Carazo García, José María Autor
Advances in xmipp for cryo–electron microscopy: From xmipp to scipion
- Strelak D.
- Jiménez-Moreno A.
- Vilas J.L.
- Ramírez-Aportela E.
- Sánchez-García R.
- Maluenda D.
- Vargas J.
- Herreros D.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.P.
- Horacek J.
- Myska D.
- Horacek M.
- Conesa P.
- Fonseca-Reyna Y.C.
- Jiménez J.
- Martínez M.
- Harastani M.
- Jonić S.
- Filipovic J.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
MOLECULES - 1/10/2021
- Factor Impacto JCR: 4,927 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 5,11
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
ENRICH: A fast method to improve the quality of flexible macromolecular reconstructions
- Kazemi M.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
- Georges A.d.
- Abrishami V.
- Vargas J.
PROGRESS IN BIOPHYSICS and MOLECULAR BIOLOGY - 1/1/2021
10.1016/j.pbiomolbio.2021.01.001
- Factor Impacto JCR: 4,799 (2021)
- CiteScore: 5,8 (2020)
- SJR: 0,859 (2020)
- SNIP: 0,995 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 3,907
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
3DBionotes COVID-19 Edition.
- Macias JR
- Sanchez-Garcia R
- Conesa P
- Ramirez-Aportela E
- Martinez Gonzalez M
- Wert-Carvajal C
- Parra-Perez AM
- Segura Mora J
- Horrell S
- Thorn A
- Carazo JM
Bioinformatics (Oxford, England) - 15/05/2021
10.1093/bioinformatics/btab397
- ORCID
- Web of Science
Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion
- Martínez M.
- Jiménez-Moreno A.
- Maluenda D.
- Ramírez-Aportela E.
- Melero R.
- Cuervo A.
- Conesa P.
- Del Caño L.
- Fonseca Y.C.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Conesa J.J.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro F.
- Sorzano C.O.S.
- Carazo J.M.
- Marabini R.
Journal of Chemical Information and Modeling - 26/5/2020
- Factor Impacto JCR: 4,956 (2020)
- CiteScore: 6,4 (2020)
- SJR: 1,24 (2020)
- SNIP: 1,295 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 5,39
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Ribosome-associated vesicles: A dynamic subcompartment of the endoplasmic reticulum in secretory cells
- Carter S.D.
- Hampton C.M.
- Langlois R.
- Melero R.
- Farino Z.J.
- Calderon M.J.
- Li W.
- Wallace C.T.
- Tran N.H.
- Grassucci R.A.
- Siegmund S.E.
- Pemberton J.
- Morgenstern T.J.
- Eisenman L.
- Aguilar J.I.
- Greenberg N.L.
- Levy E.S.
- Yi E.
- Mitchell W.G.
- Rice W.J.
- Wigge C.
- Pilli J.
- George E.W.
- Aslanoglou D.
- Courel M.
- Freyberg R.J.
- Javitch J.A.
- Wills Z.P.
- Area-Gomez E.
- Shiva S.
- Bartolini F.
- Volchuk A.
- Murray S.A.
- Aridor M.
- Fish K.N.
- Walter P.
- Balla T.
- Fass D.
- Wolf S.G.
- Watkins S.C.
- Carazo J.M.
- Jensen G.J.
- Frank J.
- Freyberg Z.
Science Advances - 1/4/2020
- Cuartil JCR: Q1 (2020)
- Factor Impacto JCR: 14,143 (2022)
- Impacto Normalizado por Categoría: 1,359 (2020)
- CiteScore: 16,6 (2020)
- SJR: 5,928 (2020)
- SNIP: 3,445 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 16,45
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Re-examining the spectra of macromolecules. Current practice of spectral quasi B-factor flattening
- Vilas J.L.
- Vargas J.
- Martinez M.
- Ramirez-Aportela E.
- Melero R.
- Jimenez-Moreno A.
- Garduño E.
- Conesa P.
- Marabini R.
- Maluenda D.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
Journal of Structural Biology - 1/3/2020
- Cuartil SJR: Q2
- Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
- CiteScore: 5,5 (2020)
- SJR: 2,564 (2020)
- SNIP: 1,018 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,474
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q2)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps
- Ramírez-Aportela E.
- Vilas J.
- Glukhova A.
- Melero R.
- Conesa P.
- Martínez M.
- Maluenda D.
- Mota J.
- Jiménez A.
- Vargas J.
- Marabini R.
- Sexton P.
- Carazo J.
- Sorzano C.
