RDF/XML JSON-LD N3/Turtle RDF/JSON

Carazo García, José María Autor

ZART: A Novel Multiresolution Reconstruction Algorithm with Motion-blur Correction for Single Particle Analysis

  • Herreros D.
  • Kiska J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Filipovic J.
  • Carazo J.M.
  • Sorzano C.O.S.

Journal of Molecular Biology - 1/1/2023

10.1016/j.jmb.2023.168088

Número de citas: 2 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • CiteScore: 10,8 (2022)
  • SJR: 2,421 (2022)
  • SNIP: 1,281 (2022)

XTEND: Extending the depth of field in cryo soft X-ray tomography

  • Otón J.
  • Pereiro E.
  • Conesa J.
  • Chichón F.
  • Luque D.
  • Rodríguez J.
  • Pérez-Berná A.
  • Sorzano C.
  • Klukowska J.
  • Herman G.
  • Vargas J.
  • Marabini R.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
... Ver más Contraer

Scientific Reports - 4/04/2017

10.1038/srep45808

Número de citas: 13 (Web of Science) 12 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q1 (2017)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,122 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,886 (2017)
  • CiteScore: 7,1 (2020)
  • SJR: 1,533 (2017)
  • SNIP: 1,263 (2017)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,609
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)
Open Access

X-ray structure of full-length human RuvB-Like 2-mechanistic insights into coupling between ATP binding and mechanical action

  • Silva, Sara T. N.
  • Brito, Jose A.
  • Arranz, Rocio
  • Sorzano, Carlos Oscar S.
  • Ebel, Christine
  • Doutch, James
  • Tully, Mark D.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Carrascosa, Jose L.
  • Matias, Pedro M.
  • Bandeiras, Tiago M.
... Ver más Contraer

Scientific Reports - 13/09/2018

10.1038/s41598-018-31997-z Ver en origen

Número de citas: 16 (Web of Science) 10 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 4,011 (2018)
  • CiteScore: 4,29 (2018)
  • SJR: 1,414 (2018)
  • SNIP: 1,24 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,525
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)

Xmipp: An image processing package for electron microscopy

  • Marabini, R.
  • Masegosa, I.M.
  • San Martín, M.C.
  • Marco, S.
  • Fernández, J.J.
  • De La Fraga, L.G.
  • Vaquerizo, C.
  • Carazo, J.M.
... Ver más Contraer

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/01/1996

10.1006/jsbi.1996.0036 Ver en origen

Número de citas: 169 (Web of Science) 169 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 3,071 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 3,149 (1996)
  • CiteScore: 5,5 (2020)

XMIPP: a new generation of an open-source image processing package for electron microscopy

  • Sorzano, C.O.S.
  • Marabini, R.
  • Velázquez-Muriel, J.
  • Bilbao-Castro, J.R.
  • Scheres, S.H.W.
  • Carazo, J.M.
  • Pascual-Montano, A.
... Ver más Contraer

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2004

10.1016/j.jsb.2004.06.006 Ver en origen

Número de citas: 380 (Web of Science) 363 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2004)
  • Cuartil SJR: Q2
  • Factor Impacto JCR: 3,132 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 6,073 (2004)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,385 (2004)
  • SNIP: 1,286 (2004)
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q2)

Xmipp 3.0: An improved software suite for image processing in electron microscopy

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Oton, J.
  • Marabini, R.
  • Zaldivar, A.
  • Vargas, J.
  • Carazo, J. M.
  • Sorzano, C. O. S.
... Ver más Contraer

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY - 1/11/2013

10.1016/j.jsb.2013.09.015 Ver en origen

Número de citas: 217 (Web of Science) 172 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2013)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,369 (2013)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 5,507 (2013)
  • CiteScore: 5,5 (2020)
  • SJR: 2,596 (2013)
  • SNIP: 1,256 (2013)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,407
  • Categorías JCR: CELL BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology (Q1)
Open Access

West-Life: A Virtual Research Environment for structural biology

  • Morris C.
  • Andreetto P.
  • Banci L.
  • Bonvin A.M.J.J.
  • Chojnowski G.
  • Cano L.d.
  • Carazo J.M.
  • Conesa P.
  • Daenke S.
  • Damaskos G.
  • Giachetti A.
  • Haley N.E.C.
  • Hekkelman M.L.
  • Heuser P.
  • Joosten R.P.
  • Kouřil D.
  • Křenek A.
  • Kulhánek T.
  • Lamzin V.S.
  • Nadzirin N.
  • Perrakis A.
  • Rosato A.
  • Sanderson F.
  • Segura J.
  • Schaarschmidt J.
  • Sobolev E.
  • Traldi S.
  • Trellet M.E.
  • Velankar S.
  • Verlato M.
  • Winn M.
... Ver más Contraer

Journal of Structural Biology: X - 1/01/2019

10.1016/j.yjsbx.2019.100006

Número de citas: 2 (Web of Science) 2 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 3,071 (null)
  • CiteScore: 1,7 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,529
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
  • Categorías SJR: Structural Biology

Volumetric restrictions in single particle 3DEM reconstruction

  • Sorzano, C.O.S.
  • Velázquez-Muriel, J.A.
  • Marabini, R.
  • Herman, G.T.
  • Carazo, J.M.

