
- Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL
Erratum: The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation (PLoS Pathog (2022) 18:7 (e1010631) DOI: 10.1371/journal.ppat.1010631)
- Ginex T.
- Marco-Marín C.
- Wieczór M.
- Mata C.
- Krieger J.
- Ruiz-Rodriguez P.
- López-Redondo M.L.
- Francés-Gómez C.
- Melero R.
- Sánchez-Sorzano C.Ó.
- Martínez M.
- Gougeard N.
- Forcada-Nadal A.
- Zamora-Caballero S.
- Gozalbo-Rovira R.
- Sanz-Frasquet C.
- Arranz R.
- Bravo J.
- Rubio V.
- Marina A.
- Geller R.
- Comas I.
- Gil C.
- Coscolla M.
- Orozco M.
- Llácer J.L.
- Carazo J.M.
PLoS Pathogens - 1/11/2022
- Factor Impacto JCR: 6,7 (2022)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 6,7
- Categorías JCR: VIROLOGY
The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation
- Tiziana Ginex
- Clara Marco-Marín
- Miłosz Wieczór
- Carlos P. Mata
- James Krieger
- Maria Luisa López-Redondo
- Clara Francés-Gómez
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Roberto Melero
- Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
- Marta Martínez
- Nadine Gougeard
- Alicia Forcada-Nadal
- Sara Zamora-Caballero
- Roberto Gozalbo-Rovira
- Carla Sanz-Frasquet
- Jeronimo Bravo
- Vicente Rubio
- Alberto Marina
- Ron Geller
- Iñaki Comas
- Carmen Gil
- Mireia Coscolla
- Modesto Orozco
- José Luis Llácer
- José-Maria Carazo
PLoS Pathogens - 7/12/2021
- Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 7,913
- Categorías JCR: VIROLOGY
- ORCID
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ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions
- Kazemi M.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
- Georges A.d.
- Abrishami V.
- Vargas J.
Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021
10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001
- Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 0,859 (2020)
- SNIP: 0,995 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 3,907
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- ORCID
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- Web of Science
Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19
- Sorzano co
- Crisman E
- Carazo JM
- leon r
15/07/2020
- ORCID
DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing
- Ruben Sanchez Garcia
- Josue Gomez-Blanco
- Ana Cuervo
- Jose Maria Carazo
- Carlos Oscar S Sorzano
- Javier Vargas
13/06/2020
- ORCID
FSC-Q: A CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier Shell Correlation
- Ramírez-Aportela E
- Maluenda D
- Fonseca YC
- Conesa P
- Marabini R
- Heymann JB
- Carazo JM
- Sorzano COS
05/2020
- ORCID
Improvements on marker-free images alignment for electron tomography
- C.O.S. Sorzano
- F. de Isidro-Gómez
- E. Fernández-Giménez
- D. Herreros
- S. Marco
- J.M. Carazo
- C. Messaoudi
Journal of Structural Biology: X - 24/05/2020
- Cuartil SJR: Q4
- Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,474
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q4)
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- Web of Science
Índice h
Scopus: 52
Web of Science: 54
Índice i10
Scopus: 178
Web of Science: 192
Perfiles de autor
-
ORCID
-
Web of Science ResearcherID
-
Scopus Author ID
-
Dialnet id
Proyectos de investigación en la UAL
-
Acrónimo 99109Desde: 2 de junio de 1999Hasta: 2 de junio de 2000Financiado por: Ministerio de Asuntos ExterioresImporte de financiación: 19.232,39 EURRol: Investigador