BIOINFORMATICS - 1/2/2020
- Factor Impacto JCR: 6,937 (2020)
- CiteScore: 9,9 (2020)
- SJR: 3,599 (2020)
- SNIP: 2,056 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 8,47
- Categorías JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Measuring local-directional resolution and local anisotropy in cryo-EM maps
- Jose Luis Vilas
- Hemant D. Tagare
- Javier Vargas
- Jose Maria Carazo
- Carlos Oscar S. Sorzano
Nature Communications - 1/12/2020
- Factor Impacto JCR: 14,919 (2020)
- CiteScore: 20 (2020)
- SJR: 5,559 (2020)
- SNIP: 3,055 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 15,805
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Continuous flexibility analysis of SARS-CoV-2 spike prefusion structures
- Melero R.
- Sorzano C.O.S.
- Foster B.
- Vilas J.L.
- Martínez M.
- Marabini R.
- Ramiacute;rez-Aportela E.
- Sanchez-Garcia R.
- Herreros D.
- Del Caño L.
- Losana P.
- Fonseca-Reyna Y.C.
- Conesa P.
- Wrapp D.
- Chacon P.
- McLellan J.S.
- Tagare H.D.
- Carazo J.M.
IUCrJ - 1/11/2020
- Factor Impacto JCR: 4,769 (2020)
- CiteScore: 8,1 (2020)
- SJR: 2,832 (2020)
- SNIP: 1,565 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 5,75
- Categorías JCR: CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Local resolution estimates of cryoEM reconstructions
- Vilas J.L.
- Heymann J.B.
- Tagare H.D.
- Ramirez-Aportela E.
- Carazo J.M.
- Sorzano C.O.S.
Current Opinion in Structural Biology - 1/10/2020
- Cuartil SJR: Q1
- Factor Impacto JCR: 6,809 (2020)
- CiteScore: 12,4 (2020)
- SJR: 3,935 (2020)
- SNIP: 1,459 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 7,045
- Categorías JCR: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q1); Molecular Biology (Q1)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
- Sorzano C.O.S.
- Jiménez-Moreno A.
- Maluenda D.
- Ramírez-Aportela E.
- Martínez M.
- Cuervo A.
- Melero R.
- Conesa J.J.
- Sánchez-García R.
- Strelak D.
- Filipovic J.
- Fernández-Giménez E.
- de Isidro-Gómez F.
- Herreros D.
- Conesa P.
- del Caño L.
- Fonseca Y.
- de la Morena J.J.
- Macías J.R.
- Losana P.
- Marabini R.
- Carazo J.M.
Methods in Molecular Biology - 1/1/2021
- Cuartil JCR: Q2 (2021)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,595 (2021)
- CiteScore: 2,2 (2020)
- SJR: 0,711 (2020)
- SNIP: 0,57 (2020)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Soft X-ray tomography imaging for biological samples
- Otón J.
- Sorzano C.
- Chichón F.
- Carrascosa J.
- Carazo J.
- Marabini R.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,156 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Interchanging geometry conventions in 3DEM: Mathematical context for the development of standards
- Sorzano C.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Otón J.
- Cuenca-Alba J.
- Quintana A.
- de la Rosa-Trevín J.
- Carazo J.
Applied and Numerical Harmonic Analysis - 1/1/2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 0,312 (2014)
- CiteScore: 0,8 (2020)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
AN INTRODUCTION TO MAXIMUM-LIKELIHOOD METHODS IN CRYO-EM
- Sigworth, Fred J.
- Doerschuk, Peter C.
- Carazo, Jose-Maria
- Scheres, Sjors H. W.
- Jensen, GJ
Methods in Enzymology - 1/1/2010
- Factor Impacto JCR: 1,626 (2010)
- CiteScore: 2,6 (2020)
- SJR: 1,408 (2010)
- SNIP: 0,493 (2010)
- Impacto JCR a 5 años: 2,185
- Categorías JCR: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Exploring the conformational flexibility of molecular machines
- Sjors Scheres
- Herman, Gabor T.
- Jose Maria Carazo Garcia
Mathematical Methods In Biomedical Imaging and Intensity-modulated Radiation Therapy (imrt) - 2008
- ORCID
Algorithms for three-dimensional reconstruction from the imperfect projection data provided by electron microscopy
- Carazo J.
- Herman G.
- Sorzano C.
- Marabini R.
Electron Tomography: Methods for Three-Dimensional Visualization of Structures in the Cell - 1/1/2006
- Scopus
- ORCID
Evolutionary genomics of SARS-CoV-2: key for viral success
44º Congreso Nacional de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular - 2022
- ORCID
The role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the spike A222V mutation
Xx Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica - 2022
- ORCID
Scipion for tomography: An expansion of Scipion software framework towards integration, reproducibility and validation in cryo-electron tomography
- Federico P. de Isidro-Gómez
- de la Morena, Jorge Jimenez
- Pablo Conesa Mingo
- David Herreros
- Fernandez-Gimenez, Estrella
- Fonseca, Yunior C.
- Strelak, David
- J.J. Conesa
- Ana Cuervo
- Patricia Losana
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 08/2021
- ORCID
FSC-Q: A method for quality analysis of cryoEM-derived models
- Erney Ramírez-Aportela
- David Maluenda Niubó
- Fonseca, Yunior C.
- Pablo Conesa Mingo
- Roberto Marabini
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo Garcia
Acta Crystallographica Section A - Foundation and Advances - 08/2021
- ORCID
Oligomeric self-assembly of a coiled-coil-based bipyramidal protein cage
- Lapenta, F.
- Aupic, J.
- Vezzoli, M.
- Strmsek, Z.
- Da Vela, S.
- Svergun, D. I.
- Jose Maria Carazo Garcia
- Roberto Melero
- Jerala, R.
Febs Open Bio - 07/2021
- ORCID
Mesa redonda sobre investigadores y Ciencia Abierta
5as Jornadas de Análisis de la Red de Bibliotecas y Archivos del Csic. Bibliotecas y Archivos del Csic Por la Ciencia Abierta: Presente y Futuro - 2019
- ORCID
Analysing cryoEM data quality in the post resolution revolution era: Validity criteria
- Jose Maria Carazo Garcia
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- ORCID
Towards High Throughput cryoEM data acquisition and processing, assuring reproducibility
- Jose Maria Carazo Garcia
European Biophysics Journal With Biophysics Letters - 07/2019
- ORCID
Outlier detection for single particle analysis in Electron Microscopy
- Sorzano, C. O. S.
- Vargas, J.
- de la Rosa-Trevin, J. M.
- Zaldivar-Peraza, A.
- Oton, J.
- Abrishami, V.
- Foche, I.
- Marabini, R.
- Caffarena, G.
- Carazo, J. M.
- Ortuno, F
- Rojas, I
PROCEEDINGS IWBBIO 2014: INTERNATIONAL WORK-CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOMEDICAL ENGINEERING, VOLS 1 AND 2 - 2014
- Cuartil JCR: Q2 (2014)
- Impacto Normalizado por Categoría: 3,192 (2014)
- ORCID
- Web of Science
AN IMAGE PROCESSING APPROACH TO THE SIMULATION OF ELECTRON MICROSCOPY VOLUMES OF ATOMIC STRUCTURES
- Sorzano, C.O.S.
- Vargas, J.
- Oton, J.
- Abrishami, V.
- De La Rosa-Trevin, J.M.
- Del Riego, S.
- Fernandez-Alderete, A.
- Martinez-Rey, C.
- Marabini, R.
- Carazo, J.M.
2014 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON IMAGE PROCESSING (ICIP) - 28/1/2014
10.1109/icip.2014.7025420 Ver en origen
- Categorías SJR: Computer Vision and Pattern Recognition
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Este autor no tiene patentes.
Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing
- James Michael Krieger
- Carlos Oscar S. Sorzano
- Jose Maria Carazo
International Journal of Molecular Sciences - 10/08/2023
- CiteScore: 7,8 (2022)
- SJR: 1,154 (2022)
- SNIP: 1,263 (2022)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Erratum: Image processing tools for the validation of CryoEM maps (Faraday Discussions (2022) DOI: 10.1039/D2FD00059H)
- Sorzano C.O.S.
- Vilas J.L.
- Ramírez-Aportela E.
- Krieger J.
- Del Hoyo D.
- Herreros D.
- Fernandez-Giménez E.
- Marchán D.
- De Isidro Gómez F.
- Macías J.R.
- Sánchez I.
- Del Caño L.
- Fonseca-Reyna Y.
- Conesa P.
- García-Mena A.
- Burguet J.
- García Condado J.
- Méndez García J.
- Martínez M.
- Muñoz-Barrutia A.
- Marabini R.
- Vargas J.
- Carazo J.M.