Pattern Recognition - 1/02/2008

10.1016/j.patcog.2007.06.010 Ver en origen

Número de citas: 10 (Web of Science) 8 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2008)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 3,279 (2022)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,326 (2008)
  • CiteScore: 15,7 (2020)
  • SJR: 1,196 (2008)
  • SNIP: 2,213 (2008)
  • Categorías SJR: Artificial Intelligence (Q1); Computer Vision and Pattern Recognition (Q1); Signal Processing (Q1); Software (Q1)
Open Access

Variations of the three-dimensional structure of the Escherichia coli ribosome in the range of overlap views. An application of the methods of multicone and local single-cone three-dimensional reconstruction.

  • CARAZO, JM
  • WAGENKNECHT, T
  • FRANK, J

Biophysical Journal - 1/03/1989

10.1016/s0006-3495(89)82840-1

Número de citas: 27 (Web of Science) 25 (Scopus)
  • CiteScore: 6,3 (2020)

Validation of electron microscopy initial models via small angle X-ray scattering curves

  • Jiménez A.
  • Jonic S.
  • Majtner T.
  • Otón J.
  • Vilas J.
  • Maluenda D.
  • Mota J.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Rancel Y.
  • Segura J.
  • Sánchez-García R.
  • Melero R.
  • Del Cano L.
  • Conesa P.
  • Skjaerven L.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
  • Sorzano C.
... Ver más Contraer

Bioinformatics - 15/07/2019

10.1093/bioinformatics/bty985

Número de citas: 6 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 5,61 (2019)
  • CiteScore: 9,9 (2020)
  • SJR: 3,567 (2019)
  • SNIP: 1,864 (2019)
  • Impacto JCR a 5 años: 9,853
  • Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  • Categorías SJR: Biochemistry (Q1); Computational Mathematics (Q1); Computational Theory and Mathematics (Q1); Computer Science Applications (Q1); Molecular Biology (Q1); Statistics and Probability (Q1)

Soft X-ray tomography imaging for biological samples

  • Otón J.
  • Sorzano C.
  • Chichón F.
  • Carrascosa J.
  • Carazo J.
  • Marabini R.

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_8

Número de citas: 4 (Web of Science) 3 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Semiautomatic, high-throughput, high-resolution protocol for three-dimensional reconstruction of single particles in electron microscopy

  • Sorzano C.
  • De La Rosa Trevín J.
  • Otón J.
  • Vega J.
  • Cuenca J.
  • Zaldívar-Peraza A.
  • Gómez-Blanco J.
  • Vargas J.
  • Quintana A.
  • Marabini R.
  • Carazo J.
... Ver más Contraer

Methods In Molecular Biology (clifton, N.j.) - 1/1/2013

10.1007/978-1-62703-137-0_11

Número de citas: 14 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q3
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,751 (2013)
  • SNIP: 0,362 (2013)
  • Categorías SJR: Genetics (Q3); Molecular Biology (Q3)

Interchanging geometry information in electron microscopy single particle analysis: mathematical context for the development of a standard.

  • Carlos Oscar S. Sorzano
  • Roberto Marabini
  • J. Vargas
  • J. Otón
  • J. Cuenca-Alba
  • A. Quintana
  • J.M. de la Rosa-Trevín
  • Jose Maria Carazo Garcia
... Ver más Contraer

Computational Methods For Three-dimensional Microscopy Reconstruction - 2014

  • ORCID

Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards

  • Sorzano C.
  • Marabini R.
  • Vargas J.
  • Otón J.
  • Cuenca-Alba J.
  • Quintana A.
  • de la Rosa-Trevín J.
  • Carazo J.
... Ver más Contraer

Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014

10.1007/978-1-4614-9521-5_2

Número de citas: 9 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2014)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
  • CiteScore: 0,8 (2020)
Open Access

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Sorzano C.O.S.
  • Jiménez-Moreno A.
  • Maluenda D.
  • Ramírez-Aportela E.
  • Martínez M.
  • Cuervo A.
  • Melero R.
  • Conesa J.J.
  • Sánchez-García R.
  • Strelak D.
  • Filipovic J.
  • Fernández-Giménez E.
  • de Isidro-Gómez F.
  • Herreros D.
  • Conesa P.
  • del Caño L.
  • Fonseca Y.
  • de la Morena J.J.
  • Macías J.R.
  • Losana P.
  • Marabini R.
  • Carazo J.M.
... Ver más Contraer

Methods in Molecular Biology - 1/1/2021

10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Número de citas: 5 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Cuartil JCR: Q2 (2021)
  • Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
  • CiteScore: 2,2 (2020)
  • SJR: 0,711 (2020)
  • SNIP: 0,57 (2020)

Exploring the conformational flexibility of molecular machines

  • Sjors Scheres
  • Herman, Gabor T.
  • Jose Maria Carazo Garcia

Mathematical Methods In Biomedical Imaging and Intensity-modulated Radiation Therapy (imrt) - 2008

  • ORCID

AN INTRODUCTION TO MAXIMUM-LIKELIHOOD METHODS IN CRYO-EM

  • Sigworth, Fred J.
  • Doerschuk, Peter C.
  • Carazo, Jose-Maria
  • Scheres, Sjors H. W.
  • Jensen, GJ

Methods in Enzymology - 1/1/2010

10.1016/s0076-6879(10)82011-7

Número de citas: 67 (Web of Science) 52 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 1,626 (2010)
  • CiteScore: 2,6 (2020)
  • SJR: 1,408 (2010)
  • SNIP: 0,493 (2010)
  • Impacto JCR a 5 años: 2,185
  • Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS

Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy

  • Carazo J.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Marabini R.

Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006

10.1007/978-0-387-69008-7_8

Número de citas: 18 (Scopus)

Volumetric constraints in 3D tomography applied to electron microscopy

  • Marabini R.
  • Herman G.
  • Sorzano C.
  • Carazo J.

Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging - 1/1/2002

10.1109/isbi.2002.1029339 Ver en origen

Número de citas: 5 (Scopus)

Using Scipion for Stream Image Processing at CryoEM Facilities

  • de la Rosa-Trevin, J. M.
  • Gomez-Blanco, J.
  • Conesa, P.
  • Rancel, Y.
  • del Cano, L.
  • Arranz, R.
  • Chichon, F. J.
  • Martin-Benito, J.
  • Carroni, M.
  • Fleichman, S.
  • Lindahl, E.
  • Basham, M.
  • Clare, D. K.
  • Savage, K.
  • Siebert, C. A.
  • Ashton, A. W.
  • Marabini, R.
  • Sorzano, C. O. S.
  • Carazo, J. M.
... Ver más Contraer

Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 07/2018

10.1107/s0108767318098380

  • Factor Impacto JCR: 1,878 (2018)
  • Impacto JCR a 5 años: 4,647
  • Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY

Two-way clustering of gene expression profiles by sparse matrix factorization

  • Pascual-Montano A.
  • Carmona-Sáez P.
  • Pascual-Marqui R.
  • Tirado F.
  • Carazo J.

2005 Ieee Computational Systems Bioinformatics Conference, Workshops and Poster Abstracts - 1/12/2005

10.1109/csbw.2005.137

Número de citas: 6 (Scopus)
  • Categorías SJR: Engineering (miscellaneous)

Towards High Throughput cryoEM data acquisition and processing, assuring reproducibility

  • Jose Maria Carazo Garcia

European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019

  • ORCID

Towards a data-bank of three-dimensional macromolecular structures: A WWW-based prototype

  • CARAZO, JM
  • MARABINI, R
  • VAQUERIZO, C
  • FRANK, J
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C

Electron Microscopy 1994, Vol 1 - 1994

THREE-DIMENSIONAL RECONSTRUCTION BY THE DIRECT FOURIER METHOD: AN IMAGE SIMULATION APPROACH TO THE CASE OF INCOMPLETE DATA.

  • Carazo J.M.
  • Carrascosa J.
  • Santisteban A.