FARADAY DISCUSSIONS - 11/11/2022
- Factor Impacto JCR: 3,4 (2022)
- Impacto JCR a 5 años: 3,4
- Categorías JCR: CHEMISTRY, PHYSICAL
Erratum: The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation (PLoS Pathog (2022) 18:7 (e1010631) DOI: 10.1371/journal.ppat.1010631)
- Ginex T.
- Marco-Marín C.
- Wieczór M.
- Mata C.
- Krieger J.
- Ruiz-Rodriguez P.
- López-Redondo M.L.
- Francés-Gómez C.
- Melero R.
- Sánchez-Sorzano C.Ó.
- Martínez M.
- Gougeard N.
- Forcada-Nadal A.
- Zamora-Caballero S.
- Gozalbo-Rovira R.
- Sanz-Frasquet C.
- Arranz R.
- Bravo J.
- Rubio V.
- Marina A.
- Geller R.
- Comas I.
- Gil C.
- Coscolla M.
- Orozco M.
- Llácer J.L.
- Carazo J.M.
PLoS Pathogens - 1/11/2022
- Factor Impacto JCR: 6,7 (2022)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 6,7
- Categorías JCR: VIROLOGY
The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: the case of the spike A222V mutation
- Tiziana Ginex
- Clara Marco-Marín
- Miłosz Wieczór
- Carlos P. Mata
- James Krieger
- Maria Luisa López-Redondo
- Clara Francés-Gómez
- Paula Ruiz-Rodriguez
- Roberto Melero
- Carlos Óscar Sánchez-Sorzano
- Marta Martínez
- Nadine Gougeard
- Alicia Forcada-Nadal
- Sara Zamora-Caballero
- Roberto Gozalbo-Rovira
- Carla Sanz-Frasquet
- Jeronimo Bravo
- Vicente Rubio
- Alberto Marina
- Ron Geller
- Iñaki Comas
- Carmen Gil
- Mireia Coscolla
- Modesto Orozco
- José Luis Llácer
- José-Maria Carazo
PLoS Pathogens - 7/12/2021
- Factor Impacto JCR: 7,464 (2021)
- CiteScore: 10,5 (2021)
- SJR: 2,596 (2021)
- SNIP: 1,618 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 7,913
- Categorías JCR: VIROLOGY
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Author Correction: Self-assembly and regulation of protein cages from pre-organised coiled-coil modules (Nature Communications, (2021), 12, 1, (939), 10.1038/s41467-021-21184-6)
- Lapenta F.
- Aupič J.
- Vezzoli M.
- Strmšek Ž.
- Da Vela S.
- Svergun D.I.
- Carazo J.M.
- Melero R.
- Jerala R.
Nature Communications - 1/12/2021
- Factor Impacto JCR: 17,694 (2021)
- Impacto JCR a 5 años: 17,764
- Categorías JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
- Scopus
- ORCID
Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19
- Sorzano co
- Crisman E
- Carazo JM
- leon r
17/07/2020
- ORCID
DeepEMhancer: a deep learning solution for cryo-EM volume post-processing
- Ruben Sanchez Garcia
- Josue Gomez-Blanco
- Ana Cuervo
- Jose Maria Carazo
- Carlos Oscar S Sorzano
- Javier Vargas
13/06/2020
- ORCID
FSC-Q: A CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier Shell Correlation
- Ramírez-Aportela E
- Maluenda D
- Fonseca YC
- Conesa P
- Marabini R
- Heymann JB
- Carazo JM
- Sorzano COS
05/2020
- ORCID
Improvements on marker-free images alignment for electron tomography
- C.O.S. Sorzano
- F. de Isidro-Gómez
- E. Fernández-Giménez
- D. Herreros
- S. Marco
- J.M. Carazo
- C. Messaoudi
Journal of Structural Biology: X - 24/05/2020
- Cuartil SJR: Q4
- Factor Impacto JCR: 2,867 (2020)
- Impacto JCR a 5 años: 4,474
- Categorías JCR: CELL BIOLOGY
- Categorías SJR: Structural Biology (Q4)
- Scopus
- ORCID
- Web of Science
Índice h
Scopus: 52
Web of Science: 54
Índice i10
Scopus: 178
Web of Science: 192
Perfiles de autor
-
ORCID
-
Web of Science ResearcherID
-
Scopus Author ID
-
Dialnet id
Proyectos de investigación en la UAL
-
Acrónimo 99109Desde: 2 de junio de 1999Hasta: 2 de junio de 2000Financiado por: Ministerio de Asuntos ExterioresImporte de financiación: 19.232,39 EURRol: Investigador