1/12/1985

Número de citas:

Three-dimensional domain mapping in the bacteriophage phi 29 connector

  • Jose Valpuesta
  • Mikel Valle
  • Jose-Jesus Fernandez
  • Jose Maria Carazo Garcia
  • Albar, JP
  • Leonor Kremer
  • José L. Carrascosa
... Ver más Contraer

Electron Microscopy 1998, Vol 1 - 1998

  • ORCID

The role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the spike A222V mutation

  • Tiziana Ginex
  • Wieczór, M.
  • Krieger, J.
  • Orozco, M.
  • Jose Maria Carazo Garcia
  • Carmen Gil

Xx Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica - 2022

  • ORCID

STUDY OF THE COLLARS EXTRACTED FROM T3 AND 029 VIRAL PARTICLES

  • MARCO, S
  • VALPUESTA, JM
  • CARAZO, JM
  • MARABINI, R
  • FUJISAWA, H
  • CARRASCOSA, JL
  • Jouffrey, B
  • Colliex, C
... Ver más Contraer

Electron Microscopy 1994, Vols 3a and 3b - 1994

Structure of DnaB and DnaB.DnaC complex.

  • Carmen San Martín
  • Radermacher, M
  • Fedtke, B
  • Engel, A
  • Miles, CS
  • Dixon, NE
  • Jose Maria Carazo Garcia
... Ver más Contraer

Electron Microscopy 1998, Vol 1 - 1998

  • ORCID

Este autor no tiene patentes.

Open Access

Erratum: Crystal structure of a near-full-length archaeal MCM: Functional insights for an AAA+ hexameric helicase (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (2008) 23:51 (20191-20196))

  • Brewster A.
  • Wang G.
  • Yu X.
  • Greenleaf W.
  • Carazo J.
  • Tjajadi M.
  • Klein M.
  • Chen X.
... Ver más Contraer

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA - 7/4/2009

Número de citas: 1 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • Factor Impacto JCR: 9,432 (2009)
  • CiteScore: 16,2 (2020)
  • SJR: 7,025 (2009)
  • SNIP: 2,563 (2009)
  • Impacto JCR a 5 años: 10,312
  • Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  • Categorías SJR: Multidisciplinary (Q1)
Open Access

ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M.
  • Sorzano C.O.S.
  • Carazo J.M.
  • Georges A.d.
  • Abrishami V.
  • Vargas J.

Progress In Biophysics & Molecular Biology - 1/09/2021

10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001

Número de citas: 2 (Web of Science) 1 (Scopus)
  • Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
  • CiteScore: 5,8 (2020)
  • SJR: 0,859 (2020)
  • SNIP: 0,995 (2020)
  • Impacto JCR a 5 años: 3,907
  • Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY

ENRICH: a fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions

  • Kazemi M
  • Sorzano COS
  • Des Georges A
  • Carazo JM
  • Vargas J

08/2018

10.1101/400317

  • ORCID

Dynamic Kinetochore Size Regulation Promotes Microtubule Capture And Chromosome Biorientation In Mitosis

  • Sacristan C
  • Ahmad M
  • Keller J
  • Fermie J
  • Groenewold V
  • Tromer E
  • Fish A
  • Melero R
  • Carazo JM
  • Klumperman J
  • Musacchio A
  • Perrakis A
  • Kops GJ
... Ver más Contraer

03/2018

10.1101/279398

  • ORCID

DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing

  • Ruben Sanchez Garcia
  • Josue Gomez-Blanco
  • Ana Cuervo
  • Jose Maria Carazo
  • Carlos Oscar S Sorzano
  • Javier Vargas

13/06/2020

10.1101/2020.06.12.148296

  • ORCID

A variant to the \'random approximation\' of the reference-free alignment algorithm

  • Marco S.
  • Chagoyen M.
  • De La Fraga L.
  • Carazo J.
  • Carrascosa J.

Ultramicroscopy - 1/11/1996

10.1016/s0304-3991(96)00083-6

Número de citas: 62 (Scopus)
  • CiteScore: 5 (2020)

Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps.

  • Ramirez-Aportela E
  • Vilas JL
  • Melero R
  • Conesa P
  • Martinez M
  • Maluenda D
  • Mota J
  • Jimenez A
  • Vargas J
  • Marabini R
  • Carazo JM
  • Sorzano COS
... Ver más Contraer

10/2018

10.1101/433284

  • ORCID
Open Access

Accessing Information on the Conformational Flexibility of Molecular Machines

  • Carazo, JM

Structure - 1/02/2004

10.1016/j.str.2004.01.017

Número de citas: 3 (Web of Science) 4 (Scopus)
  • Cuartil SJR: Q1
  • CiteScore: 9 (2020)
  • SJR: 4,47 (2004)
  • SNIP: 1,507 (2004)
  • Categorías SJR: Molecular Biology (Q1); Structural Biology (Q1)

Scopus: 52

Web of Science: 54

Scopus: 178

Web of Science: 192

Última actualización de los datos: 4/05/24 4:57
Próxima recolección programada: 11/05/24 3